| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,572,291 | T→A | 5.4% | L124* (TTG→TAG) ‡ | pcaB → | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,572,291 | 0 | T | A | 5.4% | 549.6 / 12.3 | 164 | L124* (TTG→TAG) ‡ | pcaB | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (70/84); new base A (4/5); total (74/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GGGCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCTTT > NC_002947/1572142‑1572438 | gggCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGAttt < 2:135408/150‑1 (MQ=255)gggCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGAttt < 2:2473877/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGa < 1:4761271/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGa < 1:4839416/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGa < 2:4656712/150‑1 (MQ=255) tCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACGTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAg > 1:2764547/1‑150 (MQ=255) tCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAg > 1:715001/1‑150 (MQ=255) cGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATCAAATCGAgg < 1:500951/150‑1 (MQ=255) ggCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGc < 1:3666126/150‑1 (MQ=255) ggCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGc > 1:2139727/1‑150 (MQ=255) gCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGcc > 2:4546985/1‑150 (MQ=255) gCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATCAAATCGAgggc < 2:4005950/150‑3 (MQ=255) gCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCgg > 2:2929370/1‑150 (MQ=255) tGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCa > 2:1318193/1‑150 (MQ=255) gAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCt > 2:387666/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTg > 2:2848929/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTg > 2:2848632/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTg > 2:3436949/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTg > 2:3436954/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTg > 1:2595800/1‑150 (MQ=255) aGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATGCCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGc < 1:4468251/150‑1 (MQ=255) aGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGc < 1:4468242/150‑1 (MQ=255) aGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGc < 2:111385/150‑1 (MQ=255) gCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGcc < 1:3304077/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATAcc < 2:487563/150‑1 (MQ=255) gCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATAccc < 1:4076769/150‑1 (MQ=255) cAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCt > 2:1169996/1‑150 (MQ=255) cccggCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCgca > 2:871965/5‑150 (MQ=255) aTCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCgcag < 1:1013884/150‑1 (MQ=255) tCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCgcagc > 2:4186457/1‑150 (MQ=255) tCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCgcagc < 1:2926868/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCgcagca < 2:715001/150‑1 (MQ=255) cGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCgcagca > 2:3797130/1‑150 (MQ=255) cGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCgcagca < 2:2595800/150‑1 (MQ=255) ccACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAgg > 2:2412314/1‑150 (MQ=255) ccGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCt < 1:516356/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCtt < 2:1007244/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGa < 1:1899613/150‑1 (MQ=255) cGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 1:3821207/150‑1 (MQ=255) cGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 1:1322754/150‑1 (MQ=255) cGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 1:2501586/150‑1 (MQ=255) cGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 1:2521623/150‑1 (MQ=255) cGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 1:5090908/150‑1 (MQ=255) gTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAg < 1:2795429/150‑1 (MQ=255) tGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGc > 2:4754482/1‑150 (MQ=255) agGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCg < 2:317842/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATa > 1:2118517/1‑150 (MQ=255) tATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtg < 2:3194482/150‑1 (MQ=255) tATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtg < 2:1234497/150‑1 (MQ=255) tATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtg < 2:568031/150‑1 (MQ=255) tATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtg < 2:4853434/150‑1 (MQ=255) tgtgCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggt < 1:3295774/150‑1 (MQ=255) gtgCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggtg > 1:2382857/1‑150 (MQ=255) gtgCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggtg > 1:2382855/1‑150 (MQ=255) tgCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggtgg > 2:1610773/1‑150 (MQ=255) tgCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggtgg < 1:1791351/150‑1 (MQ=255) cACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGt < 2:4073730/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATTGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCg < 1:1005161/150‑1 (MQ=255) caccaGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGtt < 2:663143/150‑1 (MQ=255) caccaGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGtt > 1:2474109/1‑150 (MQ=255) accaGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTg < 1:1958682/150‑1 (MQ=255) ccagGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAaca < 1:202409/150‑1 (MQ=255) cagGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAacac < 2:3362153/150‑1 (MQ=255) gATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGcc < 2:911705/150‑1 (MQ=255) gATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCAcccc > 2:1758474/1‑150 (MQ=255) gATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCAcccc > 2:1758351/1‑150 (MQ=255) aTGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCg > 2:4203948/1‑150 (MQ=255) ggATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGt < 1:1557096/150‑1 (MQ=255) ggATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGt < 1:1557407/150‑1 (MQ=255) gATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATATGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTg > 2:4428681/1‑150 (MQ=255) tACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGAc > 2:2372391/1‑150 (MQ=255) ggTCTGGTTCTTCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGACCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATCCGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTg < 2:4502357/150‑1 (MQ=255) ggTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTg < 2:5062696/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTggg < 1:1097380/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCAt < 2:2370483/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCAt > 1:940414/1‑150 (MQ=255) gTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTgg < 1:4646630/117‑1 (MQ=255) cAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTg < 1:808781/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTgg < 1:1632420/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGATGCCCTCGAGTTGATCGAGGCCGACCTCGGCACGCTGGCCGATACCCGGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATCCGCCCTTGGTGGGTCGTACCGGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCGGGGCATGAAACTGGcc > 2:4446165/1‑150 (MQ=255) gATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTa > 2:4619384/1‑150 (MQ=255) cccTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTgg > 2:143786/1‑150 (MQ=255) cccTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCAGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTgg > 1:1434709/1‑150 (MQ=255) cccTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCGTGGTGGGTCGTACCGGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTgg > 2:1233449/1‑150 (MQ=255) cccTCGATCAAATCGAGGCCGACCTCGGCACGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCACGCCTTGAAGCACGCCGAAACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGCAGTACTgg > 2:3927690/1‑150 (MQ=255) ccTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTggg < 2:2764547/150‑1 (MQ=255) ccTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTggg > 2:4187977/1‑150 (MQ=255) ccTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTggg > 2:5114873/1‑150 (MQ=255) cTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGt > 2:543885/1‑150 (MQ=255) cTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGt > 1:3782852/1‑150 (MQ=255) cTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGt > 1:1407538/1‑150 (MQ=255) tCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTgg < 1:3719122/147‑1 (MQ=255) tCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTgg > 2:3719122/1‑147 (MQ=255) tCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTg > 2:92654/1‑150 (MQ=255) tCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTg > 2:935422/1‑150 (MQ=255) cGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGc < 2:3477435/150‑1 (MQ=255) gATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCt > 1:3478716/1‑150 (MQ=255) aTTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCtt < 2:2139727/150‑1 (MQ=255) aTTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCtt < 1:4523690/150‑1 (MQ=255) tttGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCttt > 1:3885124/1‑150 (MQ=255) | GGGCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCAAGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCTTT > NC_002947/1572142‑1572438 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |