| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1970763 = | 83 (0.500) | 16 (0.110) | 9/228 | NT | 15.8% | intergenic (+14/‑252) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region |
| ? | NC_002947 | 1970865 = | 100 (0.710) | intergenic (+116/‑150) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region | |||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCA > NC_002947/1970615‑1970912 | tcaatgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgc < 2:2505179‑M1/1‑1 (MQ=255)tcaatgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgc < 2:3557679‑M1/1‑1 (MQ=255) tCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CAC < 2:2567523‑M1/150‑1 (MQ=255) aatgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCAc < 2:1931229‑M1/3‑1 (MQ=255) atgagttgtgccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCAcc < 1:1289700‑M1/4‑1 (MQ=255) aGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGG > 2:1760662‑M1/1‑150 (MQ=255) ttgtgccatggatctgagcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCct < 2:3238668‑M1/9‑1 (MQ=255) gtTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTC > 1:4494613‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCT > 1:3390878‑M1/1‑150 (MQ=255) gccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTc > 1:4218132‑M1/138‑150 (MQ=255) ccatggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcg < 1:196825‑M1/14‑1 (MQ=255) aCCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGC > 1:732036‑M1/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGC > 1:5274579‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCG > 1:2515416‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCG > 2:3966079‑M1/1‑150 (MQ=255) cccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCG > 2:301111‑M1/1‑150 (MQ=255) catggatctgcgcaatgaaggccgccgtgatgggcggtcttggaaactgccggatgttatcacaaacgcgggggcggtggggagaggtggcagttggtctcagccgcgcttgaaacctggtttttgtattgcctgCACCGGCCTCTTcgc > 2:5228707‑M1/136‑150 (MQ=255) ccGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGG < 2:3440998‑M1/150‑1 (MQ=255) 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ctgcCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagcccgcgaag < 2:3136373‑M1/150‑74 (MQ=255) tgcCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagcccgcgaaga < 1:5146382‑M1/150‑75 (MQ=255) tgcCAAGCTGGCGCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaaga > 2:3190498‑M2/1‑138 (MQ=255) cAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagaggc > 2:732036‑M2/1‑135 (MQ=255) ggCTCAGGTGGTTTGCCGCACGCGCCTGCAGTGTTTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGGGGGTTTGCCGGCGCCCACTGGGATAGGGACGGGCATTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGTGc < 2:538338/150‑1 (MQ=255) cTCAGGTGTTTTGCCGCAAGCGCCTGCAATTATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTGGGGGGCTTGCCCGCTCCCCCTGGTATTTCGCTTGGCCTTCGGGCGGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAg < 2:1955284/150‑1 (MQ=37) tCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgg < 2:1871862‑M1/123‑60 (MQ=255) tCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgg > 1:1871862‑M1/1‑64 (MQ=255) tCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGGACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGGAGAGGCCGGTGCAgg > 1:2256408/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATa > 2:595141/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATa < 2:3981502/150‑1 (MQ=255) tGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACTGGGATATAGCAATGGCGTAGGGGCGTGGTGTACCGGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGCAGAGGCCGGTGGAGGCaaga > 1:541396/1‑148 (MQ=37) gTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTGGCGGGCGTGCCCCCGCCCCCAGGGCGATAGCCAGGCCGTATGGCCGTGGGGGAACAGGGGGGGCGGGCGGGCCCCCGACGAGGCCCGTGCAGGCaaaggg > 1:2936588/1‑146 (MQ=255) tGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACaaaa < 2:196932/150‑1 (MQ=255) gCCGCACGCGCCTGCACTGATTTTGTAGCGCCT‑CACCGGCCTCTGCGGGGGCTGGCCCGCTCCCCCGGGGATAGCGCCGGGCCTTCGGGCCGTGGTGACCCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACaaaaa < 2:1080582/150‑1 (MQ=37) cgcggttgaaacctggtttttgttgcgcctcC‑CGGGCCTCGTCGCGGGCGTGCCGGCTCCCCCTGGGATATCGCAGGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGGGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCa > 2:3033355‑M1/32‑150 (MQ=255) cAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg > 2:388771/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCCGGCACTGATTTTGCACCGCCT‑CACCGGCCTCTCCGCGGGCTTGCCCGCCCCCACGGGGATATCGCAGGGCCTTAGGGCCGTGGTGACCCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg < 2:269121/150‑1 (MQ=38) cggCACTGTTTTGGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATAGCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCaa < 2:1652586/148‑1 (MQ=255) cttttttttGTATCGCCC‑CCCCGGCCTCTCCGGGGGCTGGCCCGCCCCCCCGGGTATATCGCCTGGCATTTGGGCGGTGGTGAACGTGTGGGGGCGGGCGACCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAgcgc < 1:301111/145‑1 (MQ=255) aCTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGTCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAgcgc > 2:1980254/1‑150 (MQ=255) tGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagc > 1:1388697‑M1/1‑36 (MQ=255) gATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGc > 2:4386165/1‑150 (MQ=255) ttGTAGCGCCG‑CACCGGCCTCTGCGCGGGCTGGCCCGCTCCCCCGGGGATATCGCCGGGCCTTAGGGCCGTGGTGACCCGGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTgag < 2:3401038/150‑1 (MQ=255) tGTAGCCCCT‑CCCGGGCCTGTGGGGGGGCTGGCCCGCTCCCAGGGGTATATCGCTGGGCCTGTGGGCCGTGGTTAACCGGGGGGGGCGGGCGCGCCCGCGACGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTgaga < 1:5211078/150‑1 (MQ=255) CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCa > 2:3014343‑M1/1‑150 (MQ=255) | GTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCCA > NC_002947/1970615‑1970912 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |