| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 578 total aligned reads displayed.
ATCATGGTCGGTGGCTTCGGCACGGCTGGCATGCCGTCCGAGCTGATCGATGGCCTCATTGCCACCGGTGCCCGCGACCTGACCATCATCAGCAACAACGCCGGCAACGGCGAGATCGGCCTGGCCGCCCTGCTCATGGCAGGCAGCGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTCTT > NC_002947/4459392‑4459690 | atcatGGTCGGTGGCTTCGGCACGGCTGGCATGCCGTCCGAGCTGATCGATGGCCTCATTGCCACCGGTGCCCGCGACCTGACCATCATCAGCAACAACGCCGGCAACGGCGAGATCGGCCTGGCCGCCCTGCTCATGGCAGGCAGCGTg < 2:3733217/150‑1 (MQ=255) ccaaaagacctcaagaacgactcacatcgccacatgcgccccagcacggcgatttgagctaaaccacgcaatttcttgccagtttggcaagcctctctagatccctgcgcccttcaacgcatttcgcgtgttttcacacagcctggTgcg > 1:5297767‑M2/147‑150 (MQ=255) ggTCGGTGGCTTCGGCACGGCTGGCATGCCGTCCGAGCTGATCGATGGCCTCATTGCCACCGGTGCCCGCGACCTGACCATCATCAGCAACAACGCCGGCAACGGCGAGATCGGCCTGGCCGCCCTGCTCATGGCAGGCAGCGTGccaga < 2:2505547‑M2/150‑6 (MQ=255) 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tgcgcccttcaacgcatttcgcgtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGc < 1:2537508‑M2/109‑1 (MQ=255) cGGCGAGATCGGCCTGGCCGCCCTGCTCATGGCAGGCAGCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacat > 1:3711653‑M2/1‑43 (MQ=255) gcgcccttcaacgcatttcgcgtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGcc < 1:4815685‑M2/110‑1 (MQ=255) gcccttcaacgcatttcgcgtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGa > 1:2181696‑M2/39‑150 (MQ=255) gcccttcaacgcatttcgcgtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGa < 2:471600‑M2/112‑1 (MQ=255) ccttcaacgcatttcgcgtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGc > 1:1855535‑M2/37‑150 (MQ=255) tcaacgcatttcgcgtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTa < 2:2621763‑M2/117‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCCCTGCTCATGGCAGGCAGCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacattgctgccggagt < 1:2583363‑M2/150‑120 (MQ=255) cTGGCCGCCCTGCTCATGGCAGGCAGCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacattgctgccggagtg < 1:1305437‑M2/150‑121 (MQ=255) atttcgcgtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCgcgc < 2:3332374‑M2/124‑1 (MQ=255) gtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAgg > 2:3260772‑M2/20‑118 (MQ=255) gtgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAgg < 1:3261319‑M2/99‑1 (MQ=255) tgttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCt > 1:4047568‑M2/19‑150 (MQ=255) gttttcacacagcctggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTc < 2:4372629‑M2/133‑1 (MQ=255) tCATGGCAGGCAGCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacattgctgccggagtgcctggacgactac > 2:305058‑M2/1‑17 (MQ=255) tCATGGCAGGCAGCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacattgctgccggagtgcctggacgactac > 1:3514859‑M2/1‑17 (MQ=255) aTGGCAGGCAGCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacattgctgccggagtgcctggacgactacgt < 2:3776029‑M2/150‑136 (MQ=255) ggcaggcaGCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacattgctgccggagtgcctggacgactacgtca < 2:166981‑M2/150‑138 (MQ=255) gcaggcagCGTGccagactgtgtgaaaacgcccgcggttgtctaaccttctggtcgtcgtgaccgtggggacaatcatgaagcgattcatcgaaggtgaggctcgaacgcaggttacattgctgccggagtgcctggacgactacgtcac > 1:1199565‑M2/1‑12 (MQ=255) tggTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGt > 2:2073800‑M2/4‑150 (MQ=255) gTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGCCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTc < 2:2792205‑M2/149‑1 (MQ=255) gcgcAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGttctt < 1:1477290/150‑1 (MQ=255) | ATCATGGTCGGTGGCTTCGGCACGGCTGGCATGCCGTCCGAGCTGATCGATGGCCTCATTGCCACCGGTGCCCGCGACCTGACCATCATCAGCAACAACGCCGGCAACGGCGAGATCGGCCTGGCCGCCCTGCTCATGGCAGGCAGCGTGCGCAAGGTGGTCTGCTCGTTCCCGCGCCAGTCCGACTCCTACGTGTTCGACGAACTGTACCGCGCCGGCAAGATCGAGCTGGAAGTGGTCCCGCAGGGCAACCTGGCCGAGCGTATCCGCGCCGCAGGCTCCGGCATTGGTGCGTTCTT > NC_002947/4459392‑4459690 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |