| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,419,176 | G→A | 5.3% | R160C (CGC→TGC) | gudD ← | bifunctional D‑glucarate dehydratase/L‑idarate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,419,176 | 0 | G | A | 5.3% | 473.4 / 10.5 | 150 | R160C (CGC→TGC) | gudD | bifunctional D‑glucarate dehydratase/L‑idarate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/77); new base A (4/4); total (69/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
GAGCTTGAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAAT > NC_002947/5419027‑5419323 | gAGCTTGAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCAGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCg < 1:1252108/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCg < 1:2410735/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCg > 1:1701070/1‑150 (MQ=255) ttGAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCCGGCGGTCg > 2:4272281/1‑150 (MQ=255) tGAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGc < 2:4685790/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGcc < 2:1458580/150‑1 (MQ=255) aGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGa < 1:2280534/150‑1 (MQ=255) aGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGa > 2:1775906/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGAt < 1:2454791/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGAt < 2:3626369/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGAt < 2:3617743/150‑1 (MQ=255) cGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGt < 1:821809/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTa < 2:2846389/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTa > 2:1523718/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTa > 2:4970082/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTa < 2:3149561/150‑1 (MQ=255) gCTGAAGCCAGAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTa < 2:1323812/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGa > 1:1350096/1‑150 (MQ=255) aaGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAAc < 2:4302385/150‑1 (MQ=255) aGCCATGGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACa < 2:1194219/150‑1 (MQ=255) aGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACa < 2:4256312/150‑1 (MQ=255) ccATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGa > 2:2306306/1‑150 (MQ=255) ccATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGa > 1:2833395/1‑150 (MQ=255) cATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGAt > 2:4643022/1‑150 (MQ=255) cATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGAt > 2:4643042/1‑150 (MQ=255) cATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCAATGTAGAACAGAt < 2:1324602/150‑1 (MQ=255) aTAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATa < 2:813770/150‑1 (MQ=255) aTAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATa < 2:813968/150‑1 (MQ=255) aTAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATa > 1:3942557/1‑150 (MQ=255) aTAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATa > 1:4040393/1‑150 (MQ=255) aTAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATa > 2:236285/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGcc > 2:199241/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCa > 1:200451/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCa > 1:1354218/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCa > 1:1860111/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCAt > 2:4141165/1‑150 (MQ=255) ggcggcCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCtt < 1:2394785/150‑1 (MQ=255) cggcCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCa < 1:1504736/150‑1 (MQ=255) ggcCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCAc < 2:1938235/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCg > 1:1573158/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCa > 2:2104354/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCa > 1:4616595/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATc < 1:184808/150‑1 (MQ=255) cGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGc < 1:1919782/150‑1 (MQ=255) gCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCt > 2:915449/1‑150 (MQ=255) caccacTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTg < 2:4296868/150‑1 (MQ=255) caccacTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTg < 1:3607256/150‑1 (MQ=255) caccacTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTg < 2:3644235/150‑1 (MQ=255) ccacTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGc > 2:1059579/1‑150 (MQ=255) cacTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGcc > 2:3069396/1‑150 (MQ=255) cacTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGcc > 2:3446200/1‑150 (MQ=255) tGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCATGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGCCGTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTc > 2:2419786/1‑150 (MQ=255) cTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGc > 1:4738069/1‑150 (MQ=255) 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gCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGcc > 1:3462607/1‑150 (MQ=255) cTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCAt > 1:3137508/1‑150 (MQ=255) cTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCAt < 1:4413365/150‑1 (MQ=255) cTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCAt < 2:2254481/150‑1 (MQ=255) cTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCAGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCAt < 1:4926746/150‑1 (MQ=255) cTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCAGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCAt < 1:4926497/150‑1 (MQ=255) cTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCAGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCAt < 1:4926461/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGca < 2:1967255/150‑1 (MQ=255) cAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAg < 2:5089023/150‑1 (MQ=255) gAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCt > 1:3820206/1‑150 (MQ=255) 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cGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGa < 1:2207397/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAg > 2:3715182/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAAc > 2:1682249/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAAc > 2:1738998/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAAc > 1:4264571/1‑150 (MQ=255) 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cAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTAc > 1:2015615/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGAAGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCAAGCAATGCTGCCATAGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACTCCGACTCGATGGCCGTTAc > 1:469147/1‑150 (MQ=255) aaGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTAc > 2:2351068/2‑150 (MQ=255) ggtcggtcTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCTTCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCGCTCGCCCAGCAATGCTGCCATGGGCACAGTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTGGAGCAACGCCGACTCGAGGGCCGGGACCg > 2:3761060/1‑150 (MQ=255) ggtcggtcTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCg > 1:3570770/1‑150 (MQ=255) 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ctgGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGc < 1:1730110/120‑1 (MQ=255) ctgGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGt > 1:3303351/1‑150 (MQ=255) | GAGCTTGAAGTCGCTGAAGCCATAGCGCGCCTTGGCGGCCTCGGCCAGCCGCACCACTGCTTCCGGGGTCAGGGCCTTTTCGTGGCGCAGGCGAAACCAGTCGTCATCGCTGTCGGCTTCGTTGCGGTAGGCCAGGTCGGTCTGCTGGCGGTCGCCGATGTAGAACAGATAGCCGAGCATCTTCACCGCATCGCGTTGCTGGCCCTCGCCCAGCAATGCTGCCATCGGCACATTCAGGTGCTGGCCGAGCAGGTCGAGCAACGCCGACTCGATGGCCGTTACCGCATGTACGGTAAT > NC_002947/5419027‑5419323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |