| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,173,697 | A→G | L112P (CTG→CCG) | PP_1028 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,173,697 | 0 | A | G | 98.5% | 247.6 / ‑4.6 | 68 | L112P (CTG→CCG) | PP_1028 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (24/43); total (25/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
TGCTGGCGCAGCACCGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCAGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCAAGCGTCGCGCCC > NC_002947/1173565‑1173829 | tGCTGGCGCAGCACCGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGc > 1:103349/1‑136 (MQ=255)tGCAGGCGGAGCACCGGCAAGCGCAGCAGGCCGATATCCAGCGGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCAGACCAATCTCCAGCAAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCAGGc > 2:725754/1‑136 (MQ=255) cagcaCCGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGa > 2:983928/1‑136 (MQ=255) cagcaCCGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGa > 1:671161/1‑136 (MQ=255) cGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCccg > 2:786315/1‑136 (MQ=255) cGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCccg < 2:618023/136‑1 (MQ=255) cGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCACAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCccg > 2:31738/1‑136 (MQ=255) gCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCccgcc < 1:672863/136‑1 (MQ=255) aGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGt < 2:685733/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGACACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:628218/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:646735/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:628080/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:32894/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:301999/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:158205/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:1236681/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:1084153/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:890916/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:676900/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:1071432/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:1137389/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:281005/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:31882/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:388714/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:427142/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:1143741/136‑1 (MQ=255) aaCAGGCAGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:1183069/136‑1 (MQ=255) atatCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGc < 2:346935/136‑1 (MQ=255) tatCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGcg > 2:1082397/1‑135 (MQ=255) tatCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCt > 1:200216/1‑136 (MQ=255) atCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCTGCTGTGCCTCCGATGTCTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCGGTGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTg < 2:680315/136‑1 (MQ=255) atCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGTTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTg < 2:726657/136‑1 (MQ=255) atCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTg < 2:92464/136‑1 (MQ=255) atCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTg < 2:70807/136‑1 (MQ=255) atCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTg < 2:1152735/136‑1 (MQ=255) atCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTg < 2:894311/136‑1 (MQ=255) atCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTg < 1:1314703/136‑1 (MQ=255) tCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTgg < 2:1313836/136‑1 (MQ=255) aaTGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAg < 1:1315404/136‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGTGCCTCCGTTGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCGCGGGCGAGCCAGAAGCACGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCt < 1:546826/136‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCGTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCt < 1:269163/136‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCt < 2:671161/136‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCt < 1:786315/136‑1 (MQ=255) gCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCaa < 1:23897/136‑1 (MQ=255) cTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAAc > 1:651931/1‑136 (MQ=255) ccTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 2:667298/90‑1 (MQ=255) ccTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg > 1:667298/1‑90 (MQ=255) ccTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTg < 1:626052/136‑1 (MQ=255) ccTCCGATCACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCAGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTCCAACCCTTg > 1:868398/1‑136 (MQ=255) cTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTgg < 2:1260481/136‑1 (MQ=255) tgcGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACggg < 1:934045/136‑1 (MQ=255) cgcAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGtt > 2:677464/1‑135 (MQ=255) cgcAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTa > 1:194254/1‑136 (MQ=255) cgcAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTACCCAGGGCGAGCCAGAAGCCCGACAGTCAGTGGCACGCTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCGTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGtt > 2:784482/1‑135 (MQ=255) aaTCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg < 1:223575/71‑1 (MQ=255) aaTCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTg > 2:223575/1‑71 (MQ=255) ccAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTc > 1:244377/1‑136 (MQ=255) ccAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTc < 2:103349/136‑1 (MQ=255) gAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCTCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCt > 2:136040/1‑136 (MQ=255) cTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAg > 2:241238/1‑136 (MQ=255) cTTCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGc > 1:472649/1‑136 (MQ=255) ttCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCa > 1:696354/1‑136 (MQ=255) ttCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCa > 1:1151982/1‑136 (MQ=255) ttCAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCa > 1:663862/1‑136 (MQ=255) cAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCAAg > 1:1117205/1‑136 (MQ=255) cAGGTAGTTCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCAAg > 1:6271/1‑136 (MQ=255) gTAGATCCCCGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCAAGCGt > 1:855230/1‑136 (MQ=255) cccGGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCAAGCGTCGCGccc < 2:1330984/136‑1 (MQ=255) | TGCTGGCGCAGCACCGGCAAGCGCAACAGGCCGATATCCAGCCGTCCGGCAGCAATGTCTTCCAGCTGTGCCTCCGATGACTGCTGCGCAATCTCCAGCGAAACCCCTGGGTTGTGCTTCAGGTAGTTCCCCAGGCGAGCCAGAAGCCCGCCGGTCAGTGGCACGGTGCTGGAATGGTTCAGGCGCAAGCTGCCTTGCAACCCTTGGCCAATGTCACGGGTAACCCGCTCGGCCTGTGCCAGGTCGGCCAGCAAGCGTCGCGCCC > NC_002947/1173565‑1173829 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |