Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,198,338 | C→T | 6.5% | A214A (GCC→GCT) | gspE → | protein secretion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,198,338 | 0 | C | T | 6.5% | 523.8 / 16.1 | 171 | A214A (GCC→GCT) | gspE | protein secretion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/82); new base T (6/5); total (83/88) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
ATGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCT > NC_002947/1198189‑1198487 | aTGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGcc > 1:3334108/1‑150 (MQ=255) cccGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGcc < 1:585006/150‑1 (MQ=255) ccGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTAGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCct > 2:3386627/1‑150 (MQ=255) gCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgc < 1:3763004/150‑1 (MQ=255) cTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCctgctg < 1:5044694/150‑1 (MQ=255) gACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgcttgtc < 1:2051441/150‑5 (MQ=255) gACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcg > 1:2992085/1‑150 (MQ=255) aCATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc > 1:2622548/1‑150 (MQ=255) aCATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc > 1:2623037/1‑150 (MQ=255) cATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt < 1:5006872/150‑1 (MQ=255) cATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt < 2:4094502/150‑1 (MQ=255) ttGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTgg < 2:489495/150‑1 (MQ=255) ttGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTgg > 2:1513356/1‑150 (MQ=255) gCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCAGGCTGgcctgcttg < 2:1596187/150‑8 (MQ=255) ggAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATaa > 2:953653/1‑150 (MQ=255) ggAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATaa > 2:1068590/1‑150 (MQ=255) ggAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATaa > 1:2397985/1‑150 (MQ=255) aGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTgg < 1:3518667/150‑1 (MQ=255) aGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTgg < 2:3291849/150‑1 (MQ=255) aGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTgg < 1:1003671/150‑1 (MQ=255) gTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCa > 1:1796804/1‑150 (MQ=255) aGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGc < 2:503652/150‑1 (MQ=255) ccAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCgg < 2:1218769/149‑1 (MQ=255) ccAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCgg > 1:1218769/1‑149 (MQ=255) ccAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGc > 1:44583/1‑150 (MQ=255) ccAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGc > 1:4090874/1‑150 (MQ=255) ggACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGc > 2:4534910/1‑150 (MQ=255) gACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCg < 1:1012108/150‑1 (MQ=255) gCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTAt > 1:4207746/1‑150 (MQ=255) ccGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTAtt < 1:1055575/150‑1 (MQ=255) ccGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTAtt > 2:1415911/1‑150 (MQ=255) ccGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTAtt < 2:462110/150‑1 (MQ=255) cATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCa < 1:2277761/150‑1 (MQ=255) cATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCa < 2:440767/150‑1 (MQ=255) aTCACCGTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAg < 1:386043/150‑1 (MQ=255) cACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAggg < 2:3688267/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGcc > 1:39533/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGcc < 1:4636278/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCt < 2:590597/150‑1 (MQ=255) cTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGAGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCt > 2:1660742/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTg > 1:4949524/1‑150 (MQ=255) gcgcgGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCa < 2:1364630/150‑1 (MQ=255) gcgcgGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCa > 1:1887101/1‑150 (MQ=255) cggcggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGtt < 2:4356259/150‑1 (MQ=255) gcggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGc < 1:4160346/150‑1 (MQ=255) ggggCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCt > 2:4943200/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGgc < 1:3848687/150‑1 (MQ=255) gcgcGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGgc < 1:3134781/150‑1 (MQ=255) aaGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGc < 1:1995033/150‑1 (MQ=255) gTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGccc > 2:1329130/1‑150 (MQ=255) cGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAtt < 1:650250/150‑1 (MQ=255) gAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATtg > 2:1889817/1‑150 (MQ=255) aGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATtgt > 1:4751255/1‑150 (MQ=255) gTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATtgtg < 1:3365764/150‑1 (MQ=255) gTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATtgtg < 1:3126525/150‑1 (MQ=255) tctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGc > 2:3325221/1‑150 (MQ=255) tctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGc > 1:4844153/1‑150 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt < 1:334803/150‑1 (MQ=255) tcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTg > 1:561761/1‑150 (MQ=255) tcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTg > 2:3711348/1‑150 (MQ=255) tcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTg > 2:4559714/1‑150 (MQ=255) tcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTg > 2:50937/1‑150 (MQ=255) tGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCg < 2:1344211/150‑1 (MQ=255) 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gATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAc < 1:188926/150‑1 (MQ=255) gATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAc < 1:188795/150‑1 (MQ=255) gATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAc < 1:1913584/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAcc < 2:3334108/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAcc < 1:4002509/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt > 2:2042787/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt < 1:4585623/150‑1 (MQ=255) tCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCa > 1:719492/1‑150 (MQ=255) tCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAGTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCCAGACCACGACCTTGTACGccc > 2:4869810/1‑149 (MQ=255) agcgccaGCAGGCTGGCCTGCTTGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCa > 2:1878067/7‑150 (MQ=255) agcgccaGCAGGCTGGCCTGCTTGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCa > 1:3614374/7‑150 (MQ=255) cGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAg > 1:3515636/1‑150 (MQ=255) gACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGc > 2:4887110/1‑150 (MQ=255) gACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGc < 2:343586/150‑1 (MQ=255) aCAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGcc > 1:3263396/1‑150 (MQ=255) cAAGCAGGCCAGGCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCGACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGTCCTTGTAGGCGAGCCt < 2:4471484/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTg > 1:4068597/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTg > 1:3107263/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACACCAGCCTg > 2:534678/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGaa > 1:4996009/1‑150 (MQ=255) gCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGc > 1:4983555/1‑66 (MQ=255) gCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGc > 1:4821062/1‑150 (MQ=255) | ATGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCT > NC_002947/1198189‑1198487 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |