| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 1025363 = | 74 (0.560) | intergenic (‑214/+15) | opdP/dppA‑II | glycine‑glutamate dipeptide porin/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1025121‑1025418 | gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑g < 1:4856305/150‑1 (MQ=255)gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑g > 1:1761894/1‑150 (MQ=255)gCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑g < 1:5431078/150‑1 (MQ=255) 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2:4290185/150‑1 (MQ=255) ccGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGcc > 2:1723984/1‑115 (MQ=255) ccGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCaa > 2:3603056/1‑150 (MQ=255) ccGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCaa > 2:3602853/1‑150 (MQ=255) ccGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCCCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATaaa > 2:2479882/1‑150 (MQ=255) cGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTAGGGCGCAGTGTGCGAACCGGTCGAGAAACTGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGGGACTGGCTAACGCATAATAAac > 1:2606914/1‑150 (MQ=37) gggCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTAGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTAGAGATACTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATAAaca > 2:1188623/1‑150 (MQ=255) gacAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCGCCGGTAGGGCGCCGTGTCCGCACCGGGCGAGATCCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCCGCGGCCGGGACTGGCTAACGCGTAATCAacac > 2:3715258/3‑150 (MQ=37) aaTCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTcaca < 2:3119846/150‑1 (MQ=255) aaTCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTcaca < 2:3119749/150‑1 (MQ=255) tgtgTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCCCGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCGGTCCACAACCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATc < 2:1761894/150‑1 (MQ=38) ttGGCGGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGCCCGCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGTTCCTTTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTTACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTg < 2:5279331/150‑1 (MQ=38) ttGGCCGTTCG‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCGGGTCCCTCCGGGTGGGCGCAGTGTCCGACCCTGTCGAGTTCCTGTGGGTGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTACCGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTg < 2:5279427/150‑1 (MQ=38) ggCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAAc < 1:5395941/60‑1 (MQ=255) ggCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATcc < 2:1776521/72‑1 (MQ=255) gCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCCGGTCGGGCGCTTTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTgcgc < 2:666231/150‑1 (MQ=255) | GCCAGTGCGGTCAAGGTGAATACTTTCAAGGTTAAAGCTCCCTTTCTTTTCTAGTTATGGCCGGCCTTGTGGGCCGGGTGATTGCTGCGGTGTTGCCAGGGGTGCCGCGGGATCGCCGGGCAGAATCGGGGCGTTGTGTTGGCCGTTCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCTCAGGTAGGGCGCAGTGTCCGAACCTGTCGAGATCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTACTGGCTAACGCTTAATCAACACTCACACCGGAAAAATCATTGCGCCCAAACG > NC_002947/1025121‑1025418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |