| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,322,457:1 | +C | 5.6% | coding (749/945 nt) | PP_2041 ← | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,322,457 | 1 | . | C | 5.6% | 794.3 / 37.4 | 179 | coding (749/945 nt) | PP_2041 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (80/89); new base C (4/6); total (84/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCT > NC_002947/2322309‑2322605 | ccAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGAAGGCGGCGGAGAAAGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCAACTATCAGCCGCGCGCTGGCAg‑g > 1:3406300/1‑150 (MQ=255) aGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑gcg > 2:1616560/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑gcgc < 2:1082566/150‑1 (MQ=255) tcgctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGcc > 1:4733366/1‑150 (MQ=255) cgctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCa < 1:5172752/150‑1 (MQ=255) ctGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGa < 2:2874019/150‑1 (MQ=255) tGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGAt > 1:4602278/1‑150 (MQ=255) cgcACCGCATCCACCAGCAGTGCTCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGC‑CTGCCAGCGCGCGGctgatagt < 1:3840369/150‑8 (MQ=255) gcACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCca < 2:1123862/150‑1 (MQ=255) cACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCcag > 2:33076/1‑150 (MQ=255) cACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCcag > 2:4176719/1‑150 (MQ=255) aCCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCcagc < 2:3215888/150‑1 (MQ=255) cGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCcagcag > 1:2061143/1‑150 (MQ=255) gCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCagcagc < 2:3502790/150‑1 (MQ=255) gCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCagcagc > 2:1598286/1‑150 (MQ=255) gCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCagcagc < 2:3338908/150‑1 (MQ=255) ccaGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGcc > 1:4656/1‑150 (MQ=255) cagcagTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCa < 2:3948447/150‑1 (MQ=255) cagTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGtt < 2:2619492/150‑1 (MQ=255) cgTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTg < 2:4618824/149‑1 (MQ=255) agTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTg < 1:4686980/150‑1 (MQ=255) tGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCt > 1:5445234/1‑150 (MQ=255) cgcgcACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGa < 2:2090833/150‑1 (MQ=255) cgcACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGAtg < 2:2175285/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGgc < 2:1245058/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGgc > 1:4981868/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGgc < 2:4784226/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGgc > 1:1152603/1‑150 (MQ=255) gcgcATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCgccag > 2:2468697/1‑150 (MQ=255) gcATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCCG‑CCGCTGCTGGATCTGGCCGCGCCTGCCAgc < 2:129566/129‑2 (MQ=37) gcATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCCG‑CCGCTGCTGGATCTGGCCGCGCCTGCCAgc > 1:129566/1‑128 (MQ=37) cATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCgccaggcc > 2:4957026/1‑150 (MQ=255) cATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCgccaggcc > 2:3686728/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCa < 1:4309516/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCa > 2:919615/1‑150 (MQ=255) ggcggcggcGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACg < 1:248646/150‑1 (MQ=255) cggcggcgAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGa < 1:5257836/150‑1 (MQ=255) ggcggcgAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTTCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGAc < 1:4432746/150‑1 (MQ=255) cggcgAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCCGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCa < 2:4955589/150‑1 (MQ=255) 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gCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTg < 1:2343460/150‑1 (MQ=255) gCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTg < 2:1211819/150‑1 (MQ=255) gATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGa > 1:3171025/1‑150 (MQ=255) tGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCa < 1:1231557/150‑1 (MQ=255) cGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAgt < 1:1242223/150‑1 (MQ=255) ggcgATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAgtgt > 1:4574068/4‑150 (MQ=255) ggTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAgtgt < 2:5101594/150‑1 (MQ=255) tGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCca < 1:2992364/51‑1 (MQ=255) tGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCca > 2:2992364/1‑51 (MQ=255) cACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTc > 2:216707/1‑129 (MQ=255) cACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCAt > 1:5412559/1‑150 (MQ=255) aCTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATg < 2:5186551/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCa < 1:4493723/150‑1 (MQ=255) aTCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCa < 1:2149098/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGc < 2:4313465/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGc > 1:1129803/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCt > 1:1303329/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGGGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCt > 1:1848095/1‑150 (MQ=255) gCCGCGC‑CTGCCAGCGCGCGGCTAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGActg > 2:177341/1‑103 (MQ=255) gCCGCGC‑CTGCCAGCGCGCGGCTAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGActg < 1:177341/103‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTc < 1:253400/150‑1 (MQ=255) gcTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGAt < 1:1934054/150‑1 (MQ=255) tGGCAT‑GCGCTGCCAGATCCATCATCGGCGGCCAGTTTCTGATGGTGGCCGCCATGCCATCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTAGATgc < 2:3407826/150‑1 (MQ=255) tGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATgc < 1:3109559/150‑1 (MQ=255) tGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATgc > 2:2268504/1‑150 (MQ=255) cAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGcc > 2:2650577/1‑150 (MQ=255) cAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGcc > 2:2650724/1‑150 (MQ=255) aG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCt < 2:4681374/150‑1 (MQ=255) | CCAGCGCTCGCTGCGCACCGCATCCACCAGCAGTGCGCGCACCAGGTCGCGCATGCAGGCGGCGGCGAACGACAGCGGCTTGTGCTGCGAGTGGGCCAAGGCGATGGTGCGGGTGATGCGCGGTTCCACTATCAGCCGCGCGCTGGCAG‑GCGCGGCCAGATCCAGCAGCGGCGGCCAGTTGCTGATGGTGGCCGCCAGGCCAGCACGGACCAGGCTGGTGATACCGGGGGCCGACTGCTGTTCGTAGCTGGAGTCCAGTGTCACACCGGTTTCCATGGCAGCCTGCTCGATGCGCCT > NC_002947/2322309‑2322605 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |