Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,589,790 | A→C | 6.4% | L444R (CTG→CGG) ‡ | parE ← | DNA topoisomerase IV subunit B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,589,790 | 0 | A | C | 6.4% | 664.7 / 26.3 | 202 | L444R (CTG→CGG) ‡ | parE | DNA topoisomerase IV subunit B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (100/89); new base C (4/9); total (104/98) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.21e-01 |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
GGCGAGGATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGATG > NC_002947/5589642‑5589939 | ggCGAGGATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCa < 1:1986686/150‑1 (MQ=255) gAGGATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCgg < 2:3058022/150‑1 (MQ=255) ggATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCa < 1:1418791/150‑1 (MQ=255) gATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATAGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCCTGCCGCTGCGCGGCaa < 1:3533500/150‑2 (MQ=255) aTGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAgg < 1:3422805/150‑1 (MQ=255) cAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATg < 2:4295508/150‑1 (MQ=255) cAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCCTGCCGCTGCGCGGCAAGAtc < 1:3679825/150‑2 (MQ=255) gATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAATGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCTCGGCAATGTTGTGCTCTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGTCAGGATGGc < 2:4632498/150‑1 (MQ=255) tCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCt < 2:966677/150‑1 (MQ=255) ttGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTgg < 1:3307967/150‑1 (MQ=255) tGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGa < 1:450675/150‑1 (MQ=255) gCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGaa < 1:4878765/150‑1 (MQ=255) gCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGaa < 1:4395893/150‑1 (MQ=255) ccATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGAt < 2:4955861/140‑1 (MQ=255) ccATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAAt > 1:2686804/1‑150 (MQ=255) cATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAAtt > 1:4109563/1‑150 (MQ=255) tAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTcc > 1:4057281/1‑150 (MQ=255) aGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCt < 1:3616788/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAg < 1:705408/126‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCtt < 2:2285533/150‑1 (MQ=255) cgcAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTg < 1:3757425/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTccc < 2:4470045/150‑1 (MQ=255) cgcAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCgcgc < 2:3647718/150‑1 (MQ=255) gcAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGcc > 2:1655626/1‑150 (MQ=255) aaGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTg > 1:1117248/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTg < 1:952948/150‑1 (MQ=255) ggTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGc < 1:2358287/150‑1 (MQ=255) ggTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCCAGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGc > 1:4913826/1‑150 (MQ=255) ttGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCTGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCg > 2:797335/1‑150 (MQ=255) ttGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGGGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGACCTCCGTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCg > 2:1744728/1‑150 (MQ=255) gCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGaa < 2:3013415/150‑1 (MQ=255) gCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGaa < 2:2278386/150‑1 (MQ=255) gCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGGCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGaa < 2:3195483/150‑1 (MQ=255) ccGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccac > 1:1533270/1‑150 (MQ=255) ccGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccac > 2:4867416/1‑150 (MQ=255) ccGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccac > 1:4113927/1‑150 (MQ=255) cGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGGTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccacc < 2:2830476/150‑1 (MQ=255) ggATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCg < 2:649619/150‑1 (MQ=255) gATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCgg < 1:1829822/150‑1 (MQ=255) gACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGa < 1:1219757/150‑1 (MQ=255) gACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGa > 1:1327361/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCAcc < 1:155957/150‑1 (MQ=255) aTGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCAccc > 1:4779490/1‑150 (MQ=255) aTGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCAccc < 2:535194/150‑1 (MQ=255) ccACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcga < 1:4647585/150‑1 (MQ=255) aCGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcgacg > 1:2596738/1‑150 (MQ=255) cGGCAATGTTGTGCACGTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcgacga < 2:1149471/150‑1 (MQ=255) cGGCAATGTTGTGCACGTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcgacga < 2:752128/150‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAg < 1:582377/150‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAg < 2:847506/150‑1 (MQ=255) aTGTTGTGCACGTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGtac < 2:4352280/150‑1 (MQ=255) tgttgtGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGaaca > 2:2117737/1‑150 (MQ=255) ggcgaagtCCTGGCCAGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTc > 1:2012595/8‑150 (MQ=255) tgCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCg < 1:3829580/150‑1 (MQ=255) gCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCgg > 1:3925699/1‑150 (MQ=255) cACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGc > 2:1975790/1‑150 (MQ=255) aCTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCa < 2:4568566/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACg > 2:3314683/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACg > 1:3132376/1‑150 (MQ=255) gctggcCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCgg < 2:2300898/150‑1 (MQ=255) cAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGGCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 2:3165014/1‑150 (MQ=255) cAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 1:1019712/1‑150 (MQ=255) cAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 2:7204/1‑150 (MQ=255) cAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 2:3396558/1‑150 (MQ=255) cAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 1:2148800/1‑150 (MQ=255) gACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGcc > 1:1681301/1‑150 (MQ=255) ttCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:2974882/1‑150 (MQ=255) ttCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:965389/1‑150 (MQ=255) ttCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 1:4313849/1‑150 (MQ=255) ttCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:4747581/1‑150 (MQ=255) ttCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:350995/1‑150 (MQ=255) tCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGca > 1:2458691/1‑150 (MQ=255) taccGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAAt > 2:2356901/3‑150 (MQ=255) cccGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATc < 2:4254432/150‑1 (MQ=255) ccGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCg < 2:1591511/150‑1 (MQ=255) tCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGcc > 1:3096571/1‑150 (MQ=255) tCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGAGGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGcc < 2:2153186/150‑1 (MQ=255) tCCACGTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGcc < 2:3894698/150‑1 (MQ=255) cACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAg > 2:4733636/1‑150 (MQ=255) aCTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGc > 2:673067/1‑150 (MQ=255) gtCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCtt < 1:3991132/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGcc > 1:2987743/1‑150 (MQ=255) gtgtTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGc > 1:1998527/1‑150 (MQ=255) gtgtTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGc < 2:4109599/150‑1 (MQ=255) ttGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAAt > 2:1554691/1‑150 (MQ=255) ggccaTCCTGCCGCTGCGCGGCAAGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGc > 2:4398665/5‑150 (MQ=255) gAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGc > 1:686428/1‑150 (MQ=255) gAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGc > 2:586287/1‑150 (MQ=255) aGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGcc > 2:3767637/1‑150 (MQ=255) aGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGcc > 1:1170006/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCgg > 1:3613422/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCgg > 1:2674119/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCgg > 2:331750/1‑150 (MQ=255) aTCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCggg > 1:979640/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCCGCTGCGCGGCAAGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCggg > 2:1012261/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGACAGCTTGCAGGGCAATGCCGGGCCCTggg > 1:133450/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGt > 1:232764/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGt < 2:4057281/150‑1 (MQ=255) gcAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGa < 1:2633628/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGAt < 1:756974/150‑1 (MQ=255) | GGCGAGGATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCG‑CCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGATG > NC_002947/5589642‑5589939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |