| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,571,422 | 0 | A | T | 6.3% | 510.4 / 15.6 | 153 | intergenic (+16/+22) | PP_3150/sad‑II | hypothetical protein/NAD+‑dependent succinate semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/92); new base T (6/4); total (57/96) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CACAGGTGGCGGGTAACCGCAATGAACGGGCGCGTATGCTGGCGGGGTTGTATACCGCCTGTTCGCGGGCGCGGCATGAATTGATCGTGCCGGGGGGGATGCTGGACTGGGTCAAGGACCAGGTTCGGGATTGAAGCAGCTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAGCGCAGTAGC > NC_002947/3571273‑3571571 | gTGGCGGGTAACCGCAATGAACGGGCGCGTATGCTGGCGGGGTTGTATACCGCCTGTTCGCGGGCGCGGCATGAATTGATCGTGCCGGGGGGGATGCTGGACTGGGTCAAGGACCAGGTTCGGGATTGAAGCAGCTGGGGCCGCAAagca < 1:1144617/150‑1 (MQ=255) gTGGCGGGTAACCGCAATGAACGGGCGCGTATGCTGGCGGGGTTGTATACCGCCTGTTCGCGGGCGCGGCATGAATTGATCGTGCCGGGGGGGATGCTGGACTGGGTCAAGGACCAGGTTCGGGATTGAAGCAGCTGGGGCCGCAAagca > 1:646151/1‑150 (MQ=255) gTGGCGGGTAACCGCAATGAACGGGCGCGTATGCTGGCGGGGTTGTATACCGCCTGTTCGCGGGCGCGGCATGAATTGATCGTGCCGGGGGGGATGCTGGACTGGGTCAAGGACCAGGTTCGGGATTGAAGCAGCTGGGGCCGCAAagca < 2:2079252/150‑1 (MQ=255) 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ttCGGGATTGAAGCAGCTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGc < 1:2296481/150‑1 (MQ=255) gAAGCAGCTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCgggg < 1:3946232/150‑1 (MQ=255) gAAGCAGCTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCgggg < 1:3946286/150‑1 (MQ=255) aaGCAGCTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCggggg > 1:3348958/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCggggg > 2:4479460/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCTGCGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCggggg > 2:585344/1‑150 (MQ=255) gcagcTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTgg > 2:1780178/1‑64 (MQ=255) gcagcTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTgg < 1:1780178/64‑1 (MQ=255) gcagcTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTc > 2:2521513/1‑150 (MQ=255) gcagcTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTc < 1:297981/150‑1 (MQ=255) gcagcTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTc > 1:3456856/1‑150 (MQ=255) gcagcTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTc < 1:4737641/150‑1 (MQ=255) acccTGGGGCTGCTTTGCGGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTcc > 1:4314418/4‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTTTGCGGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGa > 1:2386228/2‑150 (MQ=255) cTGGGGCTGCTTTGCGGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAGCTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGaa > 1:3744594/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGaa < 2:2428406/150‑1 (MQ=255) tGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAg < 1:902939/150‑1 (MQ=255) gCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAGCGCa < 1:1237270/150‑1 (MQ=255) ccGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAGCGCAg > 2:4955570/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCGTTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAGCGCAGt > 2:637384/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAGCGCAGt < 1:2936437/150‑1 (MQ=255) gCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAGCGCAGTa > 1:1609764/1‑150 (MQ=255) | CACAGGTGGCGGGTAACCGCAATGAACGGGCGCGTATGCTGGCGGGGTTGTATACCGCCTGTTCGCGGGCGCGGCATGAATTGATCGTGCCGGGGGGGATGCTGGACTGGGTCAAGGACCAGGTTCGGGATTGAAGCAGCTGGGGCCGCAAAGCAGCCCCAGGGTCATGAATCAGTTACGGTCCAGCCACACGGTCTGGGCATTGGTGAACTCGCGCACACCAAAGTGCGACAGCTCACGGCCGAAACCACTCTTCTTCACGCCACCAAACGCCACGCGGGGGTCCGAAGCGCAGTAGC > NC_002947/3571273‑3571571 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |