| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,634,870 | C→A | 9.9% | A809A (GCC→GCA) | putA → | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,634,870 | 0 | C | A | 9.9% | 576.7 / 38.4 | 180 | A809A (GCC→GCA) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (73/89); new base A (10/8); total (83/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
AGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTGGCCC > NC_002947/5634721‑5635018 | aGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATcgcc < 2:3125392/150‑1 (MQ=255) gCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATcgccg < 2:907219/150‑1 (MQ=255) ccaccgcccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGt > 1:960160/1‑150 (MQ=255) caccgcccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTg > 1:2618651/1‑150 (MQ=255) caccgcccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGCAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGACGCCCAGGCCGTg > 1:4207873/1‑150 (MQ=255) gcccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGcc > 1:2809872/1‑150 (MQ=255) cccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCct > 2:1677898/1‑150 (MQ=255) cccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCct < 2:853219/150‑1 (MQ=255) cccacTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCct > 1:2481290/1‑150 (MQ=255) cTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctg < 2:4557949/150‑1 (MQ=255) tGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgc < 1:3628744/150‑1 (MQ=255) ggggTCCGGGGGGGGGCATCAGCCCCTGGACCGTCCCGCTGGCGATCGTCACCGGCCAGGGGGCCGCAGCCCGGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgc < 2:4002969/149‑1 (MQ=255) gggTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgct < 1:272416/150‑1 (MQ=255) ggTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCctgctgctg > 2:4864242/1‑150 (MQ=255) cTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAg > 2:2637233/1‑150 (MQ=255) gtggtgTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCt > 2:1271300/1‑150 (MQ=255) tggtgTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTg < 2:782071/150‑1 (MQ=255) tggtgTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTg < 2:1335368/150‑1 (MQ=255) tgtctgtaTCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTgg < 1:138168/143‑1 (MQ=255) tgtctgtaTCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTgg < 2:3439297/143‑1 (MQ=255) gtctgtaTCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGc > 1:2861139/7‑150 (MQ=255) tgtgCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCa < 1:425761/150‑1 (MQ=255) tctgtaTCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCGCGATGCTGGCa > 1:5090142/6‑150 (MQ=255) aTCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCa < 2:3381624/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCa > 1:4176707/1‑150 (MQ=255) cAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgc < 2:3750790/150‑4 (MQ=255) aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGaa < 1:3437117/150‑1 (MQ=255) aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGaa < 1:2587214/150‑1 (MQ=255) aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGaa < 2:2096776/150‑1 (MQ=255) aGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgcc < 1:4747502/150‑5 (MQ=255) gCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgccg > 2:2257151/1‑145 (MQ=255) ccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGc < 2:4591389/150‑1 (MQ=255) ccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGc < 1:4781860/150‑1 (MQ=255) ccATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGATTGCAGCAGCACTTGTTGCTGGCAATCCGGTTCTGGCAAAGCCTGCCGAAGAAACCCCGCTGATTGCAGCGCAGGGCGTTCGCATTCTGCACGATGCTGGCATtcctgccgat > 1:975164/1‑143 (MQ=255) cATGGAACTTCCTGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCg > 2:4350901/1‑150 (MQ=255) aTGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGt > 2:2906225/1‑150 (MQ=255) aTGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGt > 1:4301502/1‑150 (MQ=255) ggAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGtgc < 1:965205/150‑1 (MQ=255) tCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAgc < 2:882215/150‑1 (MQ=255) cccGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAgct < 1:1259877/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGctgctg > 1:255452/1‑150 (MQ=255) cGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCgg < 1:1834118/150‑1 (MQ=255) cGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCgg < 1:3307764/150‑1 (MQ=255) gATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCggg < 1:583127/150‑1 (MQ=255) aTCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGc > 1:4791837/1‑150 (MQ=255) ttCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGATGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgc > 2:4294971/1‑150 (MQ=255) ttCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgc < 1:2269900/150‑1 (MQ=255) tCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgcg < 1:3036743/150‑1 (MQ=255) tCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCcgcg > 1:1873147/1‑150 (MQ=255) cACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCgg > 1:4392320/1‑150 (MQ=255) tgcGGCCACCTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGt > 2:4733025/3‑150 (MQ=255) cGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCCGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGa > 1:2859282/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGaa < 2:1573501/150‑1 (MQ=255) gCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGaaa < 1:1717184/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCACGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTc < 2:2346269/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTc > 2:1134314/1‑150 (MQ=255) ggCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCgg > 1:4023915/1‑150 (MQ=255) gCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTg < 1:1801302/97‑1 (MQ=255) gCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGt > 2:3204319/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGcc > 2:2604952/1‑150 (MQ=255) cccTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGcc > 1:2233845/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTg > 1:2108553/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTg < 1:325405/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTg > 1:3388482/1‑150 (MQ=255) gCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGga < 2:1568793/150‑1 (MQ=255) cGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGgaga < 1:72586/150‑1 (MQ=255) ggCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGACACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGAc > 2:3019951/1‑150 (MQ=255) cAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGa < 1:1048190/150‑1 (MQ=255) cAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGa < 1:4561706/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAgc < 1:1040704/150‑1 (MQ=255) aCCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAgc < 2:4917057/150‑1 (MQ=255) ccGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAgcgc > 2:4913126/1‑150 (MQ=255) cGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGcgcg > 2:1813033/1‑150 (MQ=255) tACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCa > 2:4188666/1‑150 (MQ=255) cTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCaaa < 1:868065/150‑1 (MQ=255) cTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCaaa < 1:1439690/150‑1 (MQ=255) ggCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCt > 1:4864357/1‑64 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGc < 1:4131838/150‑1 (MQ=255) gCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGc > 1:3650794/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTg < 2:4299665/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTg > 1:277389/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGAt < 1:2338972/150‑1 (MQ=255) cTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGt < 2:1550655/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCa < 1:570645/150‑1 (MQ=255) cGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCAc > 2:2608196/1‑150 (MQ=255) gAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCAcc < 1:3648339/150‑1 (MQ=255) cAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGc > 2:760741/1‑150 (MQ=255) aaCCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTc > 1:3955315/1‑150 (MQ=255) cccACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCAc > 2:2947346/1‑150 (MQ=255) cccACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCAc > 1:1794578/1‑150 (MQ=255) ccACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACt < 1:1267156/150‑1 (MQ=255) cTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACTGGCTCCACTGaa < 1:4669074/150‑1 (MQ=255) tGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAg > 2:1913340/1‑150 (MQ=255) tGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAg > 1:3482383/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTg < 2:4759368/150‑1 (MQ=255) aTCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTg > 2:629069/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCGGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTgg < 1:3250156/150‑1 (MQ=255) cgccgcCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTGGc < 2:2809872/150‑1 (MQ=255) gccgccCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTGGcc > 1:252497/1‑150 (MQ=255) ccgccCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTGGccc < 2:4227094/150‑1 (MQ=255) | AGCAACGACGCCCACCGCCCACTGGGTCCTGTGGTGTGCATCAGCCCATGGAACTTCCCGCTGGCGATCTTCACCGGCCAGGTGGCCGCAGCCCTGGCTGCCGGCAACCCGGTACTGGCCAAGCCTGCCGAGCAAACCCCACTGATCGCCGCCCAGGCCGTGCGCCTGCTGCTGGAAGCTGGCATCCCAGAAGGCGTGCTGCAGCTGCTGCCGGGCCGCGGTGAAACTGTCGGTGCCGGCCTGGTCGGAGACGAGCGCGTCAAAGGCGTGATGTTCACCGGCTCCACTGAAGTGGCCC > NC_002947/5634721‑5635018 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |