| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,797,386 | 0 | G | C | 6.7% | 646.7 / 21.1 | 198 | K15N (AAG→AAC) | lpxA | acyl‑[acyl‑carrier‑protein]‑‑UDP‑N‑ acetylglucosamine O‑acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (83/100); new base C (7/7); total (91/107) | |||||||||||
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Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
CAAGTTCCTCAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGCTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGAT > NC_002947/1797237‑1797532 | cAAGTTCCTCAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAg > 1:4917228/1‑150 (MQ=255)cAAGTTCCTCAGACGTAAAAGCATGAACAGGAAGTGCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGACGGTCTGCTCGGCAGAAATCAACTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATACGATTGAAACTCGGGACATTATCGATCCGACGGCCAAg > 1:1806015/1‑150 (MQ=255) aaGTTCCTCAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGc > 2:4125572/1‑150 (MQ=255) 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cGTCGGCCAAGCTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTAGGTCGATCGTTGGCCCTCATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGtttt > 1:737060/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCAGCTTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTa > 2:4070794/1‑83 (MQ=255) gTCGGCCAGCTTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTa > 2:4070361/1‑83 (MQ=255) gTCGGCCAGCTTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTa < 1:4070794/83‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCTTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTa < 1:4070361/83‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCTTGGCCGACGGAGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGTTGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTc > 2:2481358/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCAAGCTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTc < 2:3723386/150‑1 (MQ=255) 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CAAGTTCCTCAGCCGTAAAAGCATGATCTGGAAGTTCGAGTGCCGCGCCCTTGTCGATGGCAAGCCGGTCTGCTCGGCAGAAATCACCTGCGCGGAACGCTCCCTATGAATTCGATTGATCCTCGGGCCATTATCGATCCGTCGGCCAAGCTGGCCGACGGCGTCGAGGTCGGCCCTTGGTCGATCGTTGGCCCTGATGTAGAAATCGGGGAGGGCACCGTTATCGGCCCGCATGTTGTGCTCAAAGGCCCGACCCGCATCGGCAAGCACAACCGTATCTTTCAGTTTTCCTCGAT > NC_002947/1797237‑1797532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |