Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,824,717 | C→T | M144I (ATG→ATA) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,824,717 | 0 | C | T | 99.4% | 1128.5 / NA | 306 | M144I (ATG→ATA) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (153/151); minor base G (1/1); total (154/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
GGGCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGCATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATCAGCATGTAGACGTTGCTGACCATGCCGG > NC_002947/3824571‑3824862 | gggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTAt < 2:3415534/149‑1 (MQ=255) ggCGGTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATc < 2:765728/149‑1 (MQ=255) ggTCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAgg < 2:5418305/149‑1 (MQ=255) tCATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGaa < 2:636250/149‑1 (MQ=255) cATCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGACTGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGCAg > 2:3245148/1‑149 (MQ=255) tCCACCAGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgt < 1:3474459/149‑1 (MQ=255) ccaccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtg > 1:2160632/1‑149 (MQ=255) caccaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGgtgt > 2:5803530/1‑149 (MQ=255) accaGGCGCCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTCTCAGGAAGGTGtt > 2:4546981/1‑149 (MQ=255) cgcCACCAGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGcgcg < 2:4853039/149‑1 (MQ=255) ccaccaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTg < 1:592396/149‑1 (MQ=255) caccaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGa > 1:1451522/1‑149 (MQ=255) caccaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGa > 1:5585271/1‑149 (MQ=255) accaGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGaa > 2:5182269/1‑149 (MQ=255) caGAAGAACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACg > 2:859562/1‑149 (MQ=255) agaagaACGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGc > 1:3873193/1‑149 (MQ=255) agaaCGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCg > 1:2845947/1‑149 (MQ=255) cGCCCAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGccc > 1:5447882/1‑149 (MQ=255) cccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCCGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg < 2:5928533/149‑1 (MQ=255) cccAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCgg < 2:2095877/149‑1 (MQ=255) cAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 1:3360451/1‑149 (MQ=255) cAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 2:707872/1‑149 (MQ=255) cAGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGt > 2:6159067/1‑149 (MQ=255) aGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTg > 1:1755609/1‑149 (MQ=255) aGATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTAGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTg > 2:1096667/1‑149 (MQ=255) gATCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGa < 1:5678904/149‑1 (MQ=255) aTCACGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGaa < 1:3512377/149‑1 (MQ=255) cGGCAGGCAGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCaa > 1:1723215/1‑149 (MQ=255) ggccggcaGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAAt < 2:657610/149‑1 (MQ=255) ggcaggcaGGCCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAAt < 2:2536705/149‑1 (MQ=255) gcaggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGcac < 1:2097265/149‑1 (MQ=255) aggcCTTCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGTACACCACCGAAATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGTAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAg < 2:2172179/149‑1 (MQ=255) ttCGATGATGAACATCCAGCGCCAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTaca < 1:2808481/149‑1 (MQ=255) 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ccAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCg < 1:5184408/149‑1 (MQ=255) cAGTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGc > 2:2499177/1‑149 (MQ=255) gTCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAg < 2:2952124/149‑1 (MQ=255) tCGTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGc > 2:1351453/1‑149 (MQ=255) gTAATGCTTGATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGACTGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCACTGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCt < 2:1796666/149‑1 (MQ=255) 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gATCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCAccc < 1:635171/149‑1 (MQ=255) aTCAGGTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCAcccc > 2:4782528/1‑149 (MQ=255) ggTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGc < 1:7174062/149‑1 (MQ=255) ggTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGc > 2:1686614/1‑149 (MQ=255) gTAACCGGACACCACCGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCa < 1:1276773/149‑1 (MQ=255) 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ccGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCg > 1:1855598/1‑149 (MQ=255) cGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGa < 1:5150967/149‑1 (MQ=255) cGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGa < 1:5783252/149‑1 (MQ=255) cGACATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGa < 2:4105281/149‑1 (MQ=255) aCATCCACAGAATGGTCACCGGGTTGCCCAGTATCAGGAAGGTGTTGGCGCGTGAACGCTCGGCCCGGGTGAACCAATGGCACAGGTACACCAGCATGGCCGGCATGACCGCAGCCTCCACCACCCCGAGCAGGAAGCGGATGCCGATc < 1:6070848/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |