| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 745964 | NA (NA) | 5 (0.030) | 4/258 | NT | NA | coding (538/1533 nt) | PP_0637 | transposase |
| ? | NC_002947 | = 745974 | NA (NA) | coding (528/1533 nt) | PP_0637 | transposase | |||||
TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/745811‑745964‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAG < NC_002947/745974‑745827 TCAGGTTCAGCAGTGGCTGGAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCG > 2:4644288/1‑150TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCG > 1:4352024/1‑150TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCG > 2:4437192/1‑150TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCG > 1:2308136/1‑150TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCG > 1:724700/1‑150 CAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGC < 1:776067/150‑1 AGGTTCAGCAGTGGCTGATTGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCTGGGTTTGCCGGGGGATCTGGATACCTTGTGGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCC < 1:3362396/150‑1 AGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCC > 1:2515854/1‑150 AGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCAGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCC > 2:5076044/1‑150 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA > 1:4795966/1‑150 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 1:3603358/150‑1 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 1:5383643/150‑1 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA > 2:140612/1‑150 GGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCA < 2:4975188/150‑1 GTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG < 2:2590639/150‑1 GTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG < 1:5074606/150‑1 GTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG > 2:5443356/1‑150 GTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTACAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG < 1:1552853/150‑1 TGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATG < 2:4066880/150‑1 TTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTCTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTT < 2:1573797/150‑1 AGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCC < 1:1939514/63‑1 AGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCC > 2:1939514/1‑63 GCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACC < 1:1294242/77‑1 GCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACC > 2:1294242/1‑77 TTGGTGGTTAGCAACATCGCCAGCACGCTGGGACTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATC > 2:2239057/1‑150 GCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCCAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTT < 2:4582542/150‑1 GCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTT < 2:4703251/150‑1 GCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTT > 2:2515854/1‑150 GCCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCAAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTT > 2:309259/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTCTCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 2:3654944/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACCCTTTC > 2:5440871/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 1:878382/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 1:1576540/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 2:4790218/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC < 2:2271467/150‑1 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 2:4136304/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC > 2:3818580/1‑150 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTC < 2:4114309/150‑1 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGAT‑CCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCA > 2:3253240/1‑132 CCAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGAT‑CCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCA < 1:3253240/132‑1 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTaa > 1:673245/1‑148 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA < 2:4094899/150‑1 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA < 2:3915510/150‑1 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA < 1:4641263/150‑1 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA < 2:2991672/150‑1 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA < 1:1999416/150‑1 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA > 1:2999983/1‑150 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA > 1:3021341/1‑150 CAGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCA < 1:641579/150‑1 AGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAG > 1:2793487/1‑150 AGTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAG < 1:1478209/150‑1 TCAGGTTCAGCAGTGGCTGAAAGTGTTCGCTGCACTGGATGACCCAGCGGGCCAGGGTTTGCCGGGGGATCTCGATACCATGTCGGTTCAGCACCGTTTCGAAGCGGTGCAGCGGCAGGCCATCGACGTACTTGGTGGTTAGCAACATCGCCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/745811‑745964‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccagTCCCAGCGTGCTGGCGATGTTGCTAACCACCAAGTACGTCGATGGCCTGCCGCTGCACCGCTTCGAAACGGTGCTGAACCGACATGGTATCGAGATCCCCCGGCAAACCCTGGCCCGCTGGGTCATCCAGTGCAGCGAACACTTTCAG < NC_002947/745974‑745827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |