| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 857,643 | T→G | 5.2% | D395A (GAC→GCC) | phr ← | deoxyribodipyrimidine photolyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 857,643 | 0 | T | G | 5.2% | 624.6 / 15.8 | 183 | D395A (GAC→GCC) | phr | deoxyribodipyrimidine photolyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (90/83); new base G (4/6); total (94/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
CGAAAAGGTCCGTCGATTTAATGGGTTGATGGATGGCTTTTTCATCGAGCTCCTGTAGTTCCGGTACCCAGTGGCGAATGAACCGACCCTGTGGATCGAAGCGCTGCGACTGTGAAACCGGGTTGAAGATACGGAAATAGGGCACCGCGTCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAGGTGGCGCATGAAGTGCCGCTCGCCCTTGCGCCAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCG > NC_002947/857494‑857791 | cGAAAAGGTCCGTCGATTTAATGGGTTGATGGATGGCTTTTTCATCGAGCTCCTGTAGTTCCGGTACCCAGTGGCGAATGAACCGACCCTGTGGATCGAAGCGCTGCGACTGTGAAACCGGGTTGAAGATACGGAAATAGGGCACCGCGt > 2:3390994/1‑150 (MQ=255) aaaaGGTCCGTCGATTTAATGGGTTGATGGATGGCTTTTTCATCGAGCTCCTGTAGTTCCGGTACCCAGTGGCGAATGAACCGACCCTGTGGATCGAAGCGCTGCGACTGTGAAACCGGGTTGAAGATACGGAAATAGGGCACCGCGTCg > 1:5089249/1‑150 (MQ=255) aaGGTCCGTCGATTTAATGGGTTGATGGATGGCTTTTTCATCGAGCTCCTGTAGTTCCGGTACCCAGTGGCGAATGAACCGACCCTGTGGATCGAAGCGCTGCGACTGTGAAACCGGGTTGAAGATACGGAAATAGGGCACCGCGTCGGt < 1:4971731/150‑1 (MQ=255) 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tACGGAAATAGGGCACCGCGTCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAGGTGGCGCATGAAGTGCCGCTCGCCCTTGCGCCAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATgg < 1:5004080/150‑1 (MQ=255) ggAAATAGGGCACCGCGTCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAGGTGGCGCATGAAGTGCCGCTCGCCCTTGCGCCAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCa < 2:3834681/150‑1 (MQ=255) aaTAGGGCACCGCGTCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAGGTGGCGCATGAAGTGCCGCTCGCCCTTGCGCCAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGa > 2:684878/1‑150 (MQ=255) tAGGGCACCGCGTCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAGGTGGCGCATGAAGTGCCGCTCGCCCTTGCGCCAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGAcc < 1:2323643/150‑1 (MQ=255) gggCACCGCGTCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAGGTGGCGCATGAAGTGCCGCTCGCCCTTGCGCCAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCag > 2:2920523/1‑149 (MQ=255) cggCACCGACGCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAg > 1:3804766/2‑75 (MQ=255) 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CGAAAAGGTCCGTCGATTTAATGGGTTGATGGATGGCTTTTTCATCGAGCTCCTGTAGTTCCGGTACCCAGTGGCGAATGAACCGACCCTGTGGATCGAAGCGCTGCGACTGTGAAACCGGGTTGAAGATACGGAAATAGGGCACCGCGTCGGTGCCGGTGGAAGCACTCCACTGCCAACCCCCGTTGTTGGCGGCCAGGTCGCCGTCTATCAGGTGGCGCATGAAGTGCCGCTCGCCCTTGCGCCAGTCAATCAGCAGGTTCTTGCTGAGGAACATGGCCACGACCATGCGCAAGCG > NC_002947/857494‑857791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |