Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 914,636 | C→G | 7.9% | A448A (GCC→GCG) ‡ | fruA → | PTS fructose transporter subunit IIBC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 914,636 | 0 | C | G | 7.9% | 621.0 / 32.3 | 191 | A448A (GCC→GCG) ‡ | fruA | PTS fructose transporter subunit IIBC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (94/82); new base G (5/10); total (99/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
ATGGGCACCACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGA > NC_002947/914487‑914785 | caccaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CAt > 1:2420441/1‑150 (MQ=255) accaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑Cagg > 2:3199378/1‑148 (MQ=255) accaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATg < 2:1851204/150‑1 (MQ=255) accaATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATg < 2:2928390/150‑1 (MQ=255) aaTGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGAGCCAATCGGCGGC‑‑‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGtc < 1:4321250/150‑2 (MQ=255) aaTGCCATCCTGCTGGGACTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGtc < 1:5083382/150‑2 (MQ=255) aaTGCCATCCTGCTGGGACTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGtc < 1:5083338/150‑2 (MQ=255) tCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGa < 1:5006938/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATCGGCGGC‑‑‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCgccgccatt < 1:1304262/150‑4 (MQ=37) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAtt < 1:1671274/150‑1 (MQ=255) ctgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAtt < 1:3936690/150‑1 (MQ=255) tgctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTAGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTACTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTg > 1:2112148/1‑150 (MQ=255) gctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAATCGGCGGC‑‑‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCGCCGCC‑ATTgg < 1:1266523/150‑1 (MQ=37) gctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCGGCACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCgccgccatt < 2:678960/150‑4 (MQ=38) gctgGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTgg < 1:2271183/150‑1 (MQ=255) ggggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCtt > 1:2222559/1‑150 (MQ=255) ggggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCtt < 2:471254/150‑1 (MQ=255) gggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTg < 2:3405989/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 1:3668300/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTgg < 1:98649/150‑1 (MQ=255) tGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTa > 1:3866729/1‑150 (MQ=255) tGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTg < 2:2391863/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCgg < 2:4305511/118‑1 (MQ=255) ggcggcATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGGTTGGGTATTGCCAcc > 1:3089150/1‑150 (MQ=255) cATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCt < 2:4895319/150‑1 (MQ=255) cATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCt > 1:2642951/1‑150 (MQ=255) gatgTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CAGGGT‑GCCGCCGAGGGGCTGGGGTCTGGCCACCTTCCTGGc > 2:4137975/1‑150 (MQ=255) gCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CCTGGT‑GCCGCCGAGTGGCGTGGGTCTTGCCACCTTCCTGGCCCGgc > 2:2364996/1‑150 (MQ=255) gCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGgc < 1:1934923/150‑1 (MQ=255) gTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTg > 2:2719464/1‑123 (MQ=255) gTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTg < 1:2719464/123‑1 (MQ=255) cGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCaa < 2:1018441/150‑1 (MQ=255) cGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCaa < 1:59715/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGAATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGtt > 1:664661/1‑150 (MQ=255) ttGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCg > 2:5056480/1‑150 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCCTGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 1:2890887/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 1:4262032/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 2:1652125/150‑1 (MQ=255) ggCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGcc < 1:3134794/150‑1 (MQ=255) ccGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagc < 1:4459568/150‑1 (MQ=255) ccGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagc < 2:1774723/150‑1 (MQ=255) ccGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagc > 2:3349321/1‑150 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 1:2347740/1‑150 (MQ=255) gATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCGGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcga > 1:155035/1‑150 (MQ=255) aTCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgag < 1:548013/150‑1 (MQ=255) tCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAgagcgagc < 2:1264025/150‑1 (MQ=255) caacaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGagcgagcg > 1:1097321/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 2:2488736/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:123823/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 1:4434351/1‑150 (MQ=255) acaaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGcgcg > 2:665299/1‑150 (MQ=255) caaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGa < 2:1310094/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAg < 2:2194550/150‑1 (MQ=255) gccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCg < 2:3033578/150‑1 (MQ=255) ccgccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCgg < 1:4590168/150‑1 (MQ=255) gccTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGc < 1:4559214/150‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTAGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGAGTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCGCggcggc > 2:3658645/1‑150 (MQ=255) tctcGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTGGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgc > 2:5091796/1‑150 (MQ=255) tcGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctg < 2:1788/150‑1 (MQ=255) tcGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctg > 2:848340/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCggcgctggcgc < 1:3349321/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGcgctggcgctgg < 2:2995243/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGcgctggcgctgg < 2:439272/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTggg < 1:1081381/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTggg > 1:73257/1‑150 (MQ=255) ctgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtg > 1:86965/1‑150 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CTTGGT‑GCCTCCGATTGGCTTGGGTATTGCGACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTCCGACCTTATCGAGCGCTAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt < 1:1678114/150‑1 (MQ=255) tgGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTTGATTGGCTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCtgt > 2:915188/1‑150 (MQ=255) 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cTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCtt > 2:4760317/1‑150 (MQ=255) cTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCtt > 2:2893503/1‑150 (MQ=255) tcgtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTc > 1:3590767/1‑150 (MQ=255) gtcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAt > 2:3544364/1‑150 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtc > 1:1755685/1‑150 (MQ=255) tcgAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtc > 1:3031568/1‑150 (MQ=255) gAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtctc > 2:449477/1‑150 (MQ=255) aGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCTGCGG‑AATGGT‑GCCGCCGATTGTCTTGGGTATTGCCTCCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTcc < 1:3807989/150‑1 (MQ=255) ccaagcCAATCGGCGGC‑‑‑ACCATGCCGGCGGC‑CATGGTCGCCGCC‑ATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGCGCGCGAGGCGGGCACGGCGGCGCGGGCGCTGGGGCGGTGCTTCATCTCCGAgg > 2:4954395/5‑150 (MQ=21) aCGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAgg < 2:2112148/150‑1 (MQ=255) cgcCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAggggg < 2:4179135/150‑1 (MQ=255) gcCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCAtctc < 1:4837417/141‑1 (MQ=255) gcCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGc < 2:2861207/150‑1 (MQ=255) cAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGa < 2:4610423/150‑1 (MQ=255) aT‑GCCGGCG‑‑GCCCGGGTCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGAtt > 2:2629153/1‑150 (MQ=255) t‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTc > 1:4349204/1‑150 (MQ=255) gcggcaCCATGCCGGCGGC‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGt > 1:3116012/6‑150 (MQ=255) gcg‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt < 1:635547/150‑1 (MQ=255) gcg‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt > 1:201527/1‑150 (MQ=255) gcg‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGttt < 1:1456652/150‑1 (MQ=255) g‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgc > 2:1292191/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgccgc > 1:3739709/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgccgc > 1:5060825/1‑150 (MQ=255) cATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTgccgc > 2:2802417/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGG‑CATTGT‑GCCGCCGATTGTCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCaa < 2:2072482/150‑1 (MQ=255) gccggcGGCCATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCaa < 2:3116012/150‑1 (MQ=255) gccgccGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAg < 1:4050930/150‑1 (MQ=255) | ATGGGCACCACCAATGCCATCCTGCTGGGGCTGTTGCTGGGCGGCATGATGTGCGTCGACCTTGGCGGGCCGATCAACAAGGCCGCCTATGCGTTCTCGGTGGGGCTGCTGGCCTCGTCGAGCTACGCGCCAAT‑GGCGGCG‑‑ACCATGGCCGCCGG‑CATGGT‑GCCGCCGATTGGCTTGGGTATTGCCACCTTCCTGGCCCGGCGCAAGTTCGCCCAGAGCGAGCGCGAGGCGGGCAAGGCGGCGCTGGCGCTGGGGCTGTGCTTCATCTCCGAGGGGGCGATTCCGTTTGCCGCCAAGGA > NC_002947/914487‑914785 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |