| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 6,005,585 | G→A | 14.5% | D110D (GAC→GAT) | amaB ← | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,005,585 | 0 | G | A | 14.5% | 622.6 / 81.1 | 248 | D110D (GAC→GAT) | amaB | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (104/108); new base A (16/20); total (120/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGG > NC_002947/6005437‑6005734 | gtTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTc > 2:1587609/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCg > 2:4529400/1‑150 (MQ=255) caccAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCg > 2:359117/3‑150 (MQ=255) ccAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCa > 1:2612880/1‑150 (MQ=255) gCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCATGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATg > 2:1078374/1‑150 (MQ=255) gCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATg > 1:1066263/1‑150 (MQ=255) cccACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGt < 1:3433712/150‑1 (MQ=255) ccACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACAACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTc < 1:1759116/150‑1 (MQ=255) acacGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTATCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGACAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGa > 2:3387929/1‑150 (MQ=255) cacGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGAt < 1:2537286/150‑1 (MQ=255) gCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCAtt < 1:1242679/150‑1 (MQ=255) aaCAGGGAAGTTGAAGGCCGAGATAACGCCGACAACGCCAAGCGGATGCCAGGTTTCCATCATACGATGGCCAGCGCGTTCGGTAGCGATTGTGAGGCCGTAAAGCTGACGCGACAGACCAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTc < 2:4472492/150‑1 (MQ=255) ccGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCt < 2:586025/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTg < 2:4805304/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTg > 1:605423/1‑150 (MQ=255) ggAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCa < 2:5049592/150‑1 (MQ=255) gAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCAcc > 1:1866340/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAg < 1:4664854/150‑1 (MQ=255) 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cacaCCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCtt < 1:973969/150‑1 (MQ=255) cacaCCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCtt > 2:4182793/1‑150 (MQ=255) acacCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTg > 1:2980561/1‑150 (MQ=255) cacCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGc < 2:4243631/150‑1 (MQ=255) acCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGcc > 1:4199431/1‑150 (MQ=255) 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cTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCAc > 1:3269259/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCAc > 1:3812769/1‑150 (MQ=255) ggCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCa < 1:4058171/150‑1 (MQ=255) ggCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCa < 1:2810976/150‑1 (MQ=255) gcgcGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTTCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCATCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAg > 2:3271443/1‑150 (MQ=255) gcgACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGtt > 1:1199593/1‑150 (MQ=255) gACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCg < 2:3952145/150‑1 (MQ=255) agaccAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGTCTTCCTTGGAAGCACGCAGTTCTTCACCGAGCAGGCGGATCAGTTCGCCa > 2:3440843/4‑150 (MQ=255) accAACTGCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGTCTTCCTTGGAAGCACGCAGTTCTTCACCGAGCAGGCGGATCAGTTCGCCACg < 2:2091353/149‑1 (MQ=255) cAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGgc > 2:3749057/1‑150 (MQ=255) cAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGgc > 1:2074811/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGgcg > 1:1839474/1‑150 (MQ=255) aaCGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGGTCGCCACGgcg > 2:4417800/1‑150 (MQ=255) aCGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGgcgc < 1:2225373/150‑1 (MQ=255) aCGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGgcgc < 2:1866340/150‑1 (MQ=255) tgCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGTCTTCCTTGGAAGCACGCAGTTCTTCACCGAGCAGGCGGATCAGTTCGCCACgctttgg > 1:3933014/2‑144 (MQ=255) gCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGa < 2:2499285/150‑1 (MQ=255) gCGAAATCGCAGATGTCGATCATTTCCTGTACTTCGCCGAGGCCTTCCGAAGGAATCTTGCCAGCTTCGAGCGAAACGAGACGGCCGAGGTCTTCCTTGGAAGCACGCAGTTCTTCACCGAGCAGGCGGATCAGTTCGCCACgctttggt < 2:557770/150‑8 (MQ=255) gAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGc < 2:3146112/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGc > 2:1927937/1‑150 (MQ=255) gTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCgg < 1:4529400/150‑1 (MQ=255) | TGTTCCAGGCCCACACGGCAACCGGGAAGTTGAAGGCGCTGATCACGCCGACCACACCCAGCGGGTGCCAGGTTTCACGCATGTGGTGGCCCGGGCGCTCGGAAGCGATGGTCAGGCCGTACAGCTGGCGCGACAGGCCAACGGCGAAGTCGCAGATGTCGATCATTTCCTGCACTTCACCCAGGCCTTCCTGGGTGATCTTGCCGGCTTCGATCGAGACCAGCTCGCCGAGGTCGGCCTTGTGCTCACGCAGCACTTCGCCGAACAGGCGCACCAGTTCGCCACGGCGCGGAGCCGG > NC_002947/6005437‑6005734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |