Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,755,531 | 0 | A | G | 5.1% | 501.5 / 9.9 | 157 | S375G (AGC→GGC) | czcB‑II | cobalt‑zinc‑cadmium resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/97); new base G (3/5); total (55/102) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
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aaGACGGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCAt < 2:1470126/150‑1 (MQ=255) aCTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCa < 1:3573401/76‑1 (MQ=255) tGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCg > 1:685330/1‑150 (MQ=255) cgcgATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCt < 1:1118308/150‑1 (MQ=255) cgcgATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCt < 2:3488837/150‑1 (MQ=255) cgATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGa < 1:4344434/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCa > 1:859062/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCa < 2:680457/150‑1 (MQ=255) aGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGa < 2:4696242/94‑1 (MQ=255) gTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCAt > 2:3860189/1‑150 (MQ=255) gTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCAt > 2:1279372/1‑150 (MQ=255) tGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATc < 1:3812224/150‑1 (MQ=255) tGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGGTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATc < 2:4496235/150‑1 (MQ=255) tgagtaCCGGCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGag > 2:903027/6‑150 (MQ=255) taCCGGCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGcaca < 1:4517870/88‑1 (MQ=255) aCCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAgcg > 1:284613/1‑150 (MQ=255) aGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCt > 1:319801/1‑150 (MQ=255) | TCGACCGCTTCGATGCCGCCGTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCT > NC_002947/2755382‑2755680 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |