| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,755,545 | C→T | 8.9% | A379A (GCC→GCT) | czcB‑II → | cobalt‑zinc‑cadmium resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,755,545 | 0 | C | T | 8.9% | 422.0 / 23.2 | 146 | A379A (GCC→GCT) | czcB‑II | cobalt‑zinc‑cadmium resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/89); new base T (6/7); total (50/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.50e-01 | |||||||||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CCGCCGTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCTGGTGGTGATGCTGG > NC_002947/2755397‑2755694 | ccgccgTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGccgccg < 2:2633103/150‑1 (MQ=255)ccgccgTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGccgccg < 2:4895817/150‑1 (MQ=255)ccgccgTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGccgccg < 2:4896068/150‑1 (MQ=255) gccgTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCGGCGGCCAGGCCGCTGGt < 1:3114323/150‑1 (MQ=255) ccgTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCGGCGGCCAGGCCGCTGGtg < 1:4113151/150‑2 (MQ=255) ccgTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCGGCGGCCAGGCCGCTGGtg < 1:1532288/150‑2 (MQ=255) ggCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCa > 2:3988846/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGtt < 1:3163089/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTg > 2:4373928/1‑150 (MQ=255) tGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTg < 2:4835409/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTg < 2:4835763/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCgg < 2:2674956/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCgg < 1:3741920/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCgg < 2:2675141/150‑1 (MQ=255) ggAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGCCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGgc > 2:3937198/1‑150 (MQ=255) gcCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGc < 1:1496228/150‑1 (MQ=255) ccTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAg > 1:4244704/1‑150 (MQ=255) cTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGc > 2:1708108/1‑150 (MQ=255) tGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGcg > 2:3906856/1‑149 (MQ=255) tGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCt < 2:3017605/150‑1 (MQ=255) cAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCttt < 1:788131/150‑1 (MQ=255) cAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCttt < 1:1620792/150‑1 (MQ=255) cAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCttt < 1:1731566/150‑1 (MQ=255) cAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCttt < 1:505537/150‑1 (MQ=255) cAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCttt < 1:35008/150‑1 (MQ=255) cAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCttt < 1:792286/150‑1 (MQ=255) aaCCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGt > 2:2104732/1‑150 (MQ=255) aCCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTc < 1:1879507/150‑1 (MQ=255) cTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCt < 2:3252556/150‑1 (MQ=255) tGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCtt < 2:1758047/150‑1 (MQ=255) tGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCtt > 1:4393858/1‑150 (MQ=255) tGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCCAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGACAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCtt < 1:4293723/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTaa < 2:1537292/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTaa > 2:4411896/1‑150 (MQ=255) ggAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTaa > 2:706388/1‑150 (MQ=255) ggAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTaa < 1:3339161/150‑1 (MQ=255) gAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAg > 1:460311/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAg > 1:460316/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAg > 1:93605/1‑150 (MQ=255) gAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAg > 1:2646946/1‑150 (MQ=255) aCCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTg < 1:4696832/150‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTgg < 1:2104732/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTggg > 2:463796/1‑150 (MQ=255) agtggtgTTCGCCCGCACGGAGGAAGACTTCGAGGCGCGCCAGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTggg > 2:2476575/2‑150 (MQ=255) ggtgTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCaa < 1:4795447/150‑1 (MQ=255) gtgtTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAg < 2:3318003/150‑1 (MQ=255) tgtTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAgg < 1:4756625/150‑1 (MQ=255) tgtTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAgg < 2:4204152/150‑1 (MQ=255) gtTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAggg < 1:2270106/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCt > 2:2345850/1‑150 (MQ=255) cGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTc < 1:4697521/150‑1 (MQ=255) cccGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCgg < 2:3033604/150‑1 (MQ=255) cGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGcc < 1:4448682/150‑1 (MQ=255) gCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCg < 1:2478131/150‑1 (MQ=255) aCGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAg < 1:83274/150‑1 (MQ=255) aggaAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGcaca > 2:2598359/1‑150 (MQ=255) aggaAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGcaca < 1:4467824/150‑1 (MQ=255) aggaAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGcaca < 1:1712136/150‑1 (MQ=255) gaAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCCAGGGCTCGGCCGAGCACAGc > 2:1692223/1‑150 (MQ=255) gaAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGc > 1:1097112/1‑150 (MQ=255) aGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTTGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGACCGAGCACAGCCa > 2:1169593/1‑150 (MQ=255) aGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCa > 2:1066916/1‑150 (MQ=255) aGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCa < 1:2345850/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCAc < 2:4330809/150‑1 (MQ=255) gCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACt > 1:829470/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGAt < 1:240948/150‑1 (MQ=255) gAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCa < 1:2539843/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACgg < 1:426079/150‑1 (MQ=255) cgcgcCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACggg < 2:3450621/150‑1 (MQ=255) cgcgcCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACggg < 1:3372326/150‑1 (MQ=255) cgcgcCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACCCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACggg < 2:1429754/150‑1 (MQ=255) gAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCa < 1:2188486/150‑1 (MQ=255) aaGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCAt < 2:1470173/150‑1 (MQ=255) aaGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCAt > 1:1835145/1‑150 (MQ=255) aaGACGGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCAt < 2:1470126/150‑1 (MQ=255) tcTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCa > 2:3573401/2‑76 (MQ=255) aCTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCa < 1:3573401/76‑1 (MQ=255) tGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCg > 1:683675/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCg > 1:685330/1‑150 (MQ=255) cgcgATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCt < 1:1118308/150‑1 (MQ=255) gcgATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTg > 1:277560/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGAtt < 1:3875969/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCa < 2:680457/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAAttt < 2:4639498/150‑1 (MQ=255) tGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATc < 1:3812224/150‑1 (MQ=255) tGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGGTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATc < 2:4496235/150‑1 (MQ=255) tgagtaCCGGCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGag > 2:903027/6‑150 (MQ=255) gagtaCCGGCGGCCAGGCCGCTGGTGCTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGagc > 2:1268735/5‑150 (MQ=255) taCCGGCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGcaca < 1:4517870/88‑1 (MQ=255) aCCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAgcg > 1:284613/1‑150 (MQ=255) cggCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGTCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGcc > 2:362861/3‑150 (MQ=255) gCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGa < 1:520083/124‑1 (MQ=255) gCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGa > 2:520083/1‑124 (MQ=255) gCGGCCAGGCCGCTGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGa > 2:520092/1‑124 (MQ=255) ggCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCtggt < 2:2219978/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCtggtg < 1:3937198/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCtggtgg > 1:794485/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCTGgtggtg < 1:1648463/150‑1 (MQ=255) gccgGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCTGGTGGTGATGCt > 1:4056932/1‑150 (MQ=255) cgGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCTGGTGGTGATGCTgg < 2:1290706/150‑1 (MQ=255) | CCGCCGTGGCGGTGCCGGAAAGCGCCCTGCAAACCTGGGAGGCGCAGACCGTGGTGTTCGCCCGCACGGAGGAAGGCTTCGAGGCGCGCCCGGTGAAGACTGGCCGTCGCGATGCTGGCCAGGTGGAAATCACCAGCGGCCTGGCCGCCGGTACTCAGGTTGCGGCCGCCGGCAGCTTTGTCCTTAAGTCGGAACTGGGCAAGGGCTCGGCCGAGCACAGCCACTGATCACGGGGACACCTGCATGTTCGAACGCCTGATTCAATTTGCCATCGAGCAGCGCCTGGTGGTGATGCTGG > NC_002947/2755397‑2755694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |