| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,152,000 | 0 | A | T | 7.5% | 403.0 / 14.5 | 134 | intergenic (+33/‑364) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (59/64); new base T (4/6); total (64/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.48e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCC > NC_002947/4151854‑4152148 | ccGGCGTGTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCACTGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAC < 2:2982602‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCC < 2:1257014‑M1/150‑1 (MQ=255) cGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:3252659‑M1/150‑1 (MQ=255) 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cccATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCTGCAAAGGTGGCGGAGCCCGTCGCCGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCGCCCACGCCACCCTTCAAAAGCCCTGAAAACGCGCCCATCGCACCa > 2:3484872/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAATGGTGACGTAGCCCGTCGCTGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCa < 2:1348443/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCCCATCGCACCAACCCa > 2:1591085/1‑150 (MQ=255) tGTTTCCTTTTGTGCCGGCCCGTGGGGGTTTAAACCGGCGCGTTCAATGTTGAGGTAGCCCGTCGCTGGTGGTGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCa < 1:495085/150‑1 (MQ=255) gTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCGGCCAAGGTGACCGAGCCCCGCGCAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGCGGCCGGCCCCGGCAACCAATCAAATGCCCAGAAAACCCGCACCACCCACCAAcccccccccc > 2:2677399/1‑143 (MQ=255) tttCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCAcc > 2:3299662/1‑150 (MQ=255) ctctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGa < 2:2077081/150‑1 (MQ=255) ctctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCATTCATCAGCCCTGAAAACGCGCACAACGCACCAACCCAGCCCACCGTGa > 2:4687169/1‑150 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAAACCCCGCCAGCAAAGGTGGCGGAGCCCCGCGCAGGAGCGGGGTTAACCCCCCACAGGCCCGCCCACGCCACCAATAAACTGCCCCGAAAAAGCGCACAAAGCACCCAACCACcccccccggaa > 2:41752/1‑145 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCCCCAGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAGGCCCGCCCAGGCAACCATTCATAATCCCGGAAAACGCGCACCAAGCACCAACCCCCCCCAcccagaa > 2:3543080/1‑145 (MQ=255) ctTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATc < 2:4776513/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGGCGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCCACCTTTCATCTGCCCTGACAACGCGCACATCGCACCAACCCCGCCCACCGTGCTcc > 2:4224556/1‑150 (MQ=38) ccTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCAccc > 2:1673870/1‑150 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgt > 2:2468035‑M1/1‑18 (MQ=255) gggTACCCCCGCtcctgcgcggggctacgtcacctttgcaggggggggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcaca < 2:3989104‑M1/150‑139 (MQ=255) gggTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcagttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcact > 2:651064‑M1/1‑12 (MQ=255) ggTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCgccgcc > 2:3537991/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacatt > 2:1333810‑M1/1‑10 (MQ=255) gTAAACCCGCtcctgcgacgggctacgtcacctttgcaggcgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggtcgagctcaagcgtttcacatt > 2:1172677‑M1/1‑10 (MQ=255) gTAAACCCGCGCCTGCAAAGGAGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCTCCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCcgccgcac > 2:4883141/1‑148 (MQ=255) tAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAgcgggtttacccgcgaaggggccggcacaagaggaaacagctacatggggagcaaccgatcctggatcacttccttcatcaccaaggttgagctcaagcgtttcacattg > 2:3586097‑M2/1‑40 (MQ=255) | CCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTGCAAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCCCCGCCGCCCC > NC_002947/4151854‑4152148 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |