| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,539,045 | G→C | 11.4% | intergenic (+52/+51) | nadE → / ← PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,539,045 | 0 | G | C | 11.4% | 265.9 / 13.6 | 98 | intergenic (+52/+51) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/46); new base C (5/7); total (44/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGAA > NC_002947/5538898‑5539194 | cTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGAc < 2:4628260/150‑1 (MQ=255)cTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGAc < 2:4507750/150‑1 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGc > 2:365504/1‑150 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAACGAGGGT‑GAACCCACCCACGc > 2:365424/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCAtt < 2:1677502/150‑1 (MQ=255) gggCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTc < 1:2457780/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTcgc < 1:41377/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTcgc < 1:3909669/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCGCCCGCAAGACCCAGCACCAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTcgc < 2:655608/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACCAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:4264681/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACCAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:4264955/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGT‑GGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 1:2853735/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGT‑GGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:3169965/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGT‑GGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 1:4493638/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGT‑GGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 2:3158009/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGT‑GGGTTCACCCTCGTATTCGCgg < 1:2853732/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCgg < 1:5106313/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:3168976/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCGACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCgg < 2:4896953/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGt < 2:2309379/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGt < 1:3162551/150‑1 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCAACCGCGAAGACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCAGTCGCGGGTgta > 2:4363272/1‑148 (MQ=255) gTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAACCCGCGAAAACGAGGGT‑GAAACCACCGACGCATTAGCGGGTGaa > 2:4363171/1‑150 (MQ=255) ttGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGT‑GGGTTCACCCTCGTATTCGCGGGTGAAc < 1:4705585/150‑1 (MQ=25) ttGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAc < 2:4431576/150‑1 (MQ=255) tGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAcc < 1:2121703/150‑1 (MQ=255) tGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAcc < 1:2121438/150‑1 (MQ=255) tGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAcc < 1:2121421/150‑1 (MQ=255) gACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGTGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAAccc < 2:1834839/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGc < 2:1055539/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGc < 2:1055605/150‑1 (MQ=255) ccAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGc < 2:4329663/150‑1 (MQ=255) gCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGAACCCCCCAGAACAGGGT‑GTAAACCCCCACGCAATCGCGGGGGTAccccccccg > 1:122817/1‑144 (MQ=255) gTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAAACCCCCAAAAAGAGGGT‑TAACCCACCGAAGCCATAGCGGGTGTAACCGCGCCTGCAgg > 2:2284461/1‑150 (MQ=255) cGACACCATCGCCGCCACCTCCCGAAAGACCCCGCACACGGGCGAAGTGCCGTTGGCTCCTTGATACGGGGCCGGCAGTCGCGGTTTCACCCGCGAATACGCTGGT‑TAACCCACCGCCGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGtt < 2:4896055/150‑1 (MQ=255) catcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCCAAAACGAGGGT‑GTACCCACCGACGCCATCGCGGGTGAAACCGCGCCTGCAGGGTTCGCCGt > 1:5046807/1‑150 (MQ=255) catcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCAACCCCGAAAACGAGGGT‑GAACCCACCGACCCAGTCGCGGGTGTACCCCCTCCAGCCCGGTTAGcccg > 2:3134635/1‑148 (MQ=255) catcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCCCGAAGAACAGGGTGGAACCCACC‑ACCCATGAGGGGGTGTACCCCCACCAGCAGGGGTGGcccg > 1:333441/1‑148 (MQ=255) atcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCCCGAATAACAGGGT‑GAACACACCGACGCAGTAGCGGGTGCACCCCCACCAGCAGGGGTGGCCGTc > 2:2791356/1‑150 (MQ=255) cccTACCGCACGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGAGGGT‑GAACCCACCGCCGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGa < 2:1233931/149‑1 (MQ=38) aCCTACCGCAAGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCTAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGa < 2:1233951/150‑1 (MQ=255) tcccGCAAGACCCCGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGTTAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCTTTGGCGGGTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTa < 2:3079120/148‑1 (MQ=39) tACCGCACGACCCCGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTTATAGGGGGCCTGCTGGAGGGTGTTCACCCGCGAATCCGGGGGT‑GAACCCACCGACGCTTTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTa < 2:4307335/150‑1 (MQ=255) tACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTGACCCCCGAAAACGATGGT‑GAACCCACCCACGCAAACGCGGGTGAACCCGCGCCAGCACGGTTCGCCGTCACCCATTGAATa > 2:3039070/1‑150 (MQ=255) cGCAAGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCTAATACGCGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACtt < 2:4060490/150‑1 (MQ=255) cGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAAACCCCGAAAAAGAGGGT‑GTAAACACCCACGCATTCGCGGGTGAAACCCCGCCGGCAGGGGTCGCCGTCCGCCGATGATTAAtt > 2:2178227/1‑150 (MQ=255) gCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTGACCCCCGAATACGAGGGT‑GGACCCACCCACCCAGTCGCGGGTGAACCCCCGCCGGCAGGGTTAGCCGGCAGCCGATTATTACGTg > 1:2984279/1‑150 (MQ=255) aGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAAGAGGGT‑GTACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCATTGATTAATTTACGATGAcc > 2:5106472/1‑150 (MQ=39) cacaCGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCCGGCGCGGGTTCACCCGCGATTACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCtt < 2:3607448/150‑1 (MQ=39) cgAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGTGTTCACCCGCGAATAGGAGGGT‑GAACCCACCTACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 2:3169358/150‑1 (MQ=255) gAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCCGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtcat > 2:2085372/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTCGCTCCTTGATATGTGGCCTGCTGGCGGGGGTTCACCCGCGAATCCGCGGGT‑GAACCCACCGACGCTTTCGCGGGTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCatcatc < 2:2158018/149‑1 (MQ=255) ccGTTCGCTCCTTTATACGGGGCCTGCAGGAGGGGTTTCACCAGCTAATAGGTGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGTTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCga < 2:1798598/150‑1 (MQ=255) ttCGCTCTTTTAAACGTGGCCTGCTGGAGGGGGTTCACCCGCTAATACGTGGGT‑GAACCCACCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGAt < 1:2825439/150‑1 (MQ=38) gCTCCTTGATATGTGGCCTGCTGGAGCGGGTTCACCCGCTAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGAtgtg < 1:1250604/150‑1 (MQ=255) cTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GACCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTgg < 2:1522367/150‑1 (MQ=255) ccTTGATCAGGGGCCTGCCGGCGGGGGTTCACCCGCTAATCCGCGGGT‑GACCCCCCCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGcc < 2:597301/150‑1 (MQ=255) ttGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTGAGCCGCGAATACGTTGGT‑GTAGCCACCGACGCATTGGCGGGTGAACCCGGTGGTGCGGGGTTGGGCGTGATGCTTTGTTTTCTTGACGTTGACCTTGGGTTTCTTGATGGAGTTGTggggcg > 2:4685531/1‑146 (MQ=255) gCCCGCTGGAGCGGGTCCACCCGCGACATCTTGGGT‑GACCCCCCCGACGCCGTGGGGGGGGCCCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTGGACGATGCCCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCa < 1:3689180/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCaga < 2:2984279/150‑1 (MQ=255) ttcgCGGGTGAACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGaagaag > 1:4910538/4‑150 (MQ=255) ggtgggggATCACCCGCTAATCCGCGGGT‑GACCCCACCGACGCATTCGGGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGaagaag < 1:3134635/145‑1 (MQ=255) ggtgCGGGTTCCCCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGaagaag < 2:4486909/147‑1 (MQ=255) ggcgCGGTTTCACCCGCTAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGaagaag < 2:4477222/147‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCTAATACGCGGTT‑GAACCCACCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt < 2:681087/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCTAATACGAGGGT‑GAACCCACCGATGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt < 1:1144035/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 2:4801032/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGAtg < 1:687155/118‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGAtg > 2:687155/1‑118 (MQ=255) ttCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGAGTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCCGAAGAAGCTGTAGTc > 2:2543331/1‑150 (MQ=255) tCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAg < 2:6926/129‑1 (MQ=255) tCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAg > 1:6926/1‑129 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:3425010/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:1966774/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:4978525/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:181059/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:2780957/1‑150 (MQ=255) acgcgAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:578163/2‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCaccacc > 2:2655176/1‑150 (MQ=255) aaTACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCGCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCt > 2:1754376/1‑150 (MQ=255) aaTACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCt > 1:2377819/1‑150 (MQ=255) tACGCGGGT‑TAACCCACCGACGCATTCGGGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc < 1:4075989/150‑1 (MQ=255) tACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc > 1:1992614/1‑150 (MQ=255) tACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTc > 1:4396939/1‑150 (MQ=255) gAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAg > 1:2380467/1‑150 (MQ=255) gAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAg > 1:461933/1‑150 (MQ=255) gggT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGATATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCt > 2:2679828/1‑150 (MQ=255) ggT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCtt > 2:3550118/1‑150 (MQ=255) aaCCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGACGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGaa < 2:1874070/150‑1 (MQ=255) cccACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgt > 1:3793238/1‑150 (MQ=255) cccACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgt > 1:3793308/1‑150 (MQ=255) ccACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgtg > 2:1821250/1‑150 (MQ=255) ccACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgtg > 1:1531593/1‑150 (MQ=255) cACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAgtgt > 1:3109861/1‑150 (MQ=255) aCCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTc > 2:4751025/1‑150 (MQ=255) aCCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACAACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTc > 2:4767136/1‑150 (MQ=255) aCCCACGCATTCGCGGTTCAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTc < 1:1615859/150‑1 (MQ=255) ccGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCg > 2:3903713/1‑150 (MQ=255) gACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCTCCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGaa < 2:1872564/150‑1 (MQ=255) gACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGaa > 2:4733616/1‑150 (MQ=255) | CTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGT‑GAACCCACCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAGCTTGGAAGTGTCGAA > NC_002947/5538898‑5539194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |