| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4539515 = | NA (NA) | 24 (0.160) | 9/266 | NT | 69.4% | coding (884/1533 nt) | PP_4025 | transposase |
| ? | NC_002947 | = 4628624 | 11 (0.070) | coding (848/1533 nt) | PP_4091 | transposase | |||||
GACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGAACAGCACGACTTGTCGATCAGGCGGGCCACTGGCCTGCACCCACATCCAGGATTGACTGGTCGGATCACGATCCGGCTCTTTGAGCACCTGCACGCGAGTTTCATCGCAATGGATCACCGGGCTTTCCAGCAGGCGG > NC_002947/4628476‑4628773 | gacgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggt < 2:3224796/150‑1 (MQ=32) acgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtg < 2:2802671/150‑1 (MQ=32) acgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtg < 2:2802685/150‑1 (MQ=32) acgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtg < 1:2291273/150‑1 (MQ=32) acgaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCtggtg < 1:2528255/150‑1 (MQ=32) gaATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTggtggt < 1:2329330/150‑1 (MQ=32) tttACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTa < 2:3859674/150‑1 (MQ=32) ttACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTaa < 2:3439273/150‑1 (MQ=32) 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ccGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGaa < 1:1087344/150‑1 (MQ=32) ccGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGGTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGaa < 1:646973/150‑1 (MQ=17) gAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTACGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGAACa < 2:148389/150‑1 (MQ=14) aaCATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGAACAg < 1:995561/150‑1 (MQ=11) gTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggtgggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgc < 2:2009539‑M2/150‑90 (MQ=255) 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ccTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtgggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcg < 1:100168‑M2/150‑112 (MQ=255) ccTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgttcggcgtaaattcg < 2:1773208‑M2/150‑112 (MQ=255) ccTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcg < 2:1604998‑M2/150‑112 (MQ=255) ccTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcg < 2:1335069‑M2/150‑112 (MQ=255) cTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtgggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:3533935‑M2/150‑113 (MQ=255) cTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGC‑CTGCTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtc < 1:4884874‑M2/150‑114 (MQ=255) tCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggtgggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattc < 1:2228640‑M2/150‑114 (MQ=255) tCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgttcggcgtaaattc < 2:583668‑M2/150‑114 (MQ=255) tCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgttcggcgtaaattc < 2:2080166‑M2/150‑114 (MQ=255) tCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattc < 1:3964826‑M2/150‑114 (MQ=255) tCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattc < 1:3964933‑M2/150‑114 (MQ=255) tCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattc < 1:3975802‑M2/150‑114 (MQ=255) tCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattc < 1:3975937‑M2/150‑114 (MQ=255) ccAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCTCGCGGCTGGgtgagggctatcgcggtaacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaccgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtacattcg < 2:134197‑M2/150‑115 (MQ=255) cagcagGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgt < 1:3384171‑M2/150‑116 (MQ=255) agcagGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGtggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgttcggcgtaaattcgtc < 1:2282390‑M2/150‑117 (MQ=255) gcagGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaag < 1:4640878‑M2/150‑118 (MQ=255) gcagGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaag < 1:3521141‑M2/150‑118 (MQ=255) gCTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagag > 2:2191339‑M2/1‑5 (MQ=255) cTGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagc < 2:4243681‑M2/150‑147 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggccagagcg < 1:3715774‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg > 1:3695731‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 1:1085114‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 2:3665180‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 1:3169700‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg > 2:3094019‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 2:2742707‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 2:2324456‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 1:475218‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 2:1979202‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 2:1978945‑M2/150‑148 (MQ=255) tGGagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcg < 1:4945887‑M2/150‑148 (MQ=255) ggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcgg > 1:1697380‑M2/1‑2 (MQ=255) ggagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggagctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcgg < 1:1725535‑M2/150‑149 (MQ=255) gagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcggt < 2:3052608‑M2/150‑150 (MQ=255) gagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcggt > 2:2124799‑M2/1‑1 (MQ=255) gagggctatcgcggttacgtgatgaccgatgattacgccggttacaacgcgttggcgctacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcggt < 2:4367087‑M2/150‑150 (MQ=255) gagggcgatcgcggttacgtgatgaccgatgatgacgccggttacaacgcgttggcgcgacagccgggcgttgaacgactggcgtgcatggcgcatgtccggcgtaaattcgtcgaagcgcagaaggtgcagcctaagggcaagagcggt > 2:3363726‑M2/1‑1 (MQ=255) | GACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGGCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGTGTAATCGAACAGCACGACTTGTCGATCAGGCGGGCCACTGGCCTGCACCCACATCCAGGATTGACTGGTCGGATCACGATCCGGCTCTTTGAGCACCTGCACGCGAGTTTCATCGCAATGGATCACCGGGCTTTCCAGCAGGCGG > NC_002947/4628476‑4628773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |