| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 163,034 | A→G | 6.4% | I267T (ATT→ACT) ‡ | scpC ← | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 163,034 | 0 | A | G | 6.4% | 434.1 / 12.4 | 142 | I267T (ATT→ACT) ‡ | scpC | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (53/78); new base G (5/4); total (60/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTGGTCG > NC_002947/162885‑163183 | ggcgCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCaa > 2:3935700/1‑150 (MQ=255) gcgcGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAAt > 2:2894620/1‑150 (MQ=255) cgcgTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAAtg < 1:3768497/150‑1 (MQ=255) gACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAAtgctgtga < 1:571775/150‑4 (MQ=255) aCAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCaa < 1:2470695/150‑1 (MQ=255) aGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAGCATTGCCAATg < 1:3651546/150‑1 (MQ=255) gggTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAGCATTGCCAATGc < 2:1134625/150‑1 (MQ=255) ggTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGACTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAGCATTGCCAATGcg < 2:467519/150‑2 (MQ=255) aTCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCt > 1:2508856/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGc < 1:4962331/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGc < 2:1199582/150‑1 (MQ=255) ggATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGcc < 2:2171422/150‑1 (MQ=255) tGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAg < 1:2797218/150‑1 (MQ=255) 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taagctTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTgg > 1:3101169/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATAc < 2:2201000/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATAc < 1:3567207/150‑1 (MQ=255) cGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGc < 2:2683116/150‑1 (MQ=255) gCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCt < 1:1491670/150‑1 (MQ=255) 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ggTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActt > 1:2873153/1‑150 (MQ=255) gTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAAGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtc > 2:4960618/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtcc > 2:2062214/1‑150 (MQ=255) tCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtcc > 2:3441608/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCActtcctt > 2:1689835/1‑150 (MQ=255) 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gATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGgcag > 2:1177737/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGgcagca < 2:3101169/150‑1 (MQ=255) aGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGcaca > 2:537273/1‑150 (MQ=255) ccGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTg < 1:4041486/150‑1 (MQ=255) gCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGa < 1:3256407/150‑1 (MQ=255) gCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTGTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGa > 2:4833319/1‑150 (MQ=255) acaTCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGtt < 2:4537939/122‑1 (MQ=255) acaTCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGtt > 1:4537939/1‑122 (MQ=255) gccggCATTGGCAGCATTGCCAATGCGGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGa > 1:4867782/5‑150 (MQ=255) gCATTGGCAGCATTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTcc > 2:276073/1‑150 (MQ=255) gCATTGGCAGCATTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTcc > 2:356324/1‑150 (MQ=255) ttGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGc < 1:3369115/150‑1 (MQ=255) tcggCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGc < 2:669219/148‑1 (MQ=255) ggCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTg < 1:4715433/150‑1 (MQ=255) gCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTgg > 2:5005683/1‑150 (MQ=255) gCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTgg < 1:1520877/150‑1 (MQ=255) | GGCGCGTCGACAGGGTGATCGAGCTGCCGGATGCGAAGCTAAGCTTGCCGGCATCGATCAGGTCGAAGGTGGAGTCCTGCAGCACTTCGGAGTACATGGTCAGGTCTTCGAACGGCGACTCGATCAGGCCGCACATCACCGCATTGGCAATGCTGCCAATGCCGGCTTGCAGCGGGCCGAGCTTGTTGGTCATACGGCCTGCATCCACTTCCTTCTTGAGGAAGTTGATCAGGTGGTCGGCGATGCCCTGTGTTTCATCATCTGGCGGCAGCACAGTGGACGGCGAGTCCGGCTGGTCG > NC_002947/162885‑163183 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |