| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1821774 | NA (NA) | 19 (0.160) +TCAGGGCCATTGGGGCTGCTGTGCAGCCCATCGCGACACA |
4/188 | NT | 20.1% | intergenic (+73/‑293) | PP_1624/PP_mr22 | group II intron‑encoding maturase/PrrB_RsmZ ncRNA |
| ? | NC_002947 | = 2073199 | 108 (0.660) | intergenic (+186/+41) | PP_1846/PP_1847 | group II intron‑encoding maturase/TonB‑dependent ferric siderophore receptor | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
AAGAAACTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTCCATGCA > NC_002947/1821630‑1821920 | aaGAAACTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTgaa < 1:4743544/150‑1 (MQ=11)aaGAAACTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTgaa > 1:4215395/1‑150 (MQ=11)aaGAAACTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTgaa < 1:5049684/150‑1 (MQ=11)aaGAAACTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTgaa > 2:3055033/1‑150 (MQ=11) aaaCTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTgaagaa > 1:1551925/1‑150 (MQ=32) cTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGaaaaa < 2:919882/150‑1 (MQ=35) tgtgGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAAc < 1:2904154/150‑1 (MQ=35) tgGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCa < 1:5251912/150‑1 (MQ=38) ggACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGt > 1:384542/1‑150 (MQ=39) ggACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGt > 2:4303275/1‑150 (MQ=39) ggACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGt > 2:4302891/1‑150 (MQ=39) ggACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGt > 2:4898564/1‑150 (MQ=39) gACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGtt > 2:4579273/1‑150 (MQ=40) cGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTcc > 2:1311092/1‑150 (MQ=255) cGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTcc < 2:635152/150‑1 (MQ=255) cTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGtt > 1:2765040/1‑150 (MQ=255) gTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGcc > 1:3369114/1‑150 (MQ=255) tctcGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCg > 1:4087189/1‑150 (MQ=255) tctcGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCg > 2:2350984/1‑150 (MQ=255) 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2:2732348/1‑150 (MQ=255) tgtgAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTc < 1:3292925/150‑1 (MQ=255) tgtgAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTc < 1:3939407/150‑1 (MQ=255) gAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGtt > 1:3245126/1‑150 (MQ=255) gAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGtt < 2:3290681/150‑1 (MQ=255) aTCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTtgt > 2:4111119/1‑150 (MQ=255) aTCCGCCTCCTACTAGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATTGCGCCCAGACTCTGCCTGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACAGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTtgt < 1:3250311/150‑1 (MQ=255) tCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTtgtg > 2:2072564/1‑150 (MQ=255) cGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTa > 1:4541814/1‑150 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTaa > 1:1123768/1‑150 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTaa < 2:315025/150‑1 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTaa < 1:4940311/150‑1 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTaa < 1:4833282/150‑1 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTaa > 1:3598132/1‑150 (MQ=255) gCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTaa > 1:1498521/1‑150 (MQ=255) cctcctACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAg > 1:1293468/1‑150 (MQ=255) ctccgACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGc < 2:494952/150‑1 (MQ=255) ctACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCttt < 1:156791/150‑1 (MQ=255) ctACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCttt < 2:967585/150‑1 (MQ=255) tACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTc > 1:791814/1‑150 (MQ=255) aCTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTcc < 2:3564459/150‑1 (MQ=255) aCTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTcc > 2:4653651/1‑150 (MQ=255) cTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTCCa < 2:1649719/150‑1 (MQ=255) tCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGt < 1:2607904/104‑1 (MQ=255) tCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTCCAt > 1:4732046/1‑150 (MQ=255) aTTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTCCATGCa > 1:4136927/1‑150 (MQ=255) | AAGAAACTGTGGGACCGGCTCGGGCTGGTCTCGATACTGGATACGATTAACCGGCTTAGCCGCGTAACCTGAACCGCCGTGTACGGAACCGTACGCACGGTGGTGTGAGAGGACGGCGGGTGTGAATCCGCCTCCTACTCGATTTGTGAAGAAAAACCAGTTTCCCCTCCGGTTGCCGGGGCGCATGGCGCCCAGACTCTGCCAGGCAAGGCACAATCAAATGTGTACCGCGCTACCCCAGTAACATCGCGTGTAAGCCTTTGCTTACTCGTTGTGTAAGCTTTCCATGCA > NC_002947/1821630‑1821920 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |