| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 5,634,861 | A→G | 10.1% | P806P (CCA→CCG) | putA → | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,634,861 | 0 | A | G | 10.1% | 502.9 / 33.8 | 178 | P806P (CCA→CCG) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (73/86); new base G (10/8); total (83/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
AACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGA > NC_002947/5634712‑5635010 | aaCGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCa < 2:4455012/150‑1 (MQ=255)aaCGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCa > 2:565944/1‑150 (MQ=255)aaCGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCa > 1:467200/1‑150 (MQ=255) aCTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGa > 1:3222813/1‑150 (MQ=255) aCTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGa < 2:2986735/150‑1 (MQ=255) aGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATcgcc < 2:3125392/150‑1 (MQ=255) gCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATcgccg < 2:907219/150‑1 (MQ=255) acgCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAgg < 1:4017506/150‑1 (MQ=255) 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acTTGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgct > 1:2680576/1‑150 (MQ=255) cTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctg < 2:4557949/150‑1 (MQ=255) tGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgc < 2:2704405/150‑1 (MQ=255) tGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgc < 1:3628744/150‑1 (MQ=255) ggggTCCGGGGGGGGGCATCAGCCCCTGGACCGTCCCGCTGGCGATCGTCACCGGCCAGGGGGCCGCAGCCCGGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgc < 2:4002969/149‑1 (MQ=255) 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cTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCaaa < 1:1439690/150‑1 (MQ=255) cTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCaaa < 1:868065/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGc > 1:3650794/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGc < 1:4131838/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTg < 2:4299665/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTg > 1:277414/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGAt < 1:2338972/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGAt > 2:1563059/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATg < 1:3678623/150‑1 (MQ=255) cGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCAc > 1:2564194/1‑150 (MQ=255) 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aCTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGa > 2:2882980/1‑150 (MQ=255) | AACGACTTCAGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGA > NC_002947/5634712‑5635010 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |