| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,589,797 | G→A | 5.6% | L442L (CTG→TTG) | parE ← | DNA topoisomerase IV subunit B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,589,797 | 0 | G | A | 5.6% | 608.9 / 16.4 | 195 | L442L (CTG→TTG) | parE | DNA topoisomerase IV subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (101/82); new base A (4/7); total (105/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
GATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGATGCGCTTGC > NC_002947/5589648‑5589946 | gATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAg > 2:2050782/1‑150 (MQ=255) aTGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAgg < 1:3422805/150‑1 (MQ=255) tGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCCTGCCGCTGCGCGGCAAGa < 2:639129/150‑1 (MQ=255) gCAGATCTTGCCGTAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCCTGCCGCTGCGCGGCAAGAt < 2:666135/150‑1 (MQ=255) gCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGAt < 1:730024/150‑1 (MQ=255) cAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATg < 2:4295508/150‑1 (MQ=255) cAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATg > 2:3963668/1‑150 (MQ=255) cAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCCTGCCGCTGCGCGGCAAGAtc < 1:3679803/150‑2 (MQ=255) aGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATgg > 1:1414873/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAATGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCTCGGCAATGTTGTGCTCTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGTCAGGATGGc < 2:4632498/150‑1 (MQ=255) gATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGc < 1:976485/150‑1 (MQ=255) tCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCt < 2:966677/150‑1 (MQ=255) cTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGATTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTg < 1:4071850/150‑1 (MQ=255) ttGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTgg < 1:3307967/150‑1 (MQ=255) tGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGa < 1:450675/150‑1 (MQ=255) gCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGaa < 1:4878765/150‑1 (MQ=255) ccATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGAt < 2:4955861/140‑1 (MQ=255) cATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAAtt > 1:4109599/1‑150 (MQ=255) aGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCt < 1:3616756/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCtt < 2:2285533/150‑1 (MQ=255) cgcAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTg < 2:164701/150‑1 (MQ=255) gCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTccc < 2:4470045/150‑1 (MQ=255) cgcAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCgcgc < 2:3647718/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTgg < 2:1880501/150‑1 (MQ=255) ggTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGc < 1:2358287/150‑1 (MQ=255) ggTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCCAGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGc > 1:4913826/1‑150 (MQ=255) gTTGCTCCCGGATCGACGCCAATGGCAACGGCATTGTTGTGCACGTCCTGGCTGGCGAGTACCTCGCCCCCGGCCACTTCACAGGTGTTGCGGATCTTGCCGCGGAGCTGCATGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGATTGGcc < 2:3182564/150‑1 (MQ=255) ttGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCTGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCg > 2:797335/1‑150 (MQ=255) gCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGaa < 2:3013415/150‑1 (MQ=255) gCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGaa < 2:2278386/150‑1 (MQ=255) cACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAac < 2:3498475/150‑1 (MQ=255) ccGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccac > 1:1533270/1‑150 (MQ=255) ccGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccac > 2:4867416/1‑150 (MQ=255) ccGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccac > 1:1148034/1‑150 (MQ=255) cGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGGTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAaccacc < 2:2830476/150‑1 (MQ=255) gATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCgg < 1:1829822/150‑1 (MQ=255) gACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGa > 1:1326973/1‑150 (MQ=255) gACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGa < 2:2136636/150‑1 (MQ=255) gCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTc < 1:3849558/150‑1 (MQ=255) gCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTCCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTc > 1:3691968/1‑150 (MQ=255) cAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCAc > 1:843859/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCAcc < 1:155957/150‑1 (MQ=255) aTGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCAccc > 1:4779490/1‑150 (MQ=255) ccACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcga < 1:4647585/150‑1 (MQ=255) aCGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcgacg > 1:2596738/1‑150 (MQ=255) cGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcgacga < 1:436598/150‑1 (MQ=255) cGGCAATGTTGTGCACGTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcgacga < 2:5089031/150‑1 (MQ=255) cGGCAATGTTGTGCACGTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTcgacga < 2:752128/150‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAg < 2:847506/150‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAg < 1:582377/150‑1 (MQ=255) aTGTTGTGCACGTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGtac < 2:4352280/150‑1 (MQ=255) gttgtGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGaacaa > 1:417441/1‑150 (MQ=255) ggcgaagtCCTGGCCAGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTc > 1:2012595/8‑150 (MQ=255) tgCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCg < 1:3829442/150‑1 (MQ=255) aCTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCa < 2:4568566/150‑1 (MQ=255) cTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCAc < 2:4265831/150‑1 (MQ=255) agtCCTGGCCAGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCAc > 2:421356/3‑150 (MQ=255) ttCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACg > 2:3204354/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACg > 1:3132376/1‑150 (MQ=255) tggctggcCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATc > 2:146600/1‑150 (MQ=255) ggctggcCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCg < 2:1570072/150‑1 (MQ=255) gctggcCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCgg < 2:2300898/150‑1 (MQ=255) gctggcCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCgg < 2:1135368/150‑1 (MQ=255) ccAGGACTTCGCCCCCTTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACACCTCGGCACGCATCGGGTCCt < 1:2663571/150‑1 (MQ=255) ccAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCt > 2:574724/1‑150 (MQ=255) cAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 2:7204/1‑150 (MQ=255) cAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 1:1019712/1‑150 (MQ=255) cAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTg > 1:2148800/1‑150 (MQ=255) gACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGcc > 1:1681301/1‑150 (MQ=255) aCTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCt < 2:3367783/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCcgc > 1:4422018/1‑76 (MQ=255) ttCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:3104761/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:4747581/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:2974882/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGc > 2:965389/1‑150 (MQ=255) tCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGca > 1:2458691/1‑150 (MQ=255) taccGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAAt > 2:2356901/3‑150 (MQ=255) cccGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATc < 2:1674937/150‑1 (MQ=255) tCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGcc > 1:3096571/1‑150 (MQ=255) ccACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCa < 1:1044509/150‑1 (MQ=255) ccACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCa > 2:2168595/1‑150 (MQ=255) cACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAg > 2:4733636/1‑150 (MQ=255) gtCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCtt < 1:1195797/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGcc > 1:2987743/1‑150 (MQ=255) cAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCACGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCg > 1:2677194/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCggg < 1:3996052/150‑1 (MQ=255) gtgtTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGc < 2:4109563/150‑1 (MQ=255) gtgtTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGc > 1:1998527/1‑150 (MQ=255) ggccaTCCTGCCGCTGCGCGGCAAGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGc > 2:4398665/5‑150 (MQ=255) gAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGc > 1:686428/1‑150 (MQ=255) aGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGcc > 2:3767637/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCgg > 2:331678/1‑150 (MQ=255) gATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCgg > 1:3613271/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCCGCTGCGCGGCAAGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCggg > 2:1012246/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGt > 1:232764/1‑150 (MQ=255) cgcAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTg < 1:3963668/150‑1 (MQ=255) gcAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGa < 1:2633628/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGAtg > 1:132962/1‑150 (MQ=255) gCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGAtgc > 1:2696668/1‑150 (MQ=255) cAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGAtgcgctt < 2:3855776/150‑1 (MQ=255) | GATGCAGATCTTGCCATAGCGCAGCTGCGCAAGGTCGGTTGCACCCGGATCGACGCCAATGGCCACGGCAATGTTGTGCACTTCCTGGCTGGCCAGGACTTCGCCCCCGTCCACTTCCCAGGTGTTGAGGATCTTGCCGCGCAGCGGCAGGATGGCCTGGAATTCCTTGTCCCGCGCCTGCTTGGCCGAACCACCGGCCGAGTCACCCTCGACGAGGAACAACTCGGCACGCATCGGGTCCTGGCCTGCACAATCGGCCAGCTTGCCGGGCAATGCCGGGCCCTGGGTGATGCGCTTGC > NC_002947/5589648‑5589946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |