| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,772,183 | 0 | T | . | 6.9% | 535.0 / 32.0 | 159 | intergenic (‑84/+25) | PP_2422/lpxOA | hypothetical protein/Fe(2+)/alpha‑ketoglutarate‑dependent dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (85/63); new base . (7/4); total (92/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.62e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TCGCCGATGCCGGCCATTAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCACCAACGCCGCGACCACTGCCCATTTTTCCAGGTAGTAGCGCATGCGGTTGCGCTTCTTCAGCGCCTTGCCACGCTCGCGGATCTTGTAGATGCGGGTGAACA > NC_002947/2772035‑2772332 | tCGCCGATGCCGGCCATTAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTc < 2:2853421/150‑1 (MQ=255)tCGCCGATGCCGGCCATTAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTc < 2:1274677/150‑1 (MQ=255) cGATGCCGGCCATTAACTGCTTACGGTAGGCGTCCCAGTCCATCATGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTAc > 1:2865311/1‑150 (MQ=255) 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atcatGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGc > 1:1149922/1‑150 (MQ=255) atGCTCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGATGAACACCAGCAcc < 2:1281734/150‑1 (MQ=255) tCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑Gt < 2:3624015/105‑1 (MQ=255) tCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCa < 2:2594076/124‑1 (MQ=255) tCATCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCa > 1:2594076/1‑124 (MQ=255) aTCGTCTTCACCTTGGGGGTTGCGAGTGGAGCTTTCAGGCTAGTCGAAGCGTGGCACGTGCGAGGCGGTACTTTGGTGGGTAAACGCAGGTCACTCGTACG‑GTGGCCTGCGTTGAGCCTTCAGATGTAGAt > 2:5327271/1‑131 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |