Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,634,852 | G→A | 9.6% | E803E (GAG→GAA) | putA → | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,634,852 | 0 | G | A | 9.6% | 538.5 / 34.8 | 188 | E803E (GAG→GAA) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (78/92); new base A (10/8); total (88/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACC > NC_002947/5634703‑5634999 | cAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAg < 1:4962001/150‑1 (MQ=255) cAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAg > 1:4227094/1‑150 (MQ=255) aGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGc < 2:3271455/150‑1 (MQ=255) aGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGc < 2:3712618/150‑1 (MQ=255) ggCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCa > 1:3743860/1‑150 (MQ=255) ggCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCa > 2:553531/1‑150 (MQ=255) cACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCaaa < 1:4029810/150‑1 (MQ=255) aaCGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCa > 1:467200/1‑150 (MQ=255) aaCGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCa < 2:4455012/150‑1 (MQ=255) aCGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCAc > 1:3664646/1‑150 (MQ=255) gACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTg > 2:3649632/1‑150 (MQ=255) aCTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGa < 2:2986735/150‑1 (MQ=255) ttCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATc > 1:3122268/1‑150 (MQ=255) aGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATcgcc < 2:3125392/150‑1 (MQ=255) gCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATcgccg < 2:907219/150‑1 (MQ=255) gCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATcgccg > 2:4809428/1‑150 (MQ=255) acgCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAgg < 1:4017506/150‑1 (MQ=255) ccaccgcccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGt < 2:405030/150‑1 (MQ=255) caccgcccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTg > 1:2618651/1‑150 (MQ=255) gcccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGcc > 1:2809872/1‑150 (MQ=255) cccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCct < 2:853219/150‑1 (MQ=255) cccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCct < 1:1786594/150‑1 (MQ=255) cccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCct > 1:2481290/1‑150 (MQ=255) cTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctg < 2:4557949/150‑1 (MQ=255) tGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgc < 2:2704405/150‑1 (MQ=255) tGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgc < 1:3628744/150‑1 (MQ=255) gggTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgct < 1:272416/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAg > 2:2637233/1‑150 (MQ=255) gtggtgTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCt > 2:1271300/1‑150 (MQ=255) tggtgTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTg < 2:782071/150‑1 (MQ=255) tggtgTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTg < 2:1335368/150‑1 (MQ=255) tgtctgtaTCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTgg < 2:3439297/143‑1 (MQ=255) tgtgCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCa < 1:425761/150‑1 (MQ=255) 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aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGaa < 1:3437117/150‑1 (MQ=255) aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGaa < 2:2096776/150‑1 (MQ=255) aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGaa < 1:2587214/150‑1 (MQ=255) aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgcc < 1:4747502/150‑5 (MQ=255) cccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgccgt > 1:1852393/1‑144 (MQ=255) ccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGc < 1:4781860/150‑1 (MQ=255) ccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGc < 2:4591389/150‑1 (MQ=255) ccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgccgat > 2:2326872/1‑143 (MQ=255) ccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgccgat > 1:975042/1‑143 (MQ=255) cATGGAACTTCCTGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCg > 2:4350901/1‑150 (MQ=255) aTGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGt > 1:4301502/1‑150 (MQ=255) aTGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGt > 2:2906225/1‑150 (MQ=255) ggAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGtgc < 1:965177/150‑1 (MQ=255) ggAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGtgc > 2:1218358/1‑150 (MQ=255) ggAACGTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCGTCCCAGAAGGCGtgc < 2:2407281/150‑1 (MQ=255) 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ttCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgc > 1:1306239/1‑150 (MQ=255) cACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCgg > 1:4392320/1‑150 (MQ=255) tgcGGCCACCTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGt > 2:4733025/3‑150 (MQ=255) aCCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGt < 1:553531/150‑1 (MQ=255) cGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCCGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGa > 1:2859282/1‑150 (MQ=255) 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ccGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGgag > 2:1007724/1‑150 (MQ=255) cGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGgaga < 1:72586/150‑1 (MQ=255) ggCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGACACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGAc > 2:3019951/1‑150 (MQ=255) cAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGa < 1:4561706/150‑1 (MQ=255) cAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGa < 1:1048190/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAgc < 1:1040704/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAgc < 2:3778457/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAgc < 2:4917057/150‑1 (MQ=255) cGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGcgcg > 2:1813226/1‑150 (MQ=255) cTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCaaa < 1:868065/150‑1 (MQ=255) ggCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCt < 2:4864357/64‑1 (MQ=255) ggCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCt > 1:4864357/1‑64 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGc < 1:4131838/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTg > 1:277389/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGAt < 1:2338972/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCTCCTGCTGCTGGAAGCTGTCATCCCTGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGGGGTTAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCTCGTCAAAGGCGTGATg < 2:4207873/150‑1 (MQ=255) cTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGt < 2:1550655/150‑1 (MQ=255) cGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCAc > 2:2608196/1‑150 (MQ=255) gAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCAcc < 1:3648339/150‑1 (MQ=255) gAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCAcc < 1:3648445/150‑1 (MQ=255) gAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCAcc > 1:2961410/1‑150 (MQ=255) | CAGGCACGTAACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACC > NC_002947/5634703‑5634999 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |