| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,956,626 | C→A | 10.4% | intergenic (‑164/‑117) | PP_2586 ← / → PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,956,626 | 0 | C | A | 10.4% | 260.9 / 15.4 | 84 | intergenic (‑164/‑117) | PP_2586/PP_2587 | putative amino acid transporter/LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/28); new base A (6/3); total (53/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
AAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTT > NC_002947/2956477‑2956774 | aaGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGacac < 1:1638696/150‑1 (MQ=255)aaGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGacac < 1:2186586/150‑1 (MQ=255) gATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGcc > 2:4331655/1‑150 (MQ=255) gATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGcc > 2:595125/1‑150 (MQ=255) gCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCtt < 2:4133115/150‑1 (MQ=255) gCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCAAACCATGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACCAAGCCAtt > 2:2097160/1‑150 (MQ=255) aGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGc > 1:1526671/1‑150 (MQ=255) gACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAACGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTGTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTGGccc > 2:1506243/1‑150 (MQ=255) cacCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCgg < 1:3496236/150‑1 (MQ=255) cgGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGTAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCAc < 1:159702/150‑1 (MQ=255) cgGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCAc < 1:2638609/150‑1 (MQ=255) cgGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCAc < 1:2638798/150‑1 (MQ=255) ggCAGGCGAGCGGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCAcc < 2:5097239/150‑1 (MQ=255) ggtcgCGAGCCTGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCAccc > 1:4386468/5‑150 (MQ=255) gtcgCGAGCCTGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCAcccc > 1:3285405/4‑150 (MQ=255) aGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCa > 1:842894/1‑150 (MQ=255) aGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCa > 1:3414573/1‑150 (MQ=255) gCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCaaa < 2:2947297/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAgg < 1:4990989/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAgg < 1:4990680/150‑1 (MQ=255) aGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCACAggg > 1:4029367/1‑150 (MQ=255) aGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAggg > 1:4029277/1‑150 (MQ=255) gCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTTGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTGTGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGt < 2:4002407/150‑1 (MQ=21) gCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTGTGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGt < 2:4002424/150‑1 (MQ=21) gCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCA‑CCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTGTGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGTg < 1:4171164/150‑1 (MQ=18) ggCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGAt > 1:1017678/1‑150 (MQ=255) tCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTcc > 1:4300603/1‑150 (MQ=255) gcgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCCGCAGGCA‑CCGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTGTGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑ggg > 2:4220582/1‑149 (MQ=18) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGt < 2:3560714/150‑1 (MQ=255) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGt < 2:3560694/150‑1 (MQ=255) cgACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGt < 1:2008025/150‑1 (MQ=255) gTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTg > 2:2162395/1‑150 (MQ=255) gTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTg > 1:4358576/1‑150 (MQ=255) tgtgCACGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAAGCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTGGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGt < 2:4386157/150‑1 (MQ=255) tgtgCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTTAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGt < 2:686659/150‑1 (MQ=255) gCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTggg > 2:3124457/1‑150 (MQ=255) aaGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAg > 2:1949007/1‑150 (MQ=255) aaGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAg > 2:1336220/1‑150 (MQ=255) gAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAacga > 2:2141167/1‑150 (MQ=255) aaaGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGGCCTTGCCCGGCTCACCCGAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGATCAacgac > 2:3115247/1‑150 (MQ=255) cTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGAcgcac < 2:1616018/150‑1 (MQ=255) tCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGAcgcacc > 1:805645/1‑150 (MQ=255) cAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGAcgcaccgca > 2:452595/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTggc > 1:1846382/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTggc > 1:2513605/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCGGGCTCACCCCAAAGGGTTATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGcggcgg < 2:1386910/150‑1 (MQ=255) ggTTGATGCCCCCACACCCTGCAGGCACCCGCAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACCGCCCTTGCCCGGAACCCCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGc < 1:4538648/150‑1 (MQ=255) aTGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTg < 2:3290334/150‑1 (MQ=255) tGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTga < 2:1779450/150‑1 (MQ=255) cTCCAACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGAACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTgaga > 2:2214767/1‑150 (MQ=255) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGGCGCACCGCACGGGCGGCGGTGCCCCTGAGaa > 1:4389622/1‑150 (MQ=255) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaa > 2:626526/1‑150 (MQ=255) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaa > 2:1572549/1‑150 (MQ=255) tCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaa > 2:626514/1‑150 (MQ=255) cccACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGCGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaa > 2:1722741/1‑150 (MQ=255) cccACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGaaa > 1:5087146/1‑150 (MQ=255) cacaCCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACCCAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGCGAAAAc > 1:3548143/1‑150 (MQ=255) acCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGTCACTGAGAAAACGGc < 2:4797795/150‑1 (MQ=255) acCCGGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGc < 2:1365066/150‑1 (MQ=255) cACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAg > 2:3445503/1‑150 (MQ=255) aCCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGGGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGt > 1:4706893/1‑150 (MQ=255) accGGAATCACCCTTTGGGGTGAGCCGGGCAAGGGCTGTGTCC‑GCTCACCCCAAAGGGTGATTCCGGGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGt > 1:4955550/2‑150 (MQ=17) ccGGAATCACCCTTGGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAATGGGTTATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGa < 1:2072781/150‑1 (MQ=255) 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tttGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGc > 2:3017956/1‑150 (MQ=255) tttGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGc > 1:3939637/1‑150 (MQ=255) tttGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGc > 1:3939730/1‑150 (MQ=255) ggggTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCACTTGCtt > 1:4870187/1‑149 (MQ=255) ggggTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCtt < 2:4870187/149‑1 (MQ=255) ggTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCCCCCAAATGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCa < 1:2097160/150‑1 (MQ=255) ggTGAC‑CGCACACCGCCCTTCCCCCCCTCACCCCAAAGGCTGATACC‑GGTCCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCa < 2:2601385/150‑1 (MQ=255) gTGCG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAg < 1:5011556/150‑1 (MQ=255) g‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACa > 1:587214/1‑150 (MQ=255) cGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACaa > 2:1640842/1‑150 (MQ=255) ggACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAAt < 1:4193306/150‑1 (MQ=255) ggACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAAt > 2:1076490/1‑150 (MQ=255) ggACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAAt > 2:1214700/1‑150 (MQ=255) acaGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGtt > 2:4288670/1‑150 (MQ=255) acaGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGtt > 2:4288643/1‑150 (MQ=255) acaGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGtt > 1:2773353/1‑150 (MQ=255) acaGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGtt > 1:4617350/1‑150 (MQ=255) acaGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGtt > 2:645023/1‑150 (MQ=255) acaGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGtt > 2:3254374/1‑150 (MQ=255) | AAGGGATGCAGGACACCGCGGCAGGCGAGCAGGCTCGCGACCGTCAGGTGTTGTGCAAGGAGGTCGAGCGGAAAGCTCGCAGCGCTGGGGCGGGTTGATGCTCCCACACCCTGCAGGCACCCGGAATCACCCTTTGGGGTGAG‑CGGACACAGCCCTTGCCCGGCTCACCCCAAAGGGTGATTCC‑GGTGCCTGCAGCGCCGTGGGAGTATCTGCTCAACGACGCACCGCACTGGCGGCGGTGCCACTGAGAAAACGGCAGGCTTACAGTGACCAATCAATTGCTTTCAGAACAATGGTT > NC_002947/2956477‑2956774 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |