| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 471,762 | G→C | 14.3% | S392S (TCC→TCG) | rpoD ← | RNA polymerase sigma 70 factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 471,762 | 0 | G | C | 14.3% | 477.3 / 62.7 | 169 | S392S (TCC→TCG) | rpoD | RNA polymerase sigma 70 factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (83/61); new base C (15/9); total (99/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCTTCTGTTGGC > NC_002947/471614‑471910 | gCCTGACGAATCCACCATGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGag > 1:2055507/1‑149 (MQ=255) cTGACGAATCCACCATGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGAt > 2:643332/1‑150 (MQ=255) aCGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCAc < 2:3743698/150‑1 (MQ=255) aCGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCAc < 2:1693023/150‑1 (MQ=255) ggATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCa > 2:1877912/1‑150 (MQ=255) ggATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCa > 1:2447891/1‑150 (MQ=255) ggATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCa > 1:2447889/1‑150 (MQ=255) tCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGAc < 2:381979/150‑1 (MQ=255) ccaccaTGTCGCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACg > 2:4448516/1‑150 (MQ=255) tgtcgCATAGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGtt < 1:534979/146‑1 (MQ=255) aTAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTc > 1:1044320/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAGAACTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTcca > 2:8517/1‑148 (MQ=255) ggTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGAc > 1:4348688/1‑150 (MQ=255) gTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGAcc < 2:496560/150‑1 (MQ=255) gagaACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtt > 1:3332406/1‑150 (MQ=255) aaCTTGTAACCACGACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCAtttcc > 2:617735/1‑149 (MQ=255) aCTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtttctt > 2:2595812/1‑150 (MQ=255) aCTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtttctt < 1:3620737/150‑1 (MQ=255) cTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAtttcttt > 1:848347/1‑150 (MQ=255) gTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTtctttctt < 2:3007675/150‑1 (MQ=255) cacgacgaTATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcga > 1:1739489/3‑149 (MQ=255) cacgacgaTATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcga > 2:694541/3‑149 (MQ=255) cacgacgaTATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcga < 2:586251/148‑2 (MQ=255) gcgACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGcgcg > 1:268462/1‑150 (MQ=255) gcgACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCGTGGcgcg < 2:4348688/150‑1 (MQ=255) acgacgaTATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcgat > 1:513995/2‑148 (MQ=255) gACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCgcggc < 1:1998942/150‑1 (MQ=255) gACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcgatgg > 1:3979959/1‑146 (MQ=255) gACGATATTCGAACTTATCGACCGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAACGAGACGAAGGTTGGCTTCCACCATTTCCTTCTTGgcgatgg < 1:4252037/150‑5 (MQ=255) aCGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCgcggcg > 1:3090263/1‑150 (MQ=255) tATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGcc < 2:143161/150‑1 (MQ=255) ttCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCtt > 1:3409258/1‑150 (MQ=255) ttCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCtt > 1:3214520/1‑150 (MQ=255) ttCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCtt < 1:2880364/150‑1 (MQ=255) ttCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCtt > 1:1978682/1‑150 (MQ=255) gAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGc > 2:4920223/1‑150 (MQ=255) gAACTTGTCCACCGCTGTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGc > 2:2181473/1‑150 (MQ=255) aaCTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCt > 2:3825144/1‑150 (MQ=255) aaCTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCt > 2:1765385/1‑150 (MQ=255) ttGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCa > 2:3476254/1‑150 (MQ=255) ttGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCa > 2:513965/1‑150 (MQ=255) tGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCAc < 2:5079537/150‑1 (MQ=255) cACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGAt > 1:1014137/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATc > 1:458001/1‑150 (MQ=255) aCCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATc > 2:5046623/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTCATCAGACCGATATTGCCTTCCTGAATAAGATCGAGGAACTGAAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCAATCGAGATAAcga > 1:128071/1‑88 (MQ=255) ttCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATg > 1:4538688/1‑150 (MQ=255) atcaGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGa > 1:4830320/1‑150 (MQ=255) tcaGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGAc > 2:4574938/1‑150 (MQ=255) tcaGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGAc > 2:1465354/1‑150 (MQ=255) aGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACgg > 1:2413329/1‑150 (MQ=255) aGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACgg > 1:4645806/1‑150 (MQ=255) aCCGATGTTGTCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGtt < 1:4999756/150‑1 (MQ=255) aCCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGtt < 2:2494303/150‑1 (MQ=255) aCCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGtt > 2:4465237/1‑150 (MQ=255) aCCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGtt > 2:4637700/1‑150 (MQ=255) aCCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGACTTCACCGATCGACATGCGACGGtt > 1:1522678/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTTGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGAtt < 1:3514725/150‑1 (MQ=255) aTGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTTGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGAtt < 1:1649865/150‑1 (MQ=255) aTGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGAtt > 2:4797262/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTcc < 1:4227975/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCCTGGATCAGGACGAGGAACTGCAGGCCACGGTGGGTGAACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACCCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTGTCTTGGCGCGGCGGGCCTAGGCTACACAGATCGACATGCGACGGTTGATATCCt > 2:4058466/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCtt < 1:1647313/150‑1 (MQ=255) gCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCtt > 2:1729479/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCtt < 1:1074437/150‑1 (MQ=255) ccTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTg < 1:3368180/150‑1 (MQ=255) ttCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGAt < 2:1481083/150‑1 (MQ=255) ccTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGAtct < 1:3099487/150‑1 (MQ=255) ccTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGAtct > 1:693392/1‑150 (MQ=255) ccTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGAtct < 1:4027760/150‑1 (MQ=255) cTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGAtctc > 2:2100679/1‑150 (MQ=255) cTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGAtctc < 2:3879566/150‑1 (MQ=255) cTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCAGTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGAtctc < 2:3064097/150‑1 (MQ=255) tGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCg > 1:570695/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAAc < 2:2160513/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGcctgacc < 1:37302/150‑7 (MQ=255) gTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGt > 1:2716893/1‑150 (MQ=255) cGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCa > 2:2029781/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCCCCGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGtt > 1:4838534/1‑150 (MQ=255) cAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTc < 2:1343175/150‑1 (MQ=255) aGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCg < 2:4606874/150‑1 (MQ=255) aGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCg < 1:2467625/150‑1 (MQ=255) aGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCg < 2:1233412/150‑1 (MQ=255) aGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCg < 2:4606971/150‑1 (MQ=255) aGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCg < 2:2914260/150‑1 (MQ=255) ggCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCgg < 1:2684145/150‑1 (MQ=255) cACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGtct > 2:1185244/1‑150 (MQ=255) cACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGtct > 2:102964/1‑150 (MQ=255) cACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAAAGGTCAGGCCGGTTTCGGtct > 2:2855958/1‑150 (MQ=255) gtACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGAt > 2:424127/1‑150 (MQ=255) gtACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGAt > 2:2819171/1‑150 (MQ=255) gtACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGAt < 1:4129842/150‑1 (MQ=255) ttcttGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGc > 1:444557/1‑150 (MQ=255) ttcttGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGc > 2:3204685/1‑150 (MQ=255) cttGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCtt < 2:3397010/150‑1 (MQ=255) cttGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCtt < 2:4435242/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCTTc > 1:771802/1‑150 (MQ=255) gATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCTTCTGTTg < 2:2349120/150‑1 (MQ=255) gATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCTTCTGTTg > 1:3508799/1‑150 (MQ=255) tGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCTTCTGTTGGc < 1:1215201/150‑1 (MQ=255) | TCGCCTGACGGATCCACCAGGTGGCATAGGTCGAGAACTTGTAGCCGCGACGGTATTCGAACTTGTCCACCGCTTTCATCAGACCGATGTTGCCTTCCTGGATCAGGTCGAGGAACTGCAGGCCACGGTTGGTGTACTTCTTGGCGATGGAAATCACCAGACGCAGGTTCGCCTCGACCATTTCTTTCTTGGCGCGGCGGGCCTTGGCTTCACCGATCGACATGCGACGGTTGATTTCCTTGATCTCGGCAACGGTCAGGCCGGTTTCGGTCTCAAGGTCGATCAGCTTCTGTTGGC > NC_002947/471614‑471910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |