| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 471,702 | G→A | 21.1% | N412N (AAC→AAT) | rpoD ← | RNA polymerase sigma 70 factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 471,702 | 0 | G | A | 21.1% | 376.6 / 96.0 | 185 | N412N (AAC→AAT) | rpoD | RNA polymerase sigma 70 factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (90/56); new base A (22/17); total (112/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TCTCGATCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATT > NC_002947/471554‑471849 | tctcGATCATGTGCACTGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGt > 1:4458993/1‑150 (MQ=255)tctcGATCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGt > 2:3514725/1‑150 (MQ=255)tctcGATCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGt > 2:1649865/1‑150 (MQ=255) ttcGATCATGTGCACCGGAATACGGATGGTGCGCGCCTGATCGGCAATCGAACGGGTGATTGCCTGACGAATCCACCATGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATAtt < 1:3028926/149‑1 (MQ=255) ctcGATCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGtt < 1:1254666/150‑1 (MQ=255) ctcGATCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGtt < 1:3839221/150‑1 (MQ=255) gatgatGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGcc > 1:2905263/1‑150 (MQ=255) aTCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCt < 1:1514430/150‑1 (MQ=255) tCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCtt > 1:551081/1‑150 (MQ=255) tgtgCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCt > 2:2595459/1‑150 (MQ=255) tgCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTgg > 1:2150717/1‑150 (MQ=255) cACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGAt < 2:2181212/150‑1 (MQ=255) cGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAg < 1:4013535/150‑1 (MQ=255) gAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAggn < 1:2952862/150‑2 (MQ=255) gCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGAGGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAg > 2:2684145/1‑150 (MQ=255) cGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAgg > 1:3349699/1‑150 (MQ=255) ggATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGa > 2:4129842/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACgg < 2:3714058/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGt < 1:4336995/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGt < 1:1211491/150‑1 (MQ=255) ggCAATCGAACGGGTGATTGCCTGACGAATCCACCATGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGgt > 1:4566644/1‑150 (MQ=255) gCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGgtg > 1:3170611/1‑150 (MQ=255) gATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTa < 2:4537645/150‑1 (MQ=255) gATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTa > 1:2662900/1‑150 (MQ=255) aaCGGGTGATTGCCTGACGAATCCACCATGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAGTAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTActtct < 1:1336924/150‑1 (MQ=255) aaCGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTActtct > 1:2180232/1‑150 (MQ=255) aaCGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTActtct > 1:4606971/1‑150 (MQ=255) aCGGGTGATTGCCTGACGAATCCACCATGTCGCATAGGTCGATAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTActtctt < 2:4726154/150‑1 (MQ=255) aCGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTActtctt > 1:1898858/1‑150 (MQ=255) cGGGTGATTGCCTGACGAATCCACCATGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTg < 1:1943942/150‑1 (MQ=255) gggTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTAcagatcgg > 1:4707737/1‑143 (MQ=255) gggTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTgg < 2:2055879/150‑1 (MQ=255) tGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGa < 1:4100305/150‑1 (MQ=255) gATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGAt > 1:1481083/1‑150 (MQ=255) gATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGAt < 1:2307150/150‑1 (MQ=255) gCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGaa < 1:2871128/150‑1 (MQ=255) gCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGaa > 1:809878/1‑150 (MQ=255) aCGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCAc < 2:3743698/150‑1 (MQ=255) ggATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCa > 2:1877912/1‑150 (MQ=255) ggATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCa > 1:2447889/1‑150 (MQ=255) ggATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCa > 1:2447891/1‑150 (MQ=255) gATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAg > 2:401614/1‑150 (MQ=255) tCCACCATGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGAc < 2:4566644/150‑1 (MQ=255) tCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGAc < 2:381979/150‑1 (MQ=255) ccaccaTGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACg > 2:4448422/1‑150 (MQ=255) accaGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCa > 2:1377953/1‑150 (MQ=255) ccaTGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAg > 1:1359548/1‑150 (MQ=255) caGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAgg < 1:2101830/150‑1 (MQ=255) tgtcgCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGtt < 1:4936859/146‑1 (MQ=255) gCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTgg > 1:3948671/1‑121 (MQ=255) gCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTgg < 2:3948671/121‑1 (MQ=255) aTAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTc > 1:1044320/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTcca > 2:8517/1‑148 (MQ=255) aGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTcca > 2:248898/1‑148 (MQ=255) ggTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGAc > 1:4348688/1‑150 (MQ=255) gTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGAcc < 2:496560/150‑1 (MQ=255) tCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCa > 1:3397010/1‑150 (MQ=255) tCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTccacca > 1:1717221/1‑150 (MQ=255) gagaACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtt > 1:4602312/1‑150 (MQ=255) gagaACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtt > 1:3332406/1‑150 (MQ=255) gagaACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtt > 2:1152978/1‑150 (MQ=255) gagaACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtt > 2:1741335/1‑150 (MQ=255) gagaACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCAtt < 1:36940/150‑1 (MQ=255) agaACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAttt < 1:3410817/150‑1 (MQ=255) aaCTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCAtttcc > 2:617735/1‑149 (MQ=255) aaCTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCAtttcc < 1:1774463/150‑2 (MQ=255) aCTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtttctt < 1:3620737/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtttcttt < 1:2595459/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtttcttt > 1:848347/1‑150 (MQ=255) gTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTtctttctt < 2:3007675/150‑1 (MQ=255) cacgacgaTATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcga < 2:586251/148‑2 (MQ=255) cacgacgaTATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcga > 2:694541/3‑149 (MQ=255) gcgACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGcgcg > 2:1498789/1‑150 (MQ=255) gcgACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCGTGGcgcg < 2:4348688/150‑1 (MQ=255) acgacgaTATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcgat > 1:513995/2‑148 (MQ=255) gACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCgcggc < 1:1998942/150‑1 (MQ=255) gACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCgcggc < 1:1998897/150‑1 (MQ=255) gACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcgatgg < 1:4252037/150‑5 (MQ=255) cGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGcggcgg < 2:4628271/150‑1 (MQ=255) tATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGcc < 2:143161/150‑1 (MQ=255) tATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGcc > 2:1847287/1‑150 (MQ=255) ttCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCtt < 1:2880364/150‑1 (MQ=255) ttCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCtt > 1:3214520/1‑150 (MQ=255) gAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGtt < 2:2263055/72‑1 (MQ=255) gAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGc > 2:4920223/1‑150 (MQ=255) ttGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCa > 2:513965/1‑150 (MQ=255) tGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCAc < 2:5079537/150‑1 (MQ=255) cACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGAt > 1:1014137/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATc < 2:3833862/150‑1 (MQ=255) aCCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATc > 1:4574120/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATc > 2:5046623/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTTCATCAGACCGATGGTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATc < 1:2707349/150‑1 (MQ=255) ccGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCg > 1:5028225/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAAcga < 2:128071/90‑3 (MQ=255) atcaGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGa > 1:4830320/1‑150 (MQ=255) tcaGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGAc > 2:1465354/1‑150 (MQ=255) aGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACgg > 1:2413329/1‑150 (MQ=255) aCCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGtt > 2:4465237/1‑150 (MQ=255) aCCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGACTTCACCGATCGACATGCGACGGtt > 1:1522678/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGAtt > 2:4797262/1‑150 (MQ=255) | TCTCGATCATGTGCACCGGAATGCGGATGGTGCGTGCCTGGTCGGCGATCGAACGGGTGATCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATT > NC_002947/471554‑471849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |