| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1149934 = | 91 (0.550) | 10 (0.070) | 8/244 | NT | 10.1% | intergenic (‑175/+82) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 1149995 = | 95 (0.630) | intergenic (‑236/+21) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase | |||||
TGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1150092‑1149934‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCG > NC_002947/1149995‑1150143 TGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTC > 2:4808626/1‑150 CCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCG < 1:3148288/150‑1 CTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG > 2:520519/1‑150 CTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG < 1:3619858/150‑1 CTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG < 1:3546446/150‑1 CTGGTATGACAACGAGTCGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG < 2:3063832/150‑1 GTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCA > 2:254591/1‑150 GTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCA > 2:3055638/1‑150 TATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAA > 2:4416518/1‑150 ATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAG < 2:2685274/150‑1 ATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAG < 2:2626392/150‑1 TGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCAGGGATCGCGCCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGT > 1:3029399/1‑150 CCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACC > 1:1632306/1‑150 CCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCCGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAG > 2:2283205/1‑150 CCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAG > 2:3321910/1‑150 AACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCA < 1:2259873/139‑1 AACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCA > 2:2259873/1‑139 GGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCA < 1:112131/91‑1 GGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCA > 2:112131/1‑91 ACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGG > 2:2972444/1‑150 ACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGG > 2:1775161/1‑150 GTGTTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTT < 1:2972444/150‑1 TTCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGC > 1:3724981/1‑150 TCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCA < 2:3724981/150‑1 GCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTTCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATC < 2:490595/150‑1 GCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATC > 2:5279179/1‑150 GCGGGCAAGCCCGCTCCCCCACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATC > 1:4632392/1‑150 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA > 2:5127173/1‑150 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA < 2:5286038/150‑1 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA < 2:3996036/150‑1 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA < 2:348348/150‑1 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA < 2:1129395/150‑1 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA < 1:1271183/150‑1 AAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGAT > 2:406958/1‑150 AAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGAT > 1:4686156/1‑150 AGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATC < 1:216227/150‑1 GGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTCTGGTTGGCATCGAAGATCG > 2:181075/1‑150 TGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1150092‑1149934‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCG > NC_002947/1149995‑1150143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |