| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,878,325 | 0 | C | A | 5.7% | 462.8 / 4.6 | 163 | intergenic (+196/+241) | PP_4284/pucM | transporter/5‑hydroxyisourate hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (66/78); new base A (11/2); total (82/81) | |||||||||||
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Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCC > NC_002947/4878176‑4878474 | cgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTc < 1:4338972/150‑1 (MQ=255)cgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTc < 1:1759561/150‑1 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCAc > 2:3100720/1‑150 (MQ=255) 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ccgccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCggg > 2:4283000/1‑150 (MQ=255) gccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACCCAGCCCGTCGGAGGAGCGGGtt > 1:322176/1‑150 (MQ=255) gccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGtt > 2:2552854/1‑150 (MQ=255) gccgTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAAACCGCACCAACCACCGGGTGGTAAGTTGGACACAGCCCGGGGTCGGAGCCGGtt > 1:177376/1‑150 (MQ=17) ttggAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAcc < 1:434780/148‑1 (MQ=255) tcttcgCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACGCAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAcc > 2:2757128/6‑150 (MQ=255) tcttcgCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTa > 1:3415323/6‑136 (MQ=255) aGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAACCCCGCACCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:3100808/150‑1 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACACCCCGTCGGTGGAGCGGGTTCACCcg > 1:1454451/1‑150 (MQ=255) ggAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAACACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGGGGTTGGTGCGGGTTCACCcg > 1:1454780/1‑150 (MQ=17) 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CGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGGTGGTGGACAGTTGGATACAGCCCGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCTACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCACCACCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCACGGGGTGGACAGTTGGACACAGCCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCC > NC_002947/4878176‑4878474 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |