New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_002947 | 2088727 = | NA (NA) | coding (877/1302 nt) | PP_1865 | transposase |
AGCCTGTTCAACACTTCGCTTGAGCAAGGCCAGAACGTTGTATGCCAGCACGGCAGTGGTGAATCCAAGCAAGGCGGCTCGCGGACTGCCGAGGGTTTCAATTTCACTTTCCAGAATTGCTTCCAACCGCTGGAACATCCCTTCAATGCTCCAGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2088852‑2088696 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccagcggTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGAA > NC_002947/2088727‑2088875 AGCCTGTTCAACACTTCGCTTGAGCAAGGCCAGAACGTTGTATGCCAGCACGGCAGTGGTGAATCCAAGCAAGGCGGCTCGCGGACTGCCGAGGGTTTCAATTTCACTTTCCAGAATTGCTTCCAACCGCTGGAACATCCCTTCAATGCT < 2:4286125/150‑1 GCCTGTTCAACACTTCGCTTGAGCAAGGCCAGAACGTTGTATGCCAGCACGGCAGTGGTGAATCCAAGCAAGGCGGCTCGCGGACTGCCGAGGGTTTCAATTTCACTTTCCAGAATTGCTTCCAACCGCTGGAACATCCCTTCAATGCTC < 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AGCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGAGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCG > 2:150999/1‑150 GCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGA < 2:3384375/150‑1 GCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGA > 1:2047704/1‑150 GCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGA > 1:2468877/1‑150 GCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGA < 1:5279624/150‑1 GCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGA < 2:3074549/150‑1 GCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGA > 2:5344094/1‑150 GCGGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGA < 1:5237030/150‑1 cGTTGGATGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCCAGA < 1:3701685/149‑1 GGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGA > 1:1008158/1‑150 GGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGA < 1:2171798/150‑1 GGTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGA < 1:891965/150‑1 GTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGAA > 2:4063728/1‑150 GTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGAA < 2:3001367/150‑1 GTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGAA < 1:3313502/150‑1 AGCCTGTTCAACACTTCGCTTGAGCAAGGCCAGAACGTTGTATGCCAGCACGGCAGTGGTGAATCCAAGCAAGGCGGCTCGCGGACTGCCGAGGGTTTCAATTTCACTTTCCAGAATTGCTTCCAACCGCTGGAACATCCCTTCAATGCTCCAGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2088852‑2088696 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccagcggTTGGAAGCAATTCTGGAAAGTGAAATTGAAACCCTCGGCAGTCCGCGAGCCGCCTTGCTTGGATTCACCACTGCCGTGCTGGCATACAACGTTCTGGCCTTGCTCAAGCGAAGTGTTGAACAGGCTCACCGCGATGCCTTGCCCGAGAA > NC_002947/2088727‑2088875 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |