| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 163,467 | T→G | 5.2% | K123Q (AAG→CAG) | scpC ← | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 163,467 | 0 | T | G | 5.2% | 519.3 / 13.9 | 153 | K123Q (AAG→CAG) | scpC | propionyl‑CoA:succinate CoA transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/76); new base G (3/5); total (72/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GAGGTTGGTGTTGTGCGAGAGGTTGATCTCCACAATCACCTGCTTGGCGAAGATCGCGAAGCTGGCCGAGTTGCCCACCGAAGTGGTTGGCACGATGTGGCCTTGCTCGGTGATGGCCACGGCTTCGATGACCGCGATGTCCGGCAGCTTCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGT > NC_002947/163318‑163616 | gAGGTTGGTGTTGTGCGAGAGGTTGATCTCCACAATCACCTGCTTGGCGAAGATCGCGAAGCTGGACGAGTTGCCCACCGAAGTGGTTGGCACGATGTGGCCTTGCTCGGTGATGGCCACGGCTTCGATGACCGCGATGTCCGGCAGCtt > 2:5019610/1‑150 (MQ=255) ggTTGGTGTTGTGCGAGAGGTTGATCTCCACAATCACCTGCTTGGCGAAGATCGCGAAGCTGGCCGAGTTGCCCACCGAAGTGGTTGGCACGATGTGGCCTTGCTCGGTGATGGCCACGGCTTCGATGACCGCGATGTCCGGCAGCTTCa < 1:1986235/150‑1 (MQ=255) gtgtTGTGCGAGAGGTTGATCTCCACAATCACCTGCTTGGCGAAGATCGCGAAGCTGGCCGAGTTGCCCACCGAAGTGGTTGGCACGATGTGGCCTTGCTCGGTGATGGCCACGGCTTCGATGACCGCGATGTCCGGCAGCTTCAgctgc < 1:1950641/150‑1 (MQ=255) 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ggCAGCTTCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTTCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAgt < 1:5019610/150‑1 (MQ=255) gCAGCTTCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAgtt < 2:3647456/150‑1 (MQ=255) gCAGCTTCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAgtt < 1:1912265/150‑1 (MQ=255) gCAGCTTCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAgtt < 2:2042545/150‑1 (MQ=255) gCAGCTTCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAgtt < 1:4236454/150‑1 (MQ=255) 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tCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGttgtttgt > 1:2030938/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGgtgtttgt > 2:3594199/1‑150 (MQ=255) | GAGGTTGGTGTTGTGCGAGAGGTTGATCTCCACAATCACCTGCTTGGCGAAGATCGCGAAGCTGGCCGAGTTGCCCACCGAAGTGGTTGGCACGATGTGGCCTTGCTCGGTGATGGCCACGGCTTCGATGACCGCGATGTCCGGCAGCTTCAGCTGCTGGTTGCGCAGTTGCTCGACGGTTTCCGACAGGTGCTGGTCAATGAACATCACCTGGCCGTCATTGATGGCTTTGCGCAGGGTGCTGTCGACCTGGAACGGCATGCGGCGGGCCAACACACCGGCCTCGGTCAGTTGTTTGT > NC_002947/163318‑163616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |