| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 4,807,090 | G→A | 5.0% | I923I (ATC→ATT) ‡ | PP_4234 ← | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,807,090 | 0 | G | A | 5.0% | 504.1 / 9.8 | 159 | I923I (ATC→ATT) ‡ | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (84/67); new base A (3/5); total (87/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGCG > NC_002947/4806942‑4807239 | gTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGa > 2:4305772/1‑150 (MQ=255)gTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGa > 1:1049968/1‑150 (MQ=255) gCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATg < 2:2742017/150‑1 (MQ=255) 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atcGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCTCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGc < 2:880251/150‑1 (MQ=255) tcGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCa < 1:3842171/150‑1 (MQ=255) cGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCAt < 1:2774496/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGcc > 2:3812630/1‑150 (MQ=255) gTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGa > 1:795196/1‑150 (MQ=255) 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gCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGCTTTCGCTGGTCTGCTGCCACACTGCCACATCGCGCGCATGCGGCAg > 2:2878343/1‑150 (MQ=255) | GTGCAGGTAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGCG > NC_002947/4806942‑4807239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |