| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1838113 = | 163 (0.990) | 12 (0.080) | 10/248 | NT | 7.5% | intergenic (+18/+86) | PP_1642/PP_1643 | hypothetical protein/membrane protein |
| ? | NC_002947 | 1838195 = | 144 (0.950) | intergenic (+100/+4) | PP_1642/PP_1643 | hypothetical protein/membrane protein | |||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GTGATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGCCCG > NC_002947/1837964‑1838262 | gTGATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCAt > 2:1392785/1‑150 (MQ=255) gATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTc > 1:2781503/1‑150 (MQ=255) tCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTcgc < 1:5395278/150‑1 (MQ=255) tgctggcggcgttcgacccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttTTcgcg < 2:1846114‑M1/6‑1 (MQ=255) cGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTcgcg > 1:876115/1‑150 (MQ=255) cGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTcgcg > 1:5077822/1‑150 (MQ=255) gctggcggcgttcgacccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttTTCGCgg > 1:1178579‑M1/144‑150 (MQ=255) gctggcggcgttcgacccggcgcgggcggtattcggctggcttgaagtgctggtgagcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttTTCGCgg > 1:503844‑M1/144‑150 (MQ=255) gACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCgg < 1:4295096/150‑1 (MQ=255) aaGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCa > 2:2010344/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCa > 1:3296105/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCa > 1:4507826/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCa > 1:570673/1‑150 (MQ=255) gcagcCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCCGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATg > 2:4364005/1‑150 (MQ=255) gcCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGccc < 2:4974166/150‑1 (MQ=255) ccAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCg > 2:5447581/1‑150 (MQ=255) ccAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCg > 2:2049122/1‑150 (MQ=255) cAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGc > 2:3125875/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCt < 2:323317/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCt > 2:3286653/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCt > 2:260934/1‑150 (MQ=255) aCCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGcga < 2:4485663/150‑3 (MQ=255) cagccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTccc > 2:1762739/1‑150 (MQ=255) gccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCcac < 1:4025472/150‑1 (MQ=255) ccagcGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca > 2:2949264/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgca < 1:2010344/150‑1 (MQ=255) cTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcac < 2:4576913/150‑1 (MQ=255) gCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgc > 1:3608369/1‑150 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgcac > 1:1866548/1‑150 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgcac > 1:4252752/1‑150 (MQ=255) tctGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCGTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgcac > 2:3968988/1‑150 (MQ=255) tGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACtt > 1:3698139/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTGGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTaa > 2:4216462/1‑150 (MQ=255) gcagGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCt < 2:3913045/150‑1 (MQ=255) gcagGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCt > 1:2149084/1‑150 (MQ=255) cagGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtg > 2:3466915/1‑150 (MQ=255) agGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgca < 1:4846203/138‑1 (MQ=255) agGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATcgcaccgca > 2:4846203/1‑138 (MQ=255) agGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgt < 2:4789517/150‑1 (MQ=255) agGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgt > 1:1252976/1‑150 (MQ=255) agGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgt < 2:3066154/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgtg < 2:2771107/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgtg < 1:4208728/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgtg < 2:570673/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCtgtg > 1:1100161/1‑150 (MQ=255) ttCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGt > 2:838047/1‑150 (MQ=255) agcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCtgtg > 1:3249609‑M1/89‑150 (MQ=255) agcctggggctgttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCtgtg > 1:1965208‑M1/89‑150 (MQ=255) gTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACCCCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTgg < 2:1951858/150‑1 (MQ=255) gTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTgg < 1:1392785/150‑1 (MQ=255) tGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCgg > 1:1242453/1‑150 (MQ=255) gCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCggg < 2:876115/150‑1 (MQ=255) agagagCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCg > 1:4688153/1‑150 (MQ=255) gagagCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGt > 1:2088922/1‑150 (MQ=255) ttcattgccgggctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTg > 1:4622624‑M1/77‑150 (MQ=255) gcgggcggCCGCTGTGCCAGTGGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTTCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGccc < 1:1776763/150‑1 (MQ=255) ctactgtacgtgcgctggaagttccagcatgagcggcgcatggcgggcgaaggcagttagatttTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTgg < 2:1825977‑M1/63‑1 (MQ=255) gtgCGAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCATCCTTTGTGCGTTGTGTTGCTCCATGTCGCGGGCATGCCCGCTCGCACAGTAATGGCACCGCACTTAAGGCGGGTGCAGTACGTGTGGTAGGGGGCGTGCCCGCGAAAATTCTaa < 2:3337476/150‑1 (MQ=255) tgCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAAc > 1:5085788/1‑150 (MQ=255) gCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACt > 1:2799537/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGc < 2:3420559/132‑1 (MQ=255) ccAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGc > 1:3420559/1‑132 (MQ=255) cAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGc > 1:710706/1‑150 (MQ=255) cAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGc < 1:2179092/150‑1 (MQ=255) aGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGcc < 2:1641200/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTcg > 1:65986/1‑150 (MQ=255) gATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTcgcccgcc < 2:3698139/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATgc < 1:5404439/150‑1 (MQ=255) ggCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATgcgc < 2:5032797/150‑1 (MQ=255) gcACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGcgccgc < 2:1256156/150‑1 (MQ=255) acacCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTgg > 1:1827044/1‑97 (MQ=255) acacCGTCAACCATGGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTATGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTc < 1:3382818/150‑1 (MQ=255) acCGTCAACCATTTAGCCTTGTTTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCAt < 1:1114029/150‑1 (MQ=255) acCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCAt > 2:3266358/1‑150 (MQ=255) cGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGc > 1:5121719/1‑97 (MQ=255) gTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCt > 1:885373/1‑150 (MQ=255) gTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCt < 2:4359047/150‑1 (MQ=255) aCCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGaa < 2:2714303/150‑1 (MQ=255) aCCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGaa < 2:2714355/150‑1 (MQ=255) aTTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCAATTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCAAGCTGGAACtt > 1:4009865/1‑150 (MQ=255) ttGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTc < 1:838047/150‑1 (MQ=255) ttGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTc < 1:3094326/150‑1 (MQ=255) tGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTcc > 1:716017/1‑150 (MQ=255) gAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCa < 2:531239/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAgcg > 1:2998614/1‑150 (MQ=255) gtTGCTCCCTTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCCCCGCACTTAAGGCCGGTGCAGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTa < 1:260934/150‑1 (MQ=255) gtTGCTCCCATTCGGGGGCAGGCCCGCTCCCACAGTAACCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCTCGTa < 1:2416440/150‑1 (MQ=255) gcgcccATGCGCGGGCAGGCCCGCCCCCCCAGAAATCCCCCCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAg < 1:2758476/147‑1 (MQ=38) cTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGt < 1:3183840/150‑1 (MQ=255) tCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCAGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCGCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGtc > 1:2220099/1‑149 (MQ=255) ccATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCTCGTACAGTAGc > 2:1169916/1‑150 (MQ=255) ccATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACa < 2:4156892/145‑1 (MQ=255) ccATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACa > 1:4156892/1‑145 (MQ=255) ccATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGc > 1:1812437/1‑150 (MQ=255) cATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGcc < 2:1019826/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGccc > 1:4918774/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCa > 1:3471807/1‑132 (MQ=255) aTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGccc > 1:3837735/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGccc > 2:2381571/1‑150 (MQ=255) TTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGCCCg > 2:5113563‑M1/1‑150 (MQ=255) | GTGATCGACAAGCAGCCAACCAGCCAGCGCGACCTGGCTCTGGTGCAGCAGGCGTTCAACCAGTGGCATGCAGAGAGCGGGCGGCCGCTGTGCCAGTTGTCGGTGATGCTGGCGCACACCGTCAACCATTGAGCCTTGTGTTGCTCCCATTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGTAATCGCACCGCACTTAAGGCCTGTGCAGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAAATCTAACTGCCTTCGCCCGCCATGCGCCGCTCATGCTGGAACTTCCAGCGCACGTACAGTAGCCCG > NC_002947/1837964‑1838262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |