New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 1246762 | 79 (0.630) | intergenic (+157/‑214) | PP_1087/argG | OmpA family outer membrane protein/argininosuccinate synthase |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TCGGTGCATGTCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCTTTGTCGTCAGAAGCTGTCGCC > NC_002947/1246613‑1246907 | tCGGTGCATGTCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTggcg < 1:3737903/150‑1 (MQ=255) gTGCATGTCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGgcg < 1:1474315‑M2/150‑4 (MQ=255) gTGCATGTCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCAGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGgcg > 1:4122008‑M2/1‑147 (MQ=255) 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tGTCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGgcgctcga > 1:2014921‑M2/1‑142 (MQ=255) tCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGgcgctcgatc < 2:4599988‑M2/150‑11 (MQ=255) tCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGgcgctcgatc < 2:4939808‑M2/150‑11 (MQ=255) tCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGgcgctcgatc < 2:3452631‑M2/150‑11 (MQ=255) tCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCAGTGAGAGAGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCAGAGGCGCTCGATATCACAGGCGCAGTATGTCTTGAGGTGGGCACCAGGCGgcgcgcgatc < 1:2290865‑M2/150‑11 (MQ=255) 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ctcACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGaaa < 1:2496731/150‑1 (MQ=255) agatcgagcgcagaatgtTTCGAGGCGGACACCTGA‑Ggcgctcgatctcacaggcgctgaaaatgttgtgacgaacccctggcggccttgatgcgagcccatgacatgcaccgaccagatctcagggcgccttcgcccccgggacgcccg < 1:4466465‑M2/143‑114 (MQ=255) tcACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAg > 1:4826173/1‑150 (MQ=255) tcACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAg > 1:3144898/1‑150 (MQ=255) gatcgagcgcagaatgTTTCGAGGCGGACACCTGA‑Ggcgctcgatctcacaggcgcagaaaatgttgtgacgaacccctggcggccttgatgcgagcccatgacatgcaccgaccagatctcagggcgccttcgcccccgggacgcccga < 2:1354323‑M2/144‑115 (MQ=255) acaGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGtt > 1:2353639/1‑150 (MQ=255) caGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTc < 2:1924652/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCt < 2:1878478/150‑1 (MQ=255) gcgcAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTg > 2:3739813/1‑150 (MQ=255) gcAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTc > 1:1744970/1‑150 (MQ=255) gcAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTc > 2:707454/1‑150 (MQ=255) aGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGc < 2:1960434/150‑1 (MQ=255) aGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGc > 1:1232114/1‑150 (MQ=255) aTGTTTCGAGGCGGACACCTGA‑Ggcgctcgatctcacaggcgctgaaaatgttgtgacgaacccctggcggccttgatgcgagcccatgacatgcaccgaccagatctcagggcgccttcgcccccgggacgcccgaggcaggtgcaaca < 1:4223187‑M2/150‑128 (MQ=255) aTGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCttt < 2:3666635/150‑1 (MQ=255) aTGTCTTGAGGGGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCttt < 2:632977/150‑1 (MQ=255) cTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCTTTgtcg > 1:4523489/1‑150 (MQ=255) tGAGGTGGACACCTGGCGgcgctcgatctcacaggcgctgaaaatgttgtgacgaacccctggcggccttgatgcgagcccatgacatgcaccgaccagatctcagggcgccttcgcccccgggacgcccgaggcaggtgcaacacccgg < 2:5079015‑M2/150‑133 (MQ=255) tGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCTTTgtcgtc < 2:2491162/150‑1 (MQ=255) gTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCTTTGTCGTCAGaa < 1:290043/150‑1 (MQ=255) acCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCTTTGTCGTCAGAAGCTGTc < 2:84755/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCTTTGTCGTCAGAAGCTGTCGc < 1:1529172/150‑1 (MQ=255) | TCGGTGCATGTCATGGGCTCGCATCAAGGCCGCCAGGGGTTCGTCACAACATTTTCAGCGCCTGTGAGATCGAGCGCAGAATGTTTCGAGGCGGACACCTGAGGCGCTCGATCTCACAGGCGCAGAATGTCTTGAGGTGGACACCTGGCGGCGCTCGATCTCACAGGCGCTGAACTCCTCAAGGCATGCACGCTGCGGCTCGACGCCCCTCCAAGGTCCTCATGCCACATCCCTCAACCTACCGCCCGTCGCCCCTACGAAAGTTCCTGTCGCTTTGTCGTCAGAAGCTGTCGCC > NC_002947/1246613‑1246907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |