Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,103,902 | 0 | A | T | 25.3% | 547.8 / 45.7 | 264 | D219V (GAT→GTT) | murA | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (129/63); new base T (0/65); total (129/135) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.13e-25 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
GAGAACATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGTGCTTGAAAA > NC_002947/1103754‑1104049 | gagaACATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGa < 2:7501233/149‑1 (MQ=255) gagaACATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGa < 1:3156929/149‑1 (MQ=255) agaACATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGAt < 2:2710007/149‑1 (MQ=255) agaACATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGAt < 1:3843713/149‑1 (MQ=255) aaCATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATgg < 1:6901291/149‑1 (MQ=255) aaCATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATgg < 2:6811237/149‑1 (MQ=255) aCATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGgt < 1:3499998/149‑1 (MQ=255) catcatGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑ACCATTCAGGGCGCCGGGACCGACACCATCACCCTCGATGgtg > 2:3847948/1‑149 (MQ=255) catcatGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGgtg < 2:660165/149‑1 (MQ=255) atcatGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGgtgt < 1:4870364/149‑1 (MQ=255) tcatGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTc > 2:6489282/1‑149 (MQ=255) tgatgGCCGCTTCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCTTCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGaa < 2:5886167/149‑1 (MQ=255) tgatgGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGaa < 2:1511597/149‑1 (MQ=255) tgGCCGCTGCCTTGGCCACGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGACGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCACCGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGa < 2:3313146/149‑1 (MQ=255) tgGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGa > 2:5427575/1‑149 (MQ=255) ggCCGCTGCCTTGGCCATGGGCCGCAGCGTGTTGCATAACGCCGCGCGTGCGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCGGGTACCGACCCCATCACCATCGTTGTTGTCGAACGAc < 2:3494335/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTc > 2:4278533/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCATGGGCCGCCGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGATGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCTTGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCg < 2:6191165/149‑1 (MQ=255) tGGCCATGGGCCGCTGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGTAGTGTTCGACCTGGCCAACTTCATCACCGCCTTGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGcc < 2:6941679/149‑1 (MQ=255) cAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAAtt > 1:5444304/1‑149 (MQ=255) cAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAAtt > 1:1558876/1‑149 (MQ=255) aaGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGTCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTa > 2:60967/1‑149 (MQ=255) aaGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTa > 2:1218275/1‑149 (MQ=255) aaGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTa > 1:7327151/1‑149 (MQ=255) gggCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTAcc > 1:6607238/1‑149 (MQ=255) gggCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTAcc > 1:3556664/1‑149 (MQ=255) ccgccgCGTTTTGCATACCGCCGCGGGTGCGCCTGATGTGGTCGACCTGGCCAACTTAATCAACGCAATGGGCGGT‑AAAATTCAGGGCGCCTGTACCTACACCATAACCAGCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACcgcg < 2:1754799/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑ACCATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACcgcg > 2:5750834/1‑149 (MQ=255) ccGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGTTACCGACACCATCACCATCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACcgcg < 2:5602503/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACcgcg > 2:292285/1‑149 (MQ=255) gCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTg > 1:4854225/1‑149 (MQ=255) cAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCg > 2:3718907/1‑149 (MQ=255) cAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCg > 2:457807/1‑149 (MQ=255) gAACGCCGGGGTTGAGCCTGATGTGGTCGACCTGGCAAAGTTCATCAACGCCTTGGGCGGG‑AACTTTCAGGGCGCGGGTACCCACACCAACACCATCGTGGGTGTCGCACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCa < 2:2233409/149‑1 (MQ=255) caaCGCCGCGCGGGCCCCTGACGTGGACGACCGGGCCACCTTCATCACCGCCATGGGGGGT‑AACATTCCGGGCGCGGGAACCGACCCCAGCACCAGGGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCa < 2:2591684/148‑1 (MQ=255) cgccgcGCGTGAGCCTGAAGTGGACGACCTGGCCAACTAAATCCACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCCTCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCg < 2:3632294/149‑1 (MQ=255) ccgcGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCgag > 2:7018082/1‑149 (MQ=255) cgcgggTGAGCGTTATGTGGTCGCCCGGGCAAACTTCATCACCGCCTGGGGCGGT‑AACTTTCTGGGCGCCGGTACCGACACCACCACCAGCGTGGGTGCCGCACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCgaga < 2:2077873/149‑1 (MQ=255) cgcgcgTGAGCCTTATGTGGTCGCCCGGGCAAACTTAATCACCCCCTTGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCGGGTACCCACACCATCACAAGCGATGGTGTCCAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCgaga < 2:2572192/149‑1 (MQ=255) cgcgcgTGAGCCTGATGTGGTCGACCTGGCCAACTCCAAAACCGCCATGGGCGGG‑ACCATCCTGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCAGCGTGGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCgaga < 2:5896744/149‑1 (MQ=255) gcgggTGAGCGTGATGGGGTCGACGTGGCCAACTAAATCAACGCCTTGGGGGGT‑AACCTTCTGGGCGCGGTTACCTACACCATCACCATCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGAc < 1:1771587/149‑1 (MQ=255) gcgcgTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGAc > 1:5777045/1‑149 (MQ=255) aGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGtacc > 2:6827000/1‑149 (MQ=255) cTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGtacctac > 2:3985288/1‑149 (MQ=255) cTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAAATACCGCGTGAAGCCGGACCGCATCGAGACCGGaacctac > 2:1453519/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTacctacct > 2:6695530/1‑149 (MQ=255) gAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTacctacct > 2:2409724/1‑149 (MQ=255) tCGACCGGCCAAACTTCATCACCGCCTGGGGGGTT‑AACTTCCCGGGCGCGGGTACCGACACCAGCCCAATGGCTGGTGTCCAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGcc < 1:2965830/149‑1 (MQ=255) ccggcccAACTAAACCAACGCCTTGGGCGGT‑AACTTTCCGGGCGCCGTAACCCCCACCAACACCATCGTTGGTTTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTg < 1:2290994/144‑1 (MQ=255) ccTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTg > 1:5673935/1‑149 (MQ=255) tGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGcc > 2:1089359/1‑149 (MQ=255) tGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGcc > 2:4459679/1‑149 (MQ=255) ggCCAACTTCATCACCGCCATGGGCGGG‑AACATTCCGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCg < 2:4965340/149‑1 (MQ=255) caaaCTTAATCACCG‑CATGGGGGGGTAAAATTCCGGGGGCCGGTACCGACACAACCACCATCGTGGGTGTCGCACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTg < 1:4757248/147‑1 (MQ=255) cAACTAAATCAACGCCTTGGGCGGG‑AACTTTCAGGGCGCCGTTACCGACCCCAACACCTACTATGTTGTCTAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGa < 2:5061041/149‑1 (MQ=255) aaCTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGAc > 2:2635917/1‑149 (MQ=255) aCTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGAcc > 1:2512633/1‑149 (MQ=255) ttCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCgg > 1:4523548/1‑149 (MQ=255) tcatcaCCGCCCTGGGCGGG‑AACATTCCGGGCGCCGGTACCGACCCCATCCCCATCGTGGGTGTCGCACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGt < 2:3045595/149‑1 (MQ=255) catcaACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCAGCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTg < 2:1770978/149‑1 (MQ=255) atcaACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTgg > 1:1289130/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCTGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGAGGGTGTCGAACGTCTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCcg < 1:4247017/149‑1 (MQ=255) gCCTTGGGCGGG‑AAAATTCAGGGCGCCGTTACCGACACCAACACAATCGTTGGTGTCCAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgt < 2:2677956/149‑1 (MQ=255) cctggggCGGT‑AACATTCCGGGCGCCGGTCCCGAACCCCTCCCCCTCGAGGGTGTGGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtc < 2:1283293/145‑1 (MQ=255) ctggggCGGT‑AACATTCCGGGCGCCGTTACCGACCCCACCCCCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtca < 2:1959387/146‑1 (MQ=255) cATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtca > 1:5500806/1‑149 (MQ=255) ttGGGCGGT‑AACTTTCCGGGCGCCGGTACCTACACCATCACCATCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaa < 1:6121701/148‑1 (MQ=255) tggggCGTT‑AACTTTCTGGGCGCGGGTACCCACACCATCACAATCTTGGGTGACGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaa < 1:7138294/147‑1 (MQ=255) tggggCGGT‑AACATTCCGGGCGCGGGTACCCACACCATCACCATCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaa < 1:4278533/147‑1 (MQ=255) cggggCGGT‑AACTTCCGGGGCGCCGGTACCGAACCCACCCCCCTCGTTGGGGTCCAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaa < 1:7245006/147‑1 (MQ=255) gggCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaagg > 1:214872/1‑149 (MQ=255) gggtaaCATTCCGGGCGCGGTTCCCCACCCAAACACATTCGTTGGTGCCCAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaaggtca < 1:925636/145‑1 (MQ=255) ggg‑AACATTCCGGGCGCGGGTACCGACCCCATCACCATCGAGGGTGTCGCACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaaggtcaa < 2:2176465/149‑1 (MQ=255) gg‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaaggtcaag > 2:728092/1‑149 (MQ=255) gg‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaaggtcaag > 1:6205001/1‑149 (MQ=255) gg‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCgtcaaggtcaag > 2:2502980/1‑149 (MQ=255) g‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGtcaaggtcaagg < 2:6926646/149‑1 (MQ=255) aaCATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGa > 2:3871949/1‑149 (MQ=255) cATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGaca > 2:3559143/1‑149 (MQ=255) aTTCTGGGCGCGGTTACCGACACCATCACCTGGGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGacac < 1:6130975/149‑1 (MQ=255) aTTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGacac > 1:6781680/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGAGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTAACTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCg > 1:5914934/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCt > 2:5478357/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCt > 1:7471048/1‑149 (MQ=255) cgcCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTa > 1:2663745/1‑149 (MQ=255) cgcCGGCACCGACACCACCCCCACCGAGGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTa < 1:6806810/149‑1 (MQ=255) ccGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTAcc > 2:472601/1‑149 (MQ=255) ggttACCCACACAAACACCTTCGTTGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCa < 1:754384/146‑1 (MQ=255) gTACCGACACAACCACAATCGAGGGTGTCTAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATc < 1:5427575/149‑1 (MQ=255) aCCTACACCATCACCATGTTTGGTGTCCAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCt < 1:994911/149‑1 (MQ=255) gACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGa < 2:2900970/149‑1 (MQ=255) gACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGa < 2:3218639/149‑1 (MQ=255) acacCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGaa > 2:6865474/1‑149 (MQ=255) atcaccatcGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGt > 1:3434618/1‑149 (MQ=255) atcaccatcGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGt > 2:2317551/1‑149 (MQ=255) atcaccatcGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGt > 1:5197465/1‑149 (MQ=255) agcaccatcGCTGGGGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGt < 2:7008725/147‑1 (MQ=255) ccccatgGTTGGTGCCCAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGTGc < 1:2746296/147‑1 (MQ=255) atcGAGGGTGCCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGTGCTTGa < 2:6775937/149‑1 (MQ=255) tcGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGTGCTTGaa > 1:105873/1‑149 (MQ=255) | GAGAACATCATGATGGCCGCTGCCTTGGCCAAGGGCCGCAGCGTGTTGCAGAACGCCGCGCGTGAGCCTGAAGTGGTCGACCTGGCCAACTTCATCAACGCCATGGGCGGG‑AACATTCAGGGCGCCGGTACCGACACCATCACCATCGATGGTGTCGAACGACTGGATTCGGCCAATTACCGCGTGATGCCGGACCGCATCGAGACCGGTACCTACCTGGTTGCCGCTGCCGTGACCGGTGGCCGCGTCAAGGTCAAGGACACCGACCCTACCATCCTTGAAGCCGTGCTTGAAAA > NC_002947/1103754‑1104049 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |