Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,634,813 | 0 | C | A | 9.9% | 577.5 / 39.0 | 181 | A790A (GCC→GCA) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/86); new base A (10/8); total (87/94) | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GTGCGTGAAGCCGTGGACTTCCTGCGCTACTACGCGGTGCAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCC > NC_002947/5634664‑5634961 | gTGCGTGAAGCCGTGGACTTCCTGCGCTACTACGCGGTGCAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGcc < 2:1950851/150‑1 (MQ=255) tGCGTGAAGCCGTGGACTTCCTGCGCTACTACGCGGTGCAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGccc < 2:2179443/150‑1 (MQ=255) gCGTGAAGCCGTGGACTTCCTGCGCTACTACGCGGTGCAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCt < 2:4480187/150‑1 (MQ=255) 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cGATCTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCgg < 1:1834118/150‑1 (MQ=255) gATCTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCggg < 1:583127/150‑1 (MQ=255) cTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTgg < 1:3349053/50‑1 (MQ=255) ttCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGATGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgc > 2:4294971/1‑150 (MQ=255) ttCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgc > 1:1306239/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgcg < 1:3036743/150‑1 (MQ=255) aCCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGt < 1:2328557/150‑1 (MQ=255) aCCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGt < 1:553531/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCCGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGa > 1:2859282/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGaa < 2:1573634/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGaaa < 1:4350901/150‑1 (MQ=255) gTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTc > 2:1134314/1‑150 (MQ=255) ggCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCgg > 1:4023915/1‑150 (MQ=255) gCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTg < 1:1801302/97‑1 (MQ=255) gCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGcc > 2:2604952/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGACCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCg < 2:3222813/150‑1 (MQ=255) cccTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGcc > 1:2233845/1‑150 (MQ=255) | GTGCGTGAAGCCGTGGACTTCCTGCGCTACTACGCGGTGCAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCC‑GCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCC > NC_002947/5634664‑5634961 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |