| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 745617 | NA (NA) | 24 (0.150) | 13/264 | NT | NA | coding (885/1533 nt) | PP_0637 | transposase |
| ? | NC_002947 | = 745655 | NA (NA) | coding (847/1533 nt) | PP_0637 | transposase | |||||
GCGACCGCTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/745467‑745617‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT < NC_002947/745655‑745507 GCGACCGCTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑C > 2:3601459/1‑150GCGACCGCTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑C < 1:1456838/150‑1 CGACCGCTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CC < 1:2782414/150‑1 ACCGCTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCAC > 1:1169213/1‑150 GCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCACCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGC > 1:217593/1‑150 GCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCTCCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑C < 1:1830334/150‑1 CTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCTCCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGC < 1:1012045/150‑1 CTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCTCCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGC < 1:3388794/150‑1 GACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCT < 2:997807/150‑1 GACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCTCCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGA < 1:4893896/150‑1 GACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGA < 2:1840925/150‑1 ACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTG < 2:2988164/150‑1 ACGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCTCCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAG < 2:4403342/150‑1 CGAATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCTCCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGG < 1:986413/150‑1 GAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCAGCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGA < 1:2981624/150‑1 GAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGA < 1:2022387/150‑1 GAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGA < 2:1068688/150‑1 GAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGG < 1:3598071/150‑1 GAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGG < 2:2429783/150‑1 AATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAG < 2:4626442/150‑1 ATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCTCCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGG < 2:2412012/150‑1 ATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCACCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGG < 2:217593/150‑1 ATTTACGCCGAACATGCGCCATGCACGCCAGTCGCTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGCCCACCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGG < 1:4078940/150‑1 AACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTT > 1:4032764/1‑103 AACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTT < 2:4032764/103‑1 GTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGA > 1:374903/1‑92 GTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGA < 2:374903/92‑1 GGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CCTCCAGCAG‑GCGCAGCGGCACCTCCTGCGCGCGGCTGGTGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCAT > 2:1169213/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCCTGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 2:4176370/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 1:5413930/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT < 2:70051/150‑1 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 2:4300737/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT < 1:1420806/150‑1 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 2:2655864/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 2:188249/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 2:137835/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 1:4035095/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 1:717137/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT > 1:511936/1‑150 CACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCGGCGC‑CTGCTGGAGGGCTAACGCGGTTACGTGATGCCCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTGGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT < 1:1420605/150‑1 GCGACCGCTCTTGCCCTTAGGCTGCACCTTCTGCGCTTCGACGAATTTACGCCGGACATGCGCCATGCACGCCAGTCGTTCAACGCCCGGCTGTAGCGCCAACGCGTTGTAACCGGCGTAATCATCGGTCATCACGTAACCGCGATAGC‑‑‑CC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/745467‑745617‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccACCAGCCGCGCGCAGGAGGTGCCGCTGCGC‑CTGCTGGAGGGCTATCGCGGTTACGTGATGACCGATGATTACGCCGGTTACAACGCGTTGGCGCTACAGCCGGGCGTTGAACGACTGGCGTGCATGGCGCATGTCCGGCGTAAATTCGT < NC_002947/745655‑745507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |