| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 403,270 | T→A | 5.8% | intergenic (‑70/+99) | msrA ← / ← PP_0337 | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/sensory box protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 403,270 | 0 | T | A | 5.8% | 378.1 / 10.5 | 121 | intergenic (‑70/+99) | msrA/PP_0337 | peptide methionine sulfoxide reductase MsrA/sensory box protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/66); new base A (2/5); total (50/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.07e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCG > NC_002947/403121‑403419 | ggCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGt < 1:1163452/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACa < 1:4520372/150‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGcaca < 2:1563861/150‑1 (MQ=255) gcgGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGcaca < 1:2970266/150‑1 (MQ=255) ggCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAgg > 1:4615643/1‑150 (MQ=255) caggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCCTGACGTTGTTGTACACCAGGATCTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGttt < 1:3159294/150‑1 (MQ=255) caggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGttt < 2:2135913/150‑1 (MQ=255) aggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCT‑TTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGAACACcacaaccttt < 2:4905068/150‑7 (MQ=38) aggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCT‑TTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGAACACcacaaccttt < 2:4905012/150‑7 (MQ=38) aggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTc < 1:697917/150‑1 (MQ=255) aggcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTc > 2:2971881/1‑150 (MQ=255) gcaggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCaa > 1:2052989/1‑150 (MQ=255) caggGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCaaa < 1:1425456/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGtt < 1:3305422/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGtt < 1:251247/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGtn < 1:11321/150‑2 (MQ=255) cTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgt < 2:5011216/150‑1 (MQ=255) cTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgt > 2:567189/1‑150 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg > 2:2459561/1‑150 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg < 2:68541/150‑1 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg < 2:4033545/150‑1 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg > 1:5105872/1‑150 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg < 2:3476445/150‑1 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg < 1:2020264/150‑1 (MQ=255) tGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGGGGGGGAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGCACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg > 1:1798784/1‑150 (MQ=255) gggtCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTtgtg < 2:3408716/147‑1 (MQ=255) gTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTgtgg < 1:3878386/150‑1 (MQ=255) ttCCGCAGTGGTCATGTCGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGTACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTgtggt < 1:4179469/150‑1 (MQ=255) ttCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTgtggt < 1:4179400/150‑1 (MQ=255) gtCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTgtggt < 2:209737/149‑1 (MQ=255) tGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCtgt < 2:3596341/150‑1 (MQ=255) gggCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCtgtg < 2:1135515/150‑1 (MQ=255) gggCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCtgtg < 2:1135357/150‑1 (MQ=255) ggCATGTCGTTTTTGTTCTCCAGGATTTCCGATCGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTGTTTCTGTGGGGTAGGTGTTTGGGCC‑TACGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAACGGTTGTGGTGTTCCTGTgg < 2:5107918/150‑1 (MQ=38) ggCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑CTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTgg < 1:3877577/150‑1 (MQ=255) gCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTAAAAGGTTGTGGTGTTACTGTggg > 1:1805765/1‑150 (MQ=255) aTGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGAACACCACAACCTTTGAAACCTGTGCTGTACCTGTGGGa < 1:3461064/150‑1 (MQ=17) tGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCTGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGc < 1:2844026/150‑1 (MQ=255) tGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGc > 1:3491600/1‑150 (MQ=255) aCGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCgg < 2:3807465/150‑1 (MQ=255) aCGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCgg > 2:2091467/1‑150 (MQ=255) gTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGc < 1:2024029/150‑1 (MQ=255) ttCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg > 1:412686/1‑150 (MQ=255) aCCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGa > 1:4362916/1‑150 (MQ=255) ccAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa > 2:465703/1‑150 (MQ=255) ccAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaa > 1:753027/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTTCCGACCGCCGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTGGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGTACAGCACAGGTTTCAACGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa < 1:2415936/150‑1 (MQ=38) cAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTc > 2:3775634/1‑124 (MQ=255) cAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTc < 1:3775634/124‑1 (MQ=255) cAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa > 2:4401213/1‑150 (MQ=255) cAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCACCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGGTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa > 2:743254/1‑150 (MQ=255) cAGGATGTCCGAACGCAGGACCCTGGCCGTCCCTCTGTGTTTCGTCAGGGGGGTCGGGGGTGGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGTTCCCGCACCGGTTTCAAAGGTTGTGGTGGGCCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGaac < 2:3014020/150‑2 (MQ=25) cAGGAGTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGGTCCTCTGGGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTGGGGCC‑TTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTGCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa < 2:3013684/150‑1 (MQ=38) aGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGAACACCACAACCTTTGAAACCTGTGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaagg < 1:4080404/150‑3 (MQ=14) aTTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAATGGTTTTGGTTTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgggg > 1:2494162/1‑149 (MQ=255) gAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAAt > 2:1672416/1‑150 (MQ=255) gAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGACAGGGCCCGAAt > 1:103848/1‑150 (MQ=255) gAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTGTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAAt > 1:2344206/1‑150 (MQ=255) cGCAGGACCATGGCCGTGCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGc < 2:53868/150‑1 (MQ=255) aGGACCTTGGCCGTTCCTCTGTGTTTATGCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTc < 2:2472693/150‑1 (MQ=255) aGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCATGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATggagtg > 2:449000/1‑146 (MQ=255) ccATGGCCGTTCCTCTGTTTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCtata < 1:5044095/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTTGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCtata < 2:2762936/150‑1 (MQ=255) aTGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGt > 1:1598853/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGc > 2:2757063/1‑150 (MQ=255) tttATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAg > 1:3344783/1‑150 (MQ=255) tttATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCACCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTACTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAg > 1:4754188/1‑150 (MQ=255) ccgTGGGGTTGGGGTTTGGCCC‑TTCGGGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACCGTTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCa < 1:2569745/148‑1 (MQ=37) ccgTGGGGTTGGGGTTGGGGCC‑TTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCCCCGGTACAGCCCAGGTTTCAATGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCa < 1:674669/148‑1 (MQ=255) cAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCa < 2:3204802/150‑1 (MQ=255) gTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGGTGGGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCAcc > 2:3968977/1‑150 (MQ=255) ggggTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCggg > 2:4505098/1‑150 (MQ=255) ggTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGcc < 2:4090676/150‑1 (MQ=255) ttggggCC‑TGCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACCGGTACAGCACCGGTTCCAACGGTTGTGGGGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCATCTGTCAGGCCACCGGGCCAc < 1:291526/147‑1 (MQ=38) tGGGCC‑GTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCCCAGGTACAGCACAGGGTTCACCGGTGGTGGGGTTCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCAcgc < 2:1113550/150‑1 (MQ=38) gCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCggt > 2:2533472/1‑149 (MQ=255) cc‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAATGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGAt > 1:4336316/1‑150 (MQ=255) c‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAACGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATa < 1:2459561/150‑1 (MQ=255) c‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATa < 1:3306605/150‑1 (MQ=255) c‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATa < 1:2971881/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCtgtg < 2:614150/62‑1 (MQ=255) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAgcgc < 2:2052989/150‑1 (MQ=255) ggccggCCCGCTCCCACCGGTCCAGCACAGGTTTCAATGGTTGTGGTGTTCCGGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTc < 2:1312502/145‑1 (MQ=255) ggCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTc < 2:4615834/150‑1 (MQ=255) ggCATGCCCGCGCCCACAGGTACAGCACAGGTTCCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTc < 1:3878210/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCt > 1:2472381/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCt > 1:4821872/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCg < 2:3772175/150‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCg > 2:673306/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAGGAACACCACAACCTTTGAAACCTGTGCTGTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCg > 1:1554055/1‑150 (MQ=18) cTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCgg > 1:1448855/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCa < 2:412686/150‑1 (MQ=255) acaGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTCTAGTGCCCGAGGATTAGGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGt > 2:2699521/1‑150 (MQ=255) acaGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGTCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGt > 2:3845838/1‑150 (MQ=255) acaGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGt > 2:2153896/1‑150 (MQ=255) acaGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGt > 2:3444225/1‑150 (MQ=255) aGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTc > 2:4551750/1‑150 (MQ=255) gTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGACCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTcgc > 1:712612/1‑150 (MQ=255) tACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTcgcg > 1:2070536/1‑150 (MQ=255) tACAGAACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTcgcg > 2:3273960/1‑150 (MQ=255) | GGCGTGTCGCGGCCAGGCAGGGCCTGTTCCGCAGTGGGCATGACGTTTTTGTTCACCAGGATTTCCGAACGCAGGACCATGGCCGTTCCTCTGTGTTTATTCAGTGGGGTAGGGGTTTGGGCC‑TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAGGTTTCAAAGGTTGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCCGAATGGCTTCTATAGTGCCCGAGGATTACGCAGCTGTCAGGCCACCGGGCCACGCGGATAGCGCTTCAGCCGCTCGGCCAGTTCGCG > NC_002947/403121‑403419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |