| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,807,097 | T→A | 5.2% | H921L (CAT→CTT) | PP_4234 ← | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,807,097 | 0 | T | A | 5.2% | 514.6 / 12.1 | 153 | H921L (CAT→CTT) | PP_4234 | bifunctional aldehyde oxidase/xanthine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (80/65); new base A (3/5); total (83/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGCGGTA > NC_002947/4806949‑4807242 | tAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATg < 2:1689859/150‑1 (MQ=255) tCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATgcgc > 2:3346429/1‑150 (MQ=255) gATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGa > 2:5027131/1‑150 (MQ=255) gATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGa > 2:5114218/1‑150 (MQ=255) gATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCATGCCATCGGCAAGcgcgt < 2:2267291/150‑2 (MQ=255) gATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCATGCCATCGGCAAGcgcgt < 1:432217/150‑2 (MQ=255) gATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCATGCCATCGGCAAGcgcgt < 2:4006404/150‑2 (MQ=255) gATCAGCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGCCCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCATGCCATCGGCAAGcgcgt < 1:3481240/150‑2 (MQ=255) atcatcGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGAc < 2:5020061/150‑1 (MQ=255) catcGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACgg > 2:712457/1‑150 (MQ=255) atcGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCTCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGc < 2:880251/150‑1 (MQ=255) tcGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCa < 1:3842171/150‑1 (MQ=255) aGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGcc > 2:3812630/1‑150 (MQ=255) tCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGAt < 1:1907125/150‑1 (MQ=255) tCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGAt < 2:4850474/150‑1 (MQ=255) cTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCCTTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACcgacga > 2:2230592/1‑150 (MQ=255) cTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACcgacga > 1:2989108/1‑150 (MQ=255) cTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACcgacga > 1:4478127/1‑150 (MQ=255) tCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCgacgac > 1:4103048/1‑150 (MQ=255) tCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCgacgac > 1:4727442/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCggg < 1:3789304/150‑1 (MQ=255) ggCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGat < 2:4593258/150‑1 (MQ=255) ggCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGat < 2:4593298/150‑1 (MQ=255) ccGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGatcat < 1:2764951/150‑1 (MQ=255) gACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGAtcatca < 1:1656421/150‑1 (MQ=255) gTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACt > 1:86286/1‑150 (MQ=255) gTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACt > 1:86344/1‑150 (MQ=255) gTTGACCGTTGAGCGTCAGTGGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACt > 2:2533838/1‑150 (MQ=255) ttGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACtt < 2:2075281/150‑1 (MQ=255) gACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCg > 2:932507/1‑150 (MQ=255) cggtGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCAGTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCCTTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCg > 1:3243957/4‑150 (MQ=255) cGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCg > 1:3821040/1‑150 (MQ=255) gAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGc > 1:3260941/1‑150 (MQ=255) gCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGccc > 1:1864994/1‑150 (MQ=255) cGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCt < 2:1206235/150‑1 (MQ=255) cGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCt < 2:1206205/150‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCtt < 2:3116916/150‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCtt < 2:3116899/150‑1 (MQ=255) aGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGa < 1:69995/150‑1 (MQ=255) tGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAggg < 2:3331956/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAgggg > 2:540728/1‑150 (MQ=255) tGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGggtcgg > 1:4093637/1‑150 (MQ=255) aggACGGTTAGCCATTGAGGGCATCCTTGATAAGGGCTGGGGTGATGGGTAGATCGCGCAAGCGCTAGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGAAAATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGggtcgg > 2:450731/2‑150 (MQ=255) ggTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTcggtcggt < 1:4471442/150‑1 (MQ=255) ggTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTcggtcggt < 2:1104480/150‑1 (MQ=255) ggTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTcggtcggt < 1:716360/150‑1 (MQ=255) ggTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTcggtcggt < 2:3759408/150‑1 (MQ=255) ggTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTcggtcggt < 2:2919754/150‑1 (MQ=255) gCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAg > 1:3591500/1‑150 (MQ=255) tGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAgcggcg < 2:3821040/150‑1 (MQ=255) gggCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGgga < 1:3066148/150‑1 (MQ=255) gggCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGgga < 1:540728/150‑1 (MQ=255) gggCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGgga < 2:2162364/150‑1 (MQ=255) gggCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGgga < 1:4326408/150‑1 (MQ=255) gggCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGgga < 1:4016246/150‑1 (MQ=255) ctcctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGAt > 1:36830/1‑150 (MQ=255) tcctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGAtt > 1:98763/1‑150 (MQ=255) tcctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGAtt > 1:98863/1‑150 (MQ=255) tcctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGAtt > 1:4199133/1‑150 (MQ=255) tcctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGAAGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGAtt > 2:1316882/1‑150 (MQ=255) cctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGAttt < 1:2478947/150‑1 (MQ=255) ctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTc > 2:2332893/1‑150 (MQ=255) ctTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTc > 1:1635724/1‑150 (MQ=255) ttGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCg > 1:1479127/1‑150 (MQ=255) ttGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTAGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCg > 1:514757/1‑150 (MQ=255) tGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGc < 1:4434039/150‑1 (MQ=255) aTACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTg < 2:3637422/150‑1 (MQ=255) aTACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTg < 1:1989634/150‑1 (MQ=255) taagggCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACAGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTgg > 1:4578942/4‑150 (MQ=255) tACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCAt < 1:2135813/48‑1 (MQ=255) aCGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGt < 2:949106/150‑1 (MQ=255) gggCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTct > 1:5037880/1‑150 (MQ=255) gggCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCGGGTcg > 1:5037891/1‑149 (MQ=255) cTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTctgct < 2:2480182/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTctgctg > 2:798705/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTctgctg > 2:3550479/1‑150 (MQ=255) gggTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGcc > 1:3580126/1‑150 (MQ=255) gggTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGcc > 1:1905671/1‑150 (MQ=255) gggTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGcc > 1:3303578/1‑150 (MQ=255) gggTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGcc > 1:2549280/1‑150 (MQ=255) gggAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGcc > 2:1080104/1‑150 (MQ=255) gggAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGCCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGcc < 1:910362/150‑1 (MQ=255) ggAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCca > 2:1763151/1‑150 (MQ=255) gagaTCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCcac > 1:1700677/1‑150 (MQ=255) gtcgcgCATGCCATCGGCAAGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCgcgcgc > 1:5035974/3‑150 (MQ=255) gtcgcgCATGCCATCGGCAAGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCgcgcgc > 1:5035968/3‑150 (MQ=255) aCGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCa > 2:1660878/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATg > 2:146974/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATg > 1:2457770/1‑150 (MQ=255) gcgcTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATg < 2:215023/150‑1 (MQ=255) cgcTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGc < 2:2715685/150‑1 (MQ=255) ttGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGc > 2:4807952/1‑150 (MQ=255) ttGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGc > 2:4807889/1‑150 (MQ=255) ttGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGc > 1:1305988/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGCTTTCGCTGGTCTGCTGCCACACTGCCACATCGCGCGCATGCGGCAg > 2:2878343/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAg > 2:2684826/1‑150 (MQ=255) cGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGc > 1:2012175/1‑150 (MQ=255) gATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGCg > 1:3511566/1‑150 (MQ=255) ggCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGCGGTa < 1:3920697/150‑1 (MQ=255) ggCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGCGGTa < 2:2012175/150‑1 (MQ=255) | TAGTCGATCATCGCCAGGTCCGCGGGAACCTCGACCGGCCCGACCGGTTGACCGTTGAGCGTCAGTTGCAGTGGACGGTTAGCCATTGAGGGCCTCCTTGATACGGGCTGGGGTGATGGGGAGATCGCGCACGCGCTTGCCGATGGCATGCGCGACGGCATTGCCGATGGCACCGACGACCGGGATCATCACCACTTCGGCGATGCCCTTGGAGGGGTCGGTCGGTGACAGCGGCGGGAGGATTTCGCTGGTCTGCTGCCACACCGCCACATCGCGCGCATGCGGCAGGCGGTA > NC_002947/4806949‑4807242 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |