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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 6,168,462 | 0 | T | C | 5.9% | 481.2 / 12.3 | 153 | intergenic (‑243/‑437) | PP_5406/PP_5407 | transposase/TnsD‑like transposition protein |
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Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
CGCGTTTCCGGTTGTGGATAACGCGGAGATTCTTGTGGATGAGCGAATCCGTGCGAAACTTGACGTTTCACATGCAAGGGATAGACAATGGAGGAGTCAGGTGCCTTTTCTGACTTATCCACAAGGGCCCAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCTGACGCAGCGCTTTCTGGC > NC_002947/6168315‑6168610 | cgcgTTTCCGGTTGTGGATAACGCGGAGATTCTTGTGGATGAGCGAATCCGTGCGAAACTTGACGTTTCACATGCAAGGGATAGACAATGGAGGAGTCAGGTGCCTTTTCTGACTTATCCACAAGGGCCCAAGGTCGCACTTGGGCCttt > 1:4862897/1‑150 (MQ=255)cgcgTTTCCGGTTGTGGATAACGCGGAGATTCTTGTGGATGAGCGAATCCGTGCGAAACTTGACGTTTCACATGCAAGGGATAGACAATGGAGGAGTCAGGTGCCTTTTCTGACTTATCCACAAGGGCCCAAGGTCGCACTTGGGCCctt < 1:2047166/150‑1 (MQ=255) cgTTTCCGGTTGTGGATAACGCGGAGATTCTTGTGGATGAGCGAATCCGTGCGAAACTTGACGTTTCACATGCAAGGGATAGACAATGGAGGAGTCAGGTGCCTTTTCTGACTTATCCACAAGGGCCCAAGTGCGACCTTGGGCCCTTGt < 2:459584/150‑1 (MQ=255) 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aaaggCCCAAGTGCGACCTTGGGCCCTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGc > 1:15810/4‑150 (MQ=255) aaGGGCCCAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGc > 1:1180884/1‑150 (MQ=255) aaGGGCCCAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGAGTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGc > 2:1860109/1‑150 (MQ=255) ggCCCAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCGCTCGTTTAGCGAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTGAGGTCGACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTc < 2:1149592/150‑1 (MQ=255) gCCCAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCg > 2:2611454/1‑150 (MQ=255) gCCCAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCg > 1:1264122/1‑150 (MQ=255) ccAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCt < 2:130822/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCTGAc < 2:309391/150‑1 (MQ=255) ggTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCTGACg < 1:90448/150‑1 (MQ=255) tCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCTGACGCa < 2:4862897/150‑1 (MQ=255) 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ccTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCTGACGCAGCGCTTTCTgg < 1:3936120/150‑1 (MQ=255) cTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCTGACGCAGCGCTTTCTGGc > 2:219365/1‑150 (MQ=255) | CGCGTTTCCGGTTGTGGATAACGCGGAGATTCTTGTGGATGAGCGAATCCGTGCGAAACTTGACGTTTCACATGCAAGGGATAGACAATGGAGGAGTCAGGTGCCTTTTCTGACTTATCCACAAGGGCCCAAGGTCGCACTTGGGCCTTTGTCTATCTGATTTCCAGCGCTCTCGTTTAGCTAGCTGTCGTCTGAATTTCTTTCGTTAGGTCTACCTTAGGCGTCTCCGCCGATTGTGATCTTGCCCACGCTCACGAGCCCTTCTCTCAGGCTTCGCTGACGCAGCGCTTTCTGGC > NC_002947/6168315‑6168610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |