New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3015689 | 134 (0.880) | 7 (0.050) | 3/256 | NT | 5.0% | coding (256/2610 nt) | bcsA | cellulose synthase and translocator subunit |
? | NC_002947 | = 3015732 | 140 (0.990) | coding (299/2610 nt) | bcsA | cellulose synthase and translocator subunit |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
CCAACGCCTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGTTTGCCCGGCG > NC_002947/3015583‑3015879 | ccAACGCCTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCAt > 2:1898948/1‑150 (MQ=255) ccAACGCCTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCAt > 2:3624264/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATgc < 2:3905396‑M2/150‑3 (MQ=255) aaCGCCTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCAGTGGGCGCGGTGCGCATgc < 2:4898700‑M2/150‑3 (MQ=255) gCCTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCCACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATgcacc < 2:3086153‑M2/150‑6 (MQ=255) cTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATgcacctg > 2:4242958‑M2/1‑143 (MQ=255) cTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATgcacctg > 1:3250989‑M2/1‑143 (MQ=255) cTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATgcacctg < 2:4774318‑M2/150‑8 (MQ=255) cccGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTgcgggc > 1:2890437/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTgcgggc > 2:420139/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTgcgggcg > 1:1668416/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTgcgggcg < 1:3109509/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTgcgggcg > 1:3256533/1‑150 (MQ=255) cccaggggCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGggcggc > 1:2079831/7‑150 (MQ=255) cTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGc > 1:1585313/1‑150 (MQ=255) cTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGc > 1:4166155/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCg > 1:1650949/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGGTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCCGGTGCGTCCAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCCTGGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCg > 2:2725840/1‑150 (MQ=255) 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aGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGgcgc < 2:3469424/150‑1 (MQ=255) aGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGgcgc < 2:1157337/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGACGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGgcgcg > 1:4300979/1‑150 (MQ=255) gcCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGcc > 2:456957/1‑150 (MQ=255) cccGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCa > 2:2441958/1‑150 (MQ=255) 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gTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAacac < 1:1825674/150‑1 (MQ=255) gTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCGACCGCGCCAGTGCTTTCAAacac < 2:705497/150‑1 (MQ=255) tGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACAcc < 1:2403250/150‑1 (MQ=255) gTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAgg > 2:1547833/1‑150 (MQ=255) aCAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGcc > 2:1965152/1‑150 (MQ=255) aCAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGcc > 1:3401638/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCgg > 2:4523055/1‑150 (MQ=255) aaGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGc > 2:2222370/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCAc < 2:2474294/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGc > 1:4417131/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGcc > 1:3580628/1‑150 (MQ=255) cgcgCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGc > 2:3564007/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCAGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGcc > 2:3526670/1‑150 (MQ=255) gcgcATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGcc > 1:2677883/1‑150 (MQ=255) cgcATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCt < 1:3188119/150‑1 (MQ=255) gggCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCgt < 2:2140744/150‑1 (MQ=255) gggCGCGGGGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCgt < 1:3624264/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCgtg > 2:1036163/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCgtgt < 1:2822915/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGttt > 2:5117332/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGttt < 1:8476/150‑1 (MQ=255) tGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGTTTGccc < 1:3884700/150‑1 (MQ=255) gcATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGTTTGCCcggc > 2:2003642/1‑150 (MQ=255) gcATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGTTTGCCcggc < 2:3942331/150‑1 (MQ=255) gcATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGAGCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCGGTCAAACACCAGGCCTCGGCCCGCCTGCGCGGCCTGAGCGGGGTTGCCcggc > 2:3798548/1‑150 (MQ=255) cATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGTTTGCCcggcg < 2:2582881/150‑1 (MQ=255) | CCAACGCCTGTACCCGCAGCTGGCGGGCAAGCGCCCGACCCTGGGTGACCCGCTGCGTCTGTTGATCCAGAGCCTGTGGTTGTTGCTGCGGCGCCAACCGCAGGTGCGTACAGCAAGGCCTGGCCGCCGCGCATTGGGCGCGGTGCGCATGCACCTGCGGGCGGCAGGCGGGGTGGCGCGCCACTACCGCGGCCTGCTGATCGATGCATTGCAACAGGTACCCGCGCGCTACCGCGCCAGTGCTTTCAAACACCAGGCCTCGGCACGCCTGCGCGGCCTGAGCGTGTTTGCCCGGCG > NC_002947/3015583‑3015879 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |