New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CTGCTCCAGCATCACGTCCTGCACATACACCTTCCCGGCCTGATCGCGCGAGAACGCCAGGTCCAACCGTGCCAGGTCGCCGTTGTCCAGCCAAGCTTGCAGCTCATCGCCACACAGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCCGCAGGCGCAGGCTCAGGG > NC_002947/995214‑995512 | cTGCTCCAGCATCACGTCCTGCACATACACCTTCCCGGCCTGATCGCGCGAGAACGCCAGGTCCAACCGTGCCAGGTCGCCGTTGTCCAGCCAAGCTTGCAGCTCATCGCCACACAGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAAcag > 2:1653194/1‑150 (MQ=255) cttggcttgggctctggctggctgactgaatacctgccaatgaatggcaccctgagcctgcgcctgcggcgtaacagtggcttccatctgcctgaggctgctgcgccgatgatcctgatcggcaacggcactggcctggcgggccttcGc < 2:1397352‑M1/2‑1 (MQ=255) ttggcttgggctctggctggctgactgaatacctgccaatgaatggcaccctgagcctgcgcctgcggcgtaacagtggcttccatctgcctgaggctgctgcgccgatgatcctgatcggcaacggcactggcctggcgggccttcGCa > 1:1063003‑M1/148‑150 (MQ=255) 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cacaGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGa < 1:1768032/150‑1 (MQ=255) acaGCATGTCTTGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGTCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGAt < 1:3433740/150‑1 (MQ=255) acaGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCAt < 2:3164124/63‑1 (MQ=255) acaGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCAt > 1:3164124/1‑63 (MQ=255) acaGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGAt > 2:163783/1‑150 (MQ=255) acaGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGAt > 2:559205/1‑150 (MQ=255) caGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATg < 2:3781519/150‑1 (MQ=255) caGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATg < 2:4861637/150‑1 (MQ=255) cAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCTTTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGaa < 1:1150184/150‑1 (MQ=255) cAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACa < 2:3907093/77‑1 (MQ=255) cAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGaa < 1:801282/150‑1 (MQ=255) cAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGaa > 1:648720/1‑150 (MQ=255) cgcCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGtt < 2:5116692/150‑1 (MQ=255) cgcCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGtt < 1:4840337/150‑1 (MQ=255) gcCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTa > 1:3056981/1‑150 (MQ=255) ccGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTAcg > 1:3781847/1‑150 (MQ=255) tACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCcgca < 1:3860602/150‑1 (MQ=255) tCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCcgcaggcgc > 2:3296620/1‑150 (MQ=255) cACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCcgcaggcgca < 1:1652584/150‑1 (MQ=255) cACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCcgcaggcgca < 2:5326518/150‑1 (MQ=255) aCCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCcgcaggcgcag > 1:349369/1‑150 (MQ=255) ctGCAGCCATTTGCGCTTCTCACGGGCTTTGACCGGGGCGCGCAAGAGGCTGCTAAGGCCCGCCAGTCCAGTGCCTTTGCCGATCAGTATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCCGCAGGCGCAGGCTCAg > 1:2337357‑M1/3‑150 (MQ=255) agcagcCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCCGCAGGCGCAGGCTCAgg < 2:1523302/150‑1 (MQ=255) agcagcCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCCGCAGGCGCAGGCTCAgg < 2:2564400/150‑1 (MQ=255) GCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCCGCAGGCGCAGGCTCAggg < 1:2202850‑M1/150‑1 (MQ=255) | CTGCTCCAGCATCACGTCCTGCACATACACCTTCCCGGCCTGATCGCGCGAGAACGCCAGGTCCAACCGTGCCAGGTCGCCGTTGTCCAGCCAAGCTTGCAGCTCATCGCCACACAGCAAGTCATGCGCCCGATTACGCTCACCGAACAGCAGCCAGTTGCGCTGCTCACCGGCATTGACCCGGGCGCGCAACAGGCTGCGAAGGCCCGCCAGGCCAGTGCCGTTGCCGATCAGGATCATCGGCGCAGCAGCCTCAGGCAGATGGAAGCCACTGTTACGCCGCAGGCGCAGGCTCAGGG > NC_002947/995214‑995512 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |