Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 914,634 | G→C | 7.8% | A448P (GCC→CCC) ‡ | fruA → | PTS fructose transporter subunit IIBC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 914,634 | 0 | G | C | 7.8% | 620.7 / 32.9 | 192 | A448P (GCC→CCC) ‡ | fruA | PTS fructose transporter subunit IIBC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (96/80); new base C (5/10); total (101/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
GCATGGGCACCACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAG > NC_002947/914485‑914783 | gggCACCACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGgccgc > 2:548013/1‑150 (MQ=255) gCACCACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGccgccg > 2:4988984/1‑150 (MQ=255) caccaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CAt > 1:2420441/1‑150 (MQ=255) acctATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTGCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGGCCATGGTCGCCGC‑CAtt < 2:4161072/150‑2 (MQ=255) accaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑Cagg > 2:3199378/1‑148 (MQ=255) accaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATg < 2:1851204/150‑1 (MQ=255) accaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATg < 2:2928390/150‑1 (MQ=255) aaTGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGAGCCAATCGGCGGC‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGtc < 1:4321250/150‑2 (MQ=255) aaTGCCATCCTGCTGGGACTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGCCGGCGGC‑CATGGtc < 1:5083340/150‑2 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATCGGCGGC‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCgccgccatt < 1:1304262/150‑4 (MQ=37) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAtt < 1:1671274/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAtt < 1:3936690/150‑1 (MQ=255) tgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCAGGGCCGCCGG‑CCTGGT‑GCCGCCGATTg > 2:686964/1‑150 (MQ=255) tgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTAGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTACTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTg > 1:2112148/1‑150 (MQ=255) gctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATCGGCGGC‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCGCCGCC‑ATTgg < 1:1266523/150‑1 (MQ=37) gctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTgg < 1:2271183/150‑1 (MQ=255) ctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGc < 2:1735840/150‑1 (MQ=255) ggggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCtt > 1:2222559/1‑150 (MQ=255) gggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTg < 2:3405989/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 1:98649/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 1:3668300/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 2:4757905/150‑1 (MQ=255) ttGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCACT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTCtt > 2:3736248/1‑150 (MQ=255) tGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTg < 2:2391863/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCa > 1:5083092/1‑150 (MQ=255) ggcggcATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGGTTGGGTATTGCCAcc > 1:3089150/1‑150 (MQ=255) cttgatgTGCGTCGAGCTTGGCGGGCCGATCATCAAGTCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCt < 2:4895385/148‑1 (MQ=255) cATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCt > 1:2642951/1‑150 (MQ=255) gCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CCTGGT‑GCCGCCGAGTGGCGTGGGTCTTGCCACCTTCCTGGCCCGgc > 2:2364996/1‑150 (MQ=255) gCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGgc < 1:1934923/150‑1 (MQ=255) gTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTg < 1:2719464/123‑1 (MQ=255) gTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTg > 2:2719464/1‑123 (MQ=255) cGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCaa < 2:1018441/150‑1 (MQ=255) cGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCaa < 1:59715/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGAATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGtt > 1:664661/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAGTGGCTGGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCACGTTc > 2:859534/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCCTGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 1:2890887/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 2:1652125/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 1:4262032/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 1:3134794/150‑1 (MQ=255) ggCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCaga < 2:3619692/150‑1 (MQ=255) ccGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagc < 1:4459568/150‑1 (MQ=255) ccGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagc > 2:3349321/1‑150 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 1:2347740/1‑150 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCGGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 1:155035/1‑150 (MQ=255) tCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgagc < 2:1264025/150‑1 (MQ=255) caacaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGagcgagcg > 1:1097321/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:3838861/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:123823/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 2:2488736/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:4434351/1‑150 (MQ=255) caaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGa < 2:1310094/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAg < 2:2194550/150‑1 (MQ=255) gccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCg < 2:3033578/150‑1 (MQ=255) gccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCg < 2:5083572/150‑1 (MQ=255) ccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg < 1:4590168/150‑1 (MQ=255) gccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGc < 1:4559214/150‑1 (MQ=255) tGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CAGGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAggc > 2:3945930/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctggcgc < 1:3349321/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGcgctggcgctgg < 2:2995243/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTggg > 2:4460740/1‑150 (MQ=255) gctgctGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTggg < 1:1081381/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTggg > 1:73257/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTgggg < 2:4709720/150‑1 (MQ=255) ctgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtg > 1:86965/1‑150 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CTTGGT‑GCCTCCGATTGGCTTGGGTATTGCGACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTCCGACCTTATCGAGCGCTAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt < 1:1678114/150‑1 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt > 2:915199/1‑150 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt > 2:915168/1‑150 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt < 1:4902957/150‑1 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCAAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt < 2:3036223/150‑1 (MQ=255) cTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCtt > 2:4381995/1‑150 (MQ=255) cTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCtt > 2:2893503/1‑150 (MQ=255) tcgtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTc > 1:3590767/1‑150 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtc > 1:1755685/1‑150 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtc > 1:3031568/1‑150 (MQ=255) gAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtctc > 2:449503/1‑150 (MQ=255) aGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCTGCGG‑AATGGT‑GCCGCCGATTGTCTTGGGTATTGCCTCCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTcc < 1:3807989/150‑1 (MQ=255) aGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGACCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTcc < 1:5100241/150‑1 (MQ=255) tACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAg < 2:4250192/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgg < 2:2112148/150‑1 (MQ=255) gcCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtctc > 2:4837417/1‑141 (MQ=255) gcCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtctc < 1:4837417/141‑1 (MQ=255) gcCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGc < 2:2861207/150‑1 (MQ=255) aT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGAtt < 1:5056480/150‑1 (MQ=255) aT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGAtt < 2:573807/150‑1 (MQ=255) aT‑GCCGGCGGCCCGGGTCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGAtt > 2:2629153/1‑150 (MQ=255) t‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTc > 1:4349204/1‑150 (MQ=255) gcggcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCg < 2:674630/150‑1 (MQ=255) gcggcaCCATGCCGGCGGC‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGt > 1:3116012/6‑150 (MQ=255) gcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt > 1:201527/1‑150 (MQ=255) gcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt < 1:635547/150‑1 (MQ=255) gcgACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt < 1:1456652/150‑1 (MQ=255) gACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgc > 2:1292191/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgccgc > 1:3739709/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgccgc > 2:2802417/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCa > 2:1783326/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGG‑CATTGT‑GCCGCCGATTGTCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCaa < 2:2072482/150‑1 (MQ=255) gccggcGGCCATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCaa < 2:3116012/150‑1 (MQ=255) gccgccGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAg < 1:4050930/150‑1 (MQ=255) gccgccGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAg < 1:557840/150‑1 (MQ=255) | GCATGGGCACCACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAG > NC_002947/914485‑914783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |