| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,823,901:1 | +T | 100% | coding (1248/1293 nt) | kguT ← | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,823,901 | 1 | . | T | 99.0% | 741.1 / ‑0.8 | 207 | coding (1248/1293 nt) | kguT | 2‑ketogluconate transporter, putative |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base T (104/101); total (104/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
GTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCA‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGC > NC_002947/3823754‑3824042 | gtggtgTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCatg < 2:167838/150‑3 (MQ=255) cACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTgg > 2:4944810/1‑150 (MQ=255) aCCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTggg < 2:4919205/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGaa < 1:3198391/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGaa < 2:5271610/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCGTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGaa < 2:2889801/150‑1 (MQ=255) cACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCGATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTg < 1:2725156/150‑1 (MQ=255) aCCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCTAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACTATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCTAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 1:2596146/150‑1 (MQ=255) aCCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGa < 2:2638965/150‑1 (MQ=255) ccTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAg < 1:966882/150‑1 (MQ=255) cTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGACGTATTGAgc > 2:429080/1‑150 (MQ=255) cTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAgc > 1:3430274/1‑150 (MQ=255) cTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAgc > 1:3119394/1‑150 (MQ=255) cTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAgc > 1:2430115/1‑150 (MQ=255) cTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAgc > 1:842041/1‑150 (MQ=255) cgcgATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGc < 2:1956033/150‑1 (MQ=255) gATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGt < 2:2275366/150‑1 (MQ=255) gATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGt < 2:3981030/150‑1 (MQ=255) tCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTaa < 2:3289539/150‑1 (MQ=255) tCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTaa < 2:3289566/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGTGCCGTCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAgcgc > 1:2861791/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAgcgc < 1:4218881/150‑1 (MQ=255) gTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGc > 2:594186/1‑150 (MQ=255) tGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCa < 1:136317/150‑1 (MQ=255) ccATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGt < 2:2692621/150‑1 (MQ=255) ccATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGt > 1:4242559/1‑150 (MQ=255) ccATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATGCTCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCTAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCAATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGTTAAGCGCCACTGCAGt < 2:2005124/150‑1 (MQ=255) cATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTc < 2:2777064/150‑1 (MQ=255) cATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTc > 1:1582967/1‑150 (MQ=255) cATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTc > 1:1175053/1‑150 (MQ=255) aTCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTca > 2:3083406/1‑150 (MQ=255) aTCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTca > 2:5073327/1‑150 (MQ=255) aTCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTca > 2:745721/1‑150 (MQ=255) aGTCGTCGGACAGGCGTTTATCCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTcagaag < 1:497648/150‑1 (MQ=255) tcgtcgGACTGGCGTTTATACAGGACGTTTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTAATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTGTGCCCGGCAATGAGGTCTGGTAATTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcg < 1:648413/150‑1 (MQ=255) cgtcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAgcgc < 1:3759477/150‑1 (MQ=255) gtcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGca > 1:3053161/1‑150 (MQ=255) gtcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGca > 1:267091/1‑150 (MQ=255) tcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcac > 1:521400/1‑150 (MQ=255) tcgGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAAAGGTTCATGTCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCAGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcac > 1:3245417/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACcacaca < 1:3137114/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACAt < 2:1383632/150‑1 (MQ=255) tataCTGGACGATTCGCTTATTCATTGCTGGTTTCGTAATGGTTCATGGCCTGACGCGTGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGTGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAg < 1:1458264/150‑1 (MQ=255) tataCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAg < 2:1328590/150‑1 (MQ=255) tataCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTCCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTAGCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAg < 1:2440147/150‑1 (MQ=255) taCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGt < 2:875308/150‑1 (MQ=255) aCAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTa > 1:2813979/1‑150 (MQ=255) cAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTaa < 2:4041018/150‑1 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAag > 2:1478217/1‑150 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAag > 1:1636311/1‑150 (MQ=255) aGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAag > 2:3508387/1‑150 (MQ=255) ggACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAaga > 1:4901409/1‑150 (MQ=255) gACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAagag > 2:1480346/1‑150 (MQ=255) gACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAagag > 1:1685129/1‑150 (MQ=255) aTTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGgcgc < 2:2430115/150‑1 (MQ=255) ttCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGaa < 1:4131535/82‑1 (MQ=255) ttCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGaa > 2:4131535/1‑82 (MQ=255) tCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCg > 1:4540266/1‑150 (MQ=255) gCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCg < 1:2541157/94‑1 (MQ=255) ttcttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgc > 1:734875/1‑149 (MQ=255) tcgtccttGCCGGGTTCCGAATGGTTCCTGGCCAGACGCGAGCGATCGCGCTGTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGCGCGCCGCGGTAAGCGCCACGGCAGTCAGCAGCGCACCACACCTGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgccc < 2:3356807/144‑1 (MQ=255) ttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgc > 1:4391063/1‑150 (MQ=255) ttcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgc > 1:4837968/1‑150 (MQ=255) tcATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgcc > 1:3278542/1‑150 (MQ=255) cATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcccgccc < 2:1765467/150‑1 (MQ=255) gCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGaa > 2:3003956/1‑121 (MQ=255) gCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAg < 1:4490771/150‑1 (MQ=255) aGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTg < 2:4330755/94‑1 (MQ=255) aGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTg > 1:4330755/1‑94 (MQ=255) gTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCTCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGcccc > 1:932677/1‑150 (MQ=255) gTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGcccc > 1:5073182/1‑150 (MQ=255) tCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCAtt < 1:3623290/150‑1 (MQ=255) cTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcc > 2:5326276/1‑132 (MQ=255) cTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGgcc < 1:5326276/132‑1 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGTAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg < 1:4365045/150‑1 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg > 1:1406862/1‑150 (MQ=255) tAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAg > 1:1176582/1‑150 (MQ=255) tGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTa < 1:2522756/150‑1 (MQ=255) tGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTa < 2:2442403/150‑1 (MQ=255) tCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGccc < 1:4098245/150‑1 (MQ=255) aTGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGcacca > 1:3917748/1‑94 (MQ=255) tGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacc > 2:1615096/1‑150 (MQ=255) ggCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCccacca > 1:1351690/1‑150 (MQ=255) gCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAg > 2:1387531/1‑150 (MQ=255) ccAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGc < 2:2046786/150‑1 (MQ=255) ccAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGc > 1:3648748/1‑150 (MQ=255) cgcgAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa < 2:250697/150‑1 (MQ=255) cgcgAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGa < 2:5074676/150‑1 (MQ=255) gAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgcc > 2:689668/1‑150 (MQ=255) aGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGc < 2:3800292/119‑1 (MQ=255) aGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGc > 1:3800292/1‑119 (MQ=255) gCTATCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAgccgc < 2:5167346/150‑1 (MQ=255) tCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaaa > 1:2103422/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCaaa > 2:3663524/1‑150 (MQ=255) cgcgCTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAAc < 2:2252109/150‑1 (MQ=255) cgcTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGa > 2:4787795/1‑150 (MQ=255) gcTTTGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAg > 2:2344480/1‑150 (MQ=255) tttGCCCGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGcc > 2:1548146/1‑150 (MQ=255) cccGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAgc < 2:2236149/150‑1 (MQ=255) cGGCCATGAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAgg < 2:740726/112‑1 (MQ=255) | GTGGTGTCCACCCAGGTCACCTCGACGCGATCTTGCAGGCGTGCCATCAAGTCGTCGGACAGGCGTTTATACAGGACGATTCGCTTCTTCATTGCAGGTTTCCTAATGGTTCATGGCCAGACGCGAGCTATCGCGCTTTGCCCGGCCA‑GAGGTCTGGGAAGTATTGAGCGCAGCGGTAAGCGCCACTGCAGTCAGCAGCGCACCACACATGAACAGGTAAGAGGCGCCGGGCCCGCCCGTAGCCCCATTGAGGTAGCCCACCAGCCACGAGCCGCCAAACGAGCCCAGC > NC_002947/3823754‑3824042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |