| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,999,172 | Δ1 bp | 17.7% | intergenic (‑163/+37) | PP_5252 ← / ← PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,999,172 | 0 | C | . | 17.7% | 362.9 / 92.3 | 141 | intergenic (‑163/+37) | PP_5252/PP_5253 | hypothetical protein/arylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (53/58); new base . (16/9); total (73/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
AGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTCC > NC_002947/5999024‑5999320 | aGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCt < 2:3804950/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTg < 1:3038331/150‑1 (MQ=255) ggggCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTg > 2:5125331/1‑150 (MQ=255) gCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCTA‑CA‑ACGTCGGttg > 1:1156467/1‑148 (MQ=255) cGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGa < 2:1171462/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGa < 1:2187068/150‑1 (MQ=255) ggCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAg < 2:2701716/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGc < 2:3663716/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑gg < 2:4720572/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑gg < 2:722301/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑gg < 1:4837173/150‑1 (MQ=255) aGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑gg < 1:2871933/150‑1 (MQ=255) gggggACTGCGAAGCATGCCGTTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGATTGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑ggt < 1:1933299/150‑2 (MQ=255) ggggACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGt < 2:2248355/150‑1 (MQ=255) aCTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCACCTA‑CC‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGGTTaa > 1:2576455/1‑149 (MQ=255) cTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTAcc < 1:4967413/150‑1 (MQ=255) tGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCACCAA‑CA‑ACCTCTGTAGGAGC‑GGGTTTAacc > 1:3765004/1‑150 (MQ=255) tGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCGA‑AA‑ACGTCTGTATGAGC‑GGGTTTAacc > 1:1439437/1‑150 (MQ=255) cGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTCGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCcgc < 1:1238382/150‑1 (MQ=255) cGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAATCCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCcgc > 2:2855901/1‑150 (MQ=255) cGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCcgc < 1:4167329/150‑1 (MQ=255) gAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGGTTACCcgcg > 2:500615/1‑150 (MQ=255) gAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCcgcg > 2:3950204/1‑150 (MQ=255) gAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCACCTC‑CA‑AACAGAGTAGGGGCGGGGTTTAccccg > 1:1814595/1‑148 (MQ=255) aGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGaa < 1:3681675/150‑1 (MQ=255) ccGGTTGTTGCACGGCCGGGGCTTGATTGGTTGTGCGGTGGGTTGAAGATGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTTTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTc < 1:2858766/150‑1 (MQ=37) cGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCG‑ACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGaagaggccg < 2:4039025/150‑8 (MQ=37) gTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGGTTACCCGCGAATGTTTCCca > 2:3393641/1‑150 (MQ=255) aaGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAcc > 2:3544168/1‑150 (MQ=255) aaGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTACCACAATTaac > 2:4695220/1‑148 (MQ=255) tGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGACAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑CCGTCTGTCGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGac < 1:1269501/150‑2 (MQ=255) aaTGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTAACGCTGAAGGAACGcc > 2:1272425/1‑150 (MQ=255) tGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCACCAA‑AA‑ACGTATGTTGGAGC‑GGGTTTTACCCCCCATTTTTGCCACAAAAAACCCTGAAGGGACGcccc > 1:4552739/1‑148 (MQ=255) aTGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCaa < 2:4718538/150‑1 (MQ=255) gtgCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGt > 1:4869436/1‑91 (MQ=255) tgCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTCGGAGC‑GGTTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTc < 1:1081430/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAg > 2:3250613/1‑94 (MQ=37) ggTGGGTTTAAGATGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTA‑AA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTc < 1:171783/150‑1 (MQ=255) gTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGGTTAACCGCGAATTTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCa > 1:4065298/1‑150 (MQ=255) ggtttGAAGAAGTTTCGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCGGCCTGGGCCGGCCTCTTGGCGGTTAAACCCGATCCAA‑CA‑ACGTCTGTAGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCAtt < 1:3347143/147‑1 (MQ=255) ggTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCTA‑CA‑ACGACTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAAGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCAATc > 2:2596476/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCa < 2:4889413/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCa < 2:4889278/150‑1 (MQ=255) agaagGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCACCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTAACCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTACTCAATCAgctgc > 2:1552944/1‑150 (MQ=38) agaagGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCGA‑CA‑ACGTCAGTAGGAGC‑GGGGTTAACCGCGAATGTTTACCACAATTACCGCAGAAGGAAAGCCCGCAAGTCCTCATTAagcagc > 1:1241197/1‑150 (MQ=255) gaagGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCCCAATGACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAgctgct < 2:1961172/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 1:2129784/150‑1 (MQ=255) gCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGa < 1:1056065/150‑1 (MQ=255) cccTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTAACCGCGAAAGTTTCCCACAAATACCGCGGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAg > 2:5078662/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTAACCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACCCCAGCAAGTCCACATTCAGCTGCGGCGCATGAGTc > 2:1096263/1‑150 (MQ=38) aaGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCTA‑CA‑ACGTCTGGAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCGCAATCAGCGGCTGCGCCTGAGTCACTGCa > 2:2416511/1‑150 (MQ=38) tttttGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTACAAAAc < 2:844208/150‑1 (MQ=255) tttttGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAA‑CA‑ACGTCTGGAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCGGAAGGACCGCCACCAACGCCTCAATCAGCTGCGGCGCATGAGTCCCTGCAAAAc > 2:3589264/1‑150 (MQ=37) ttGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGt < 2:2545029/150‑1 (MQ=255) tgctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTg < 1:770670/150‑1 (MQ=255) ggtaccTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGA‑CA‑ACCTCTGTAGGATC‑GGGTTTAACCGCGAAAGTTTCCCACAAATACCGCTGGAGGAAACCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCAAGAGTCACTGCAAAACCGTgc > 2:241875/5‑150 (MQ=37) gctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgc < 1:2660829/150‑1 (MQ=255) gctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgc < 2:638723/150‑1 (MQ=255) ctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGTGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcg < 2:59947/150‑1 (MQ=255) ctgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcg < 2:60080/150‑1 (MQ=255) tgcCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTAACCGCGAATGTTTCCCACAAATACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCAATCAGCTGCTGCGCATGAGTCACAGCAAAACCGTgcgg > 2:1781168/1‑150 (MQ=38) ttCGCGGGTAAACCGGCTCCTA‑CA‑ACGTGTGTCGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACAcc < 1:1991186/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCATA‑CAGACCT‑TGTAGGAGC‑GGGTTAACACGCGAATGTATCCCACAATTACCGCTGAATCAACCCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACAGCAAAACAGTGCGGCGCCCCGGCATACAcc > 2:3005049/1‑150 (MQ=25) cgcgGGTAAACCCCCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAAATACCGCTGAAGGAAAGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCCTGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCtg > 2:202509/1‑149 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCa < 1:5450997/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcg > 2:4497792/1‑128 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTgcg < 1:4497792/128‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAg < 2:2576455/150‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTc < 2:1421066/148‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTTTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCgg < 1:244339/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 1:3671764/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGATGAAGGAACGCCAGCACGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgc > 2:4011829/1‑150 (MQ=38) cccGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 2:5326999/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcg > 2:1188352/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 1:2978170/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 1:1485696/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 2:3127575/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 2:2653083/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGgcgc > 1:3474021/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGcc < 1:1041663/150‑1 (MQ=255) gCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 1:2303620/1‑150 (MQ=255) gCTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 1:4561595/1‑150 (MQ=255) gCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 1:5266161/1‑150 (MQ=255) gCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCa > 1:2455178/1‑150 (MQ=255) cTCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCAc > 2:5106502/1‑150 (MQ=255) cTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCAc < 1:1188352/150‑1 (MQ=255) cTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCAc > 1:4992029/1‑150 (MQ=255) tCCTA‑CAGACGT‑TGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACg > 1:2539132/1‑150 (MQ=255) cTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGaa > 1:4414539/1‑150 (MQ=255) tA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAAt > 2:179164/1‑150 (MQ=255) a‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATc > 2:3374194/1‑150 (MQ=255) a‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATc < 2:3764991/150‑1 (MQ=255) a‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATc < 2:3765004/150‑1 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAg > 1:1689894/1‑150 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAg > 1:4114173/1‑150 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCACGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAg > 1:5204687/1‑150 (MQ=255) a‑aCGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTACCCACAATTACCCCTGAAGGACCGCCAGCAAGACCACATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACAGCAAAACCGAGCGGCGCCCCGGCATACACCATCAGCTCGCCGCCACCAATCac > 2:803257/1‑149 (MQ=255) aCGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGc < 1:3544168/150‑1 (MQ=255) gTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTc < 2:727870/150‑1 (MQ=255) tCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTcc > 2:3201315/1‑150 (MQ=255) | AGGGGCCGGCAGGGGGACTGCGAAGCATGCCGGTTGATGCAAGGCCTGGGCTTGAATGGATGTGCGGTGGGTTGAAGAAGGTTAGCCCTGGTCAAGCTTTTTGCTGCCTGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA‑CA‑ACGTCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAATGTTTCCCACAATTACCGCTGAAGGAACGCCAGCAAGTCCTCATTCAGCTGCTGCGCATGAGTCACTGCAAAACCGTGCGGCGCCCCGGCATACACCTTCAGCTCGGCGCCACGAATCAGCTCC > NC_002947/5999024‑5999320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |