| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,348,779:1 | +G | 5.1% | intergenic (‑239/+515) | galP‑I ← / ← PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,348,779 | 1 | . | G | 5.1% | 788.6 / 32.4 | 177 | intergenic (‑239/+515) | galP‑I/PP_1174 | porin‑like protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (74/94); new base G (3/6); total (77/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
GGCCAGGGGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTC > NC_002947/1348632‑1348924 | ccAGGGGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTc > 2:681612/1‑150 (MQ=255) cAGGGGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGtgt‑t < 1:3734741/146‑1 (MQ=255) cAGGGGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTGCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCg > 2:3719547/1‑150 (MQ=255) gggTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTAc > 1:4006810/1‑150 (MQ=255) ggTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTGTGTCGTAc > 2:2330360/1‑150 (MQ=255) gAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTGTGTCGTACAAc < 1:158471/150‑1 (MQ=255) aCGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTAt < 2:1583217/150‑1 (MQ=255) aCGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTAt < 2:1543559/150‑1 (MQ=255) aCGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTAt < 1:2925967/150‑1 (MQ=255) gcgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATgg > 2:4472798/1‑150 (MQ=255) cgcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATggg < 2:2239749/150‑1 (MQ=255) gcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGt < 1:310387/150‑1 (MQ=255) gcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGt < 1:4721615/150‑1 (MQ=255) gcgGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGt > 2:2056896/1‑150 (MQ=255) ggTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGCGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGa < 2:5065006/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGTTGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGAttatta < 2:224925/150‑1 (MQ=255) cGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGAttatta > 1:1657535/1‑150 (MQ=255) tACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGTGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAggg > 1:3447102/1‑150 (MQ=255) tACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAggg > 2:2513183/1‑150 (MQ=255) gTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGaa > 1:4156248/1‑150 (MQ=255) aCTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGa < 2:1272059/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGAt < 1:594635/150‑1 (MQ=255) ttgCAGTCGTACGCTAGGTGGCCGGGTGTTGATGTGGGTCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATTGTTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATTTTT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAATATg < 2:3447102/148‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGTCCGCGCGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACCGGGGGGGGTGCAGCGGGAGGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCTTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATg < 2:3446982/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATggg > 1:5017246/1‑150 (MQ=255) gCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGt < 2:1918604/150‑1 (MQ=255) cGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTc < 1:3902476/150‑1 (MQ=255) cGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTc < 1:712413/150‑1 (MQ=255) gTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCa > 1:3767929/1‑150 (MQ=255) aCGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATg < 1:3855092/115‑1 (MQ=255) gcgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGtgt‑tg < 2:5132720/100‑1 (MQ=255) gcgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGtgt‑tg > 1:5132720/1‑100 (MQ=255) gcgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTTTCAACgg > 1:1046197/1‑150 (MQ=255) cgAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGc > 2:3852597/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt < 2:5399695/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt < 1:5324696/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCt < 1:5324997/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGa < 2:3192846/150‑1 (MQ=255) gggCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATa < 2:3830457/149‑1 (MQ=255) ggCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTGTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATa < 1:2851049/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGc > 1:4461316/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCt < 2:1558458/150‑1 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 2:1958882/150‑1 (MQ=255) gggggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGa < 2:4524060/150‑1 (MQ=255) ggggAAGCGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAg < 1:4472798/150‑1 (MQ=255) gggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGt < 1:905354/150‑1 (MQ=255) gggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGt < 1:905360/150‑1 (MQ=255) ggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATa > 1:3640985/1‑142 (MQ=255) ggAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATa < 2:3640985/142‑1 (MQ=255) agagGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaata < 2:3759480/150‑1 (MQ=255) agagGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaata > 2:1228813/1‑150 (MQ=255) gagGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGtaataa > 2:1968076/1‑150 (MQ=255) agGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATaaa < 1:4849578/150‑1 (MQ=255) gggggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGa < 2:1638337/116‑1 (MQ=255) gggggggCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAg < 2:3373033/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 2:3767929/150‑1 (MQ=255) gCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 1:1228813/150‑1 (MQ=255) cAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTGTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCaa < 2:4721965/150‑1 (MQ=255) aCAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGa > 2:4757944/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTGCTGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTGGGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGTTTATTAGCTAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCGAGGACCCa > 1:2693528/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACgg > 1:1177479/1‑117 (MQ=255) gTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACgg < 2:1177479/117‑1 (MQ=255) gCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAggg < 2:3942586/90‑1 (MQ=255) aGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGc > 1:4324956/1‑150 (MQ=255) gggTTGGGTGTCTACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCATGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATATCTGAGTAATACAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGc < 1:3586730/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGaa < 1:1968076/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTAAAAATATGGGTGATTATTAGCAAGGGTAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCTGGCTGCAGAAg > 2:4337828/1‑150 (MQ=255) gggTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTACGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAg > 2:5238387/1‑150 (MQ=255) tgtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATGATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGctc < 2:4398331/150‑1 (MQ=255) gtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCt > 1:904464/1‑139 (MQ=255) gtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCt < 2:904464/139‑1 (MQ=255) gtCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGctct < 2:3493083/150‑1 (MQ=255) cGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGc < 2:933090/150‑1 (MQ=255) cGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGc < 2:4324956/150‑1 (MQ=255) gACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGcc > 1:4236499/1‑150 (MQ=255) caggggTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGt < 1:3115814/147‑1 (MQ=255) aTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTg > 1:1424249/1‑150 (MQ=255) aTGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTg < 2:745024/150‑1 (MQ=255) tGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTgg > 1:2644141/1‑150 (MQ=255) gggTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGa < 2:3107672/150‑1 (MQ=255) ggtCGTCCACGGCTTGGTGTGTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAct > 1:3418493/3‑150 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTGTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAc > 1:2210555/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGTGTGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAc < 2:2616203/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAct > 1:333216/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGAct > 1:619369/1‑150 (MQ=255) gTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGt > 2:3559455/1‑150 (MQ=255) tCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTa < 1:296991/150‑1 (MQ=255) tCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTa < 1:4757944/150‑1 (MQ=255) aCGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAg > 1:3802301/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACTGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGa < 2:665225/150‑1 (MQ=255) ttgttgTTTTTGTTATGTTT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCAGGGCTGCATAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAta > 1:4417724/1‑150 (MQ=255) tgttgtTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtac < 1:519359/150‑1 (MQ=255) gttgttTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtact > 1:1761915/1‑150 (MQ=255) ttgttTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtacta < 2:2681506/150‑1 (MQ=255) ttgttTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACAtacta > 1:2274071/1‑150 (MQ=255) tttttGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGTGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGa < 2:2926508/150‑1 (MQ=255) tttttGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGt < 2:4031647/126‑1 (MQ=255) tttGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACt > 2:5357873/1‑150 (MQ=255) tttGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACt < 1:2513183/150‑1 (MQ=255) ttATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTgggg > 2:4620544/1‑150 (MQ=255) | GGCCAGGGGTGAACGCGCGGTAACCGGGCGCTACGTACTGGCAGGCGTACGCGAGCTGGCCGGGGGAAGAGGGGGGGCAACAGGTGCGGGTGCAGCGGGATGGGTGTCGACATGGGTTCGTCCACGGCTTGTTGTTTTTGTTATGTGT‑TGTCGTACAACTATGGGTGATTATTAGCAAGGGGAAGATGGGCTGTCAACGGCTGATAGCTGAGTAATAAAGGTCCAAGGACCCAAAATCCGGGCTGCAGAAGCTCTGCCGTGGACTCTGTACAGACATACTACGACTGGGGCTC > NC_002947/1348632‑1348924 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |